菠萝SPL基因家族全基因组鉴定及其在开花诱导中的表达分析

SQUAMOSA promoter binding-like (SPL)转录因子在植物成花转变和花发育过程中起着重要的调控作用。本研究通过生物信息学方法从菠萝全基因组中共鉴定出16个AcSPL基因,分布于12条染色体上。系统发育分析表明菠萝SPL基因家族可分为5个亚组,相对于双子叶植物拟南芥而言,菠萝的进化关系更接近于单子叶植物(水稻)。基因结构和基序分析发现菠萝SPL基因家族具有相对保守的基因结构和功能结构域。组织特异性表达分析结果显示,8个AcSPLs的最高表达量均出现在花芽中,6个AcSPLs在雌蕊中的表达量高于雄,1个AcSPL在萼片中的表达量最高,表明多数AcSPL基因与菠萝花芽分化及花发育密切相关。AcSPL成员在花芽转录组中的表达结果也暗示SPL家族的不同成员参与乙烯诱导菠萝开花的不同阶段。本研究为菠萝SPL家族重要基因的克隆提供了参考,并为深入了解菠萝SPL基因在成花中的功能提供数据依据。