miRNA与LncRNA相互作用在骨关节炎中的作用

非编码RNA(ncRNA)包括微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(LncRNA)、核内小RNA(snRNA)、转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)、piwi互作RNA(piRNA)、核仁小RNA(snoRNA)等。ncRNA被转录后不被翻译成蛋白质,在RNA水平发挥其生物学功能,其中LncRNA在转录水平、转录后水平及表观遗传学水平调控基因表达。miRNA通过与靶mRNA的3’UTR互补配对,在转录后水平发挥生物学功能。越来越多的研究表明,LncRNA与miRNA相互作用在疾病进展中起至关重要的作用。该文主要对骨关节炎中LncRNA对miRNA的调控机制进行综述。

DNA聚合酶δ催化亚基基因在三阴性乳腺癌组织中的表达及其与预后的关系研究

目的观察三阴性乳腺癌组织与对应癌旁组织中DNA聚合酶δ催化亚基基因(POLD1)的表达及其与预后的相关性。方法采用荧光定量PCR及免疫组织化学的方法检测110例三阴性乳腺癌患者癌组织标本及其对应的癌旁正常组织标本中POLD1蛋白的表达情况。分析POLD1蛋白的差异表达与患者临床病理特征及与预后的关系。结果110例癌组织中POLD1表达阳性81例(73.6%),阴性29例(26.4%)。癌旁组织中,POLD1表达阳性24例(21.8%),阴性86例(78.2%)。POLD1在癌组织中表达阳性率明显高于癌旁正常组织(χ^2=59.195,P<0.001)。POLD1的表达与组织学分级、TNM分期和淋巴结转移有关(P=0.002、0.010和0.018),与年龄、肿瘤大小、Ki-67标记指数、p53和表皮生长因子受体表达等无关。采用Kaplan-Meier法分析总生存期和无进展生存期,POLD1高表达组患者的无进展生存期明显短于POLD1低表达组(P=0.038),总生存期与POLD1低表达组比较差异无统计学意义(P>0.05)。Cox回归分析结果显示,POLD1表达、TNM分期、淋巴结转移是影响三阴性乳腺癌患者无进展生存期的独立危险因素(风险比=0.380,95%置信区间:0.147~0.985;风险比=4.816,95%置信区间:1.856~12.496;风险比=2.810,95%置信区间:1.435~5.506;均P<0.05)。结论POLD1蛋白的高表达提示三阴性乳腺癌较差的临床预后。

免疫疗法在三阴性乳腺癌治疗中的应用研究进展

三阴性乳腺癌(TNBC)由于缺乏雌激素受体、孕激素受体和人表皮生长因子受体2的表达,常规治疗效果欠佳。免疫疗法是一种通过增强机体对抗癌症的天然防御能力来治疗癌症的方法。TNBC的免疫疗法方案包括免疫检查点抑制剂(抗程序性死亡受体-1/程序性死亡配体-1抗体、抗细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4抗体、抗CD47抗体)、肿瘤疫苗(肿瘤坏死因子相关的凋亡诱导配体受体2疫苗、树突状细胞疫苗、多价肽疫苗)、T细胞(肿瘤浸润淋巴细胞、细胞因子诱导的杀伤细胞、嵌合抗原受体T细胞)、溶瘤病毒(T-Vec、CF189)等,可提高TNBC患者的生存率和预后,提高免疫特异性和免疫记忆能力,为TNBC的治疗提供一个新的契机。

MiR-103a-3p与miR-107:骨关节炎进展过程中的潜在生物标志物

目的探讨OA发病机制中潜在的Hub基因、关键miRNAs、生物过程及相关信号通路,为OA的发病机制及治疗提供生物信息学依据。方法从基因表达综合数据库(GEO)下载OA滑膜组织样本的表达谱芯片,鉴定差异表达基因DEGs,并进行功能富集分析。构建蛋白-蛋白相互作用网络(PPI),STRING和Cytoscape进行模块分析,进一步鉴定Hub基因,并对Hub基因进行更深一步的miRNAs挖掘。结果最终鉴定出与OA进展相关的9个Hub基因[细胞因子信号转导抑制因子(SOCS)3、转导素重复序列包含蛋白(BTRC)、F-框蛋白32(FBXO32)、KLHL22、UBE3A、HUWE1、UBR4、ANAPC5、TRIM50]和2个关键miRNAs(hsa-miR-103a-3P、hsa-miR-107),可能是OA发病机制中的潜在生物标志物。信号转导、RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录正调控和蛋白丝氨酸/苏氨酸酶活性与OA的发病机制具有一定的相关性。此外,分析结果表明cAMP信号通路和Rap1信号通路也参与了OA的进展。结论潜在生物学分子、生物过程及相关通路对于OA的病因研究及治疗研究具有重要的指导意义。

生物信息学分析方法探讨类风湿关节炎患者滑膜病变中的免疫细胞浸润

目的探索RA滑膜病变中的免疫浸润细胞,为RA的机制及治疗研究提供新的研究方向及治疗靶点。方法从基因表达综合数据库(GEO)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)下载GSE77298、GSE55457和GSE1919三个基因表达数据集,Perl进行数据合并,R的"limma"进行批次矫正。在R中用"CIBERSORT"软件通过"e1071""parallel"和"preprocessCore"3个包获得22种免疫细胞对应RA滑膜组织样本和正常滑膜组织样本的表达矩阵。Perl筛选免疫细胞矩阵中P<0.05的样本。R的"barplot"函数分析22种免疫细胞在P<0.05的样本中的含量百分比。R的"pheatmap"包可视化热图,R的"corrplot"包绘制相关性热图。R的"vioplot"包通过wilcox检验绘制差异小提琴图。结果免疫细胞浸润分析结果表明,在P<0.05的RA滑膜组织样本和正常滑膜组织样本中,初始B细胞和未活化的自然杀伤细胞在RA滑膜组织中低表达,浆细胞、未活化的肥大细胞、M1巨噬细胞、记忆性B细胞和调节性T细胞在RA滑膜组织中高表达。研究还发现在同一样本中,活化的自然杀伤细胞与中性粒细胞的相关系数(r=0.91)最高,呈正相关,两者具有协同效应。在同一样本中,M0巨噬细胞和浆细胞的相关系数(r=-0.88)最低,呈负相关,两者具有拮抗作用。结论本研究发现的RA滑膜病变中的免疫浸润细胞为RA的机制研究及治疗研究提供了一定的理论依据和研究方向。