烟草SAUR基因家族的全基因组鉴定

SAUR(Small auxin-up RNA)是生长素早期响应基因。基于烟草基因组数据,对NtSAUR进行鉴定以及染色体定位、保守基序、保守结构域、基因结构、启动子顺式作用元件分析、系统发育树构建和共线性分析。结果表明,在烟草基因组中共鉴定出64个基因,大部分为碱性蛋白和亲水性蛋白,这些基因不均匀的分布在21条染色体上;系统进化分析显示,烟草SAUR基因分布在三个族群上,各族群基因数量不等;从基因的启动子顺式作用元件中鉴定到有IAA、ABA、GA、JA、SA及干旱、低温等信号响应的顺式作用元件。研究结果为进一步研究烟草SAUR基因的功能和逆境胁迫响应机制提供了依据。