限定域关系抽取技术研究综述

限定域关系抽取技术是在预定义实体类型和关系类型的前提下,从文本中捕获关键信息的技术,多采用由头尾实体和关系构成的三元组作为信息表示形式。作为信息抽取领域的重要研究方向之一,其在知识问答、信息检索等任务中被广泛应用。文中在介绍相关概念和任务范式的基础上,分析了深度学习背景下限定域关系抽取任务的研究进展,根据句中实体是否可见,分为关系分类任务和三元组抽取任务,依据任务表现特征,前者可细分为有监督条件下的关系分类任务、小样本关系分类任务和远程监督条件下的关系分类任务。文中探讨和分析了以上任务中常用的技术方法及其优缺点,最后归纳总结了关系抽取技术在低资源、多模态等更为接近真实情景下的发展潜力和现存的挑战。

非洲猪瘟病毒D1133 L蛋白单克隆抗体抑制其复制

旨在探究非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)D1133L单克隆抗体对病毒复制的调控效应。在制备了ASFV D1133L单克隆抗体的基础上,将ASFV和不同浓度的单克隆抗体同时接种于PAMs,通过红细胞吸附试验(HAD 50)、实时荧光定量PCR(RT-qPCR)、蛋白质印迹(Western blot)和荧光观察分析D1133L单克隆抗体对病毒复制的影响。结果显示:不同浓度的单克隆抗体在不同的感染时间对ASFV的病毒效价(P<0.01),蛋白表达水平,基因转录水平(P<0.01),ASFV-GFP绿色荧光蛋白的表达水平(P<0.05)均有显著抑制,且这种抑制作用具有剂量依赖性。综上所述,D1133L单克隆抗体可显著抑制ASFV的复制,试验结果在ASFV药物靶点的选择上具有一定的参考意义。

Gabor小波幅值和相位特征人脸识别方法比较

对采用Gabor幅值、Gabor相位以及Gabor幅值加相位结合这三种方法,在同等条件基础上对所提取的特征进行分块,用PCA降维,采用最近邻分类规则进行识别并比较结果。在ORL、Yale、Indian、YaleBE、PIE和FERET六个数据库进行比较研究的结果表明,Gabor小波相位特征对光照有较高的鲁棒性,在光照变化明显的Yale和YaleBE数据库识别效果最好,而Gabor小波幅值加相位特征具有表情和时间变化的鲁棒性,在FERET的fb、dup1、dup2测试集上获得了较高的识别率。

重组HSP65-6P277乳酸乳球菌疫苗对链脲佐菌素诱导的1型糖尿病小鼠的降糖作用

探讨表达HSP65-6P277蛋白的乳酸乳球菌活载体疫苗对链脲佐菌素(STZ)诱导的1型糖尿病小鼠的降糖作用及可能的作用机制。采用多次小剂量腹腔注射STZ建立1型糖尿病模型。将诱导型表达菌株Lactococcus lactis NZ9000pCYT∶HSP65-6P277和组成型表达菌株L.lactis NZ9000 pHJ∶HSP65-6P277及无关蛋白对照菌株L.lactis NZ9000 pCYT∶Nuc灌胃1型糖尿病小鼠(2×109CFU,200μL),每天灌胃1次,连续7 d,之后每周灌胃1次,持续16周。每月从小鼠眼眶静脉丛取血1次,血糖检测仪检测STZ造模小鼠血糖水平并称体重。4个月后将小鼠处死,取小鼠脾脏做脾细胞增殖实验,采用ELISA试剂盒分别检测脾细胞上清液中的IL-10和IFN-γ细胞因子水平以及血清IgG抗体水平。结果显示,与对照组相比,pCYT∶HSP65-6P277组和pHJ∶HSP65-6P277组可以一定程度上降低STZ造模小鼠血糖水平(P<0.05),并能维持其正常体重稳定,降低脾细胞针对HSP65和P277的增殖(P<0.05),脾细胞上清液中IFN-γ细胞因子水平明显降低(P<0.05),血清IgG抗体水平无明显差异(P>0.05)。

基于四元数小波变换的医学图像边缘检测

医学图像的边缘检测可以使医生更准确清晰地获得有用信息,区分病灶部位便于疾病的诊断。为了能够准确获得医学图像边缘,并且抑制医学图像产生过程中的噪声和伪影,本文提出一种新的医学图像边缘检测算法,利用四元数小波变换的本质二维属性,从水平、垂直和对角子带对医学图像进行分解和重构,最终选择合适阈值显示出图像的边缘。实验结果表明,本文提出的方法较传统的边缘检测算子效果有明显的提高,通过边缘检测评价显示本文算法具有精确的医学图像边缘定位检测能力和抗噪声伪影特性。

虚实结合的疫苗工程综合性实验教学模式探索

疫苗工程是一门实践性和应用性很强的课程,其实践教学对于专业人才的培养尤为重要。传统疫苗的研制和生产由于要使用病原微生物,对于实验设施、仪器设备和实验材料的要求极其严苛。受限于这些不利因素,疫苗工程的实践教学难以开展,无法满足生物制药专业人才的培养需求。本教学团队利用虚拟仿真技术开展疫苗工程综合性实验教学,打破了传统实验的各种限制,让学生在虚拟实验室中高效、安全地进行实验。同时本着“能实不虚”的原则,穿插简单的线下实体实验,做到“虚中有实、虚实结合”。文章介绍以疫苗的生产与检定为技术背景开发的虚拟仿真实验教学软件,阐述其教学设计、实施流程以及教学成效,以期为生物制药综合性实践教学改革提供新思路。

生物医学工程专业创新设计与实践课程建设

为进一步加强和完善生物医学工程专业创新设计与实践教学平台的建立,形成与专业核心课程体系紧密相连的实践教学环节,针对医用电子仪器和医学图像处理两门专业课程的实践教学课程建设进行探索,设置多元化的教学环节,最大限度利用实验室现有资源,对学生开放使用以培养学生创新思维和专业技能,经过在一届本科生中的应用,教学效果明显,更为学生毕业时能够成为具有较强知识更新能力和创新意识的生物医学与工程科学相结合的应用型人才奠定坚实基础。

人脸边缘表示与估计的识别方法研究

人脸识别研究是利用计算机对人物身份的鉴别。为了探究人脸边缘特征表达方法,克服人脸识别受光照,时间和衰老等影响的难题,本文提出一种基于Wedgelet和四元数小波变换(QWT)的二维边缘特征表示与估计的人脸识别方法。本文提出的方法在标准1996 FERET数据库上得到很好的识别效果,其中Fc,DupI和DupII子集都高于其他方法,具有较低的计算复杂度和较高的计算精度。

基于改进型Canny算子的虹膜图像外边缘检测

基于使用传统Canny算子检测虹膜图像后,部分图像抛物线和圆的检测出现细节不完整等问题,提出一种基于自适应动态阈值的算子。将整幅图像分割为若干个子区域,令子图像之间有一定区域的重叠,然后依据非极大值抑制之后的输出结果自适应地选取每个子图像的高、低两个阈值。为了验证改进算法的有效性,因而对CASIAI虹膜数据库进行实验并对结果进行分析,得出改进Canny算法相比传统Canny算子不仅计算复杂度有所降低,而且能够更好地检测边缘信息。

非洲猪瘟病毒解旋酶D1133L基因序列分析、蛋白结构预测及亚细胞定位

旨在通过预测分析和亚细胞定位研究非洲猪瘟病毒(ASFV)D1133L基因结构、亚细胞定位与功能间的关系。作者使用Mega6.0软件绘制了7株不同基因型的D1133L解旋酶和ASFV编码的其他5个解旋酶基因的系统进化树,使用EXPASY、PRABI和SWISS-MODEL软件预测了该基因所编码蛋白序列的二、三级结构;根据GenBank公布的ASFV序列(LR743116.1),合成D1133L基因并构建其重组真核表达质粒pCMV-D1133L,蛋白免疫印迹(Western blot,WB)验证该基因表达后,将重组质粒转染至PK-15细胞,应用间接免疫荧光试验(indirect immunofluorescence assay,IFA)研究了该蛋白的亚细胞定位。结果表明,通过ASFV解旋酶的基因系统进化树,发现5种解旋酶基因均相对保守。D1133L基因全长3402 bp,表达的蛋白为124.63 ku,G+C含量为6.1%,A+T含量为10.6%;二级结构分析表明α螺旋占48.90%,扩展链占13.50%,无规卷曲为33.27%;三级结构分析表明六自由度结构(six degree of freedom,QMQE)为0.20,覆盖率84%,且预测以α螺旋为主的高级结构;通过LOCSVMPSI分析预测,显示D1133L蛋白定位于细胞核内与细胞质内的概率是相同的。WB结果显示pCMV-D1133L质粒正常表达,IFA试验证明ASFV编码的解旋酶D1133L同时分布于细胞核和细胞质。本研究通过对D1133L基因序列、结构功能预测,并通过IFA验证了D1133L亚细胞分布,为进一步揭示D1133L基因功能奠定了一定基础。

灵芝孢子粉总三萜的提取优化及其体外生物活性

对灵芝孢子粉总三萜的提取过程进行优化,以得率为指标,通过单因素试验、Plackett-Burman试验筛选出影响灵芝孢子粉总三萜得率的显著因素,利用响应面设计优化灵芝孢子粉总三萜的提取条件。对于提取出的灵芝孢子粉总三萜,评价其清除1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(DPPH)自由基和ABTS^+自由基的方法,并采用CCK-8比色法就其抗人肝癌细胞HepG-2增殖的活性进行研究。结果表明,最佳提取条件为乙醇体积分数80%,固液比1∶23,超声功率540 W,提取温度40℃,提取时间60 min。此优化条件下提取的灵芝孢子粉总三萜具有较好的抗氧化能力,清除ABTS^+的能力强于清除DPPH,对人肝癌细胞HepG-2亦具有一定的抑制作用。

ASFV解旋酶D1133L蛋白表达和抗体检测方法的建立及初步应用

为了建立快速检测非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)的血清学方法,本研究原核表达了ASFV的D1133L重组蛋白,并以其为包被抗原,通过反应条件优化,建立了一种快速检测ASFV的间接ELISA方法,并采用该方法检测了ASFV感染猪后D1133L的抗体应答情况。结果显示:成功表达纯化了D1133L蛋白,以此为抗原建立了ELISA抗体检测方法,该方法特异性高,灵敏性强,其检测结果与市售试剂盒检测结果的符合率达100%。家猪在感染ASFV后,针对D1133L的抗体在第5天可被检测到,在第7天抗体水平达到顶峰。

1株兔肺源金黄色葡萄球菌的分离鉴定及耐药分析

为了解四川某养兔场疑似金黄色葡萄球菌感染病例的病原菌及其药物敏感性,采集兔肺脏的化脓灶样品进行细菌分离纯化、染色镜检、培养特性、生化试验、16S rDNA序列鉴定及分离菌株的药敏试验和耐药基因检测。结果表明,分离鉴定出1株对小鼠具有致病性的金黄色葡萄球菌,药敏试验结果显示,金黄色葡萄球菌分离菌株具有多重耐药性,仅对头孢哌酮、头孢拉定、头孢噻吩、哌拉西林4种药物敏感,其他15种药物均耐受。耐药基因PCR检测结果显示,meca、aac(6′)/aph(2′)、aph(3′)-III、ant(4′,4′′)、plw043耐药基因呈阳性,耐药表型和基因型相一致。

虚拟仿真技术在抗体工程实验教学中的应用——以PD-1人源化抗体制备为例

随着国内外新兴市场和新技术市场对生物技术药物的需求迅速增长,传统抗体工程实践教学已无法满足高校对生物、医药类专业建设的需求,而虚拟仿真技术成为传统实践教学的有益补充。根据抗体工程实验教学现状,文章首先讨论了虚拟仿真技术在抗体工程实验教学中应用的必要性;其次重点阐述采用虚拟仿真技术将PD-1人源化抗体制备的实际生产案例引入到抗体工程实验教学的内容设计和应用实践中;最后分析了抗体工程虚拟仿真实验教学的应用成效。抗体工程虚拟仿真实验教学平台在抗体工程实验中的应用是抗体技术知识更新、抗体工程实验教学的新模式,具有一定的示范意义。

非洲猪瘟病毒MGF 360-9L基因序列分析、蛋白结构预测及亚细胞定位

前期研究结果表明,非洲猪瘟病毒(ASFV)MGF 360-9L能显著抑制宿主天然免疫应答,故通过比较、分析ASFV中MGF 360基因序列,进一步研究MGF 360-9L基因结构和功能间的关系。本研究采用生物信息学方法,分析该基因的一级结构并预测该基因的表达蛋白二、三级结构;根据GenBank公布的Georgia 2007/1(FR682468.1)序列,合成MGF 360-9L基因并构建其重组真核表达质粒,Western blot验证该基因表达后,将重组质粒转染至PK-15细胞,经染色后观察其蛋白的亚细胞定位。结果表明,以Ⅱ型Georgia 2007/1基因组中MGF 360-9L基因为参照,其在Ⅱ型ASFV毒株中高度保守,在54株不同基因型毒株间的相似性与ASFV系统进化关系一致,保守序列为3′末端378 bp片段,高级结构以α螺旋为主,核定位序列预测其定位于细胞核内;构建真核表达质粒,成功表达目的蛋白且定位于细胞核内。本研究结果为进一步研究MGF 360-9L基因抑制免疫应答和明确MGF 360基因家族在ASFV的致病机制积累了资料。

PK-15细胞的TPL2基因敲除有利于口蹄疫病毒和塞内卡病毒复制

旨在构建TPL2(MAP3K8/COT)基因敲除PK-15细胞系PK-15-TPL2^-/-,评估该基因敲除前后对口蹄疫病毒(FMDV)和塞内卡病毒(SVA)复制的影响及产生影响的原因,为研究TPL2在病毒感染过程中的作用机制提供良好的生物材料,也为疫苗生产过程中进一步提升FMDV和SVA产量指明方向。筛选2条针对TPL2基因的单向导RNA(sg RNA),合成sg RNA并将其插入到含有GFP标签的慢病毒表达载体,构建sg RNA/Cas9慢病毒表达质粒,包装慢病毒并感染PK-15细胞,通过流式细胞仪分选出已被转入sg RNA的单细胞。通过测序确认细胞系中TPL2的DNA序列,通过蛋白质印迹(Western blot)方法检测细胞系中TPL2表达情况。使用FMDV和SVA感染构建好的细胞系,利用IFA、RT-qPCR、Western blot和TCID50评估FMDV和SVA在PK-15-TPL2^-/-细胞中的复制水平,在此基础上通过测定干扰素(IFN)和IFN刺激基因(ISG)的mRNA表达水平,研究了FMDV或SVA感染的PK-15-TPL2^-/-细胞中干扰素途径的激活状态。TPL2基因敲除PK-15细胞系中TPL2基因发生了碱基插入突变和碱基缺失突变,构建的细胞系中均未检测到TPL2蛋白质表达。测定并比较了FMDV和SVA感染的PK-15和PK-15-TPL2^-/-细胞中病毒含量,表明TPL2基因敲除显著促进了FMDV和SVA的复制。同时,RT-qPCR进一步表明与FMDV和SVA感染期间的PK-15细胞相比,PK-15-TPL2^-/-细胞中IFN-α、IFN-β、IFN-γ、ISG15、ISG54和ISG56的mRNA表达明显降低。综上所述,本研究成功构建了TPL2基因敲除的PK-15细胞系,与对照细胞相比,TPL2基因的敲除更利于FMDV和SVA的复制,这可能与IFN-α、IFN-β、IFN-γ、ISG15、ISG54和ISG56表达的抑制有关。本研究提示CRISPR/Cas9基因编辑技术可以作为在动物和疫苗开发过程中编辑细胞系以提高病毒产量的有效工具,本结果为进一步提升FMDV和SVA产量指明了方向,也为研究TPL2在病毒感染过程中的作用机制提供了良好的生物材料。

猪源组织蛋白酶S抑制O型口蹄疫病毒在PK-15细胞复制

前期研究数据表明组织蛋白酶S(cathepsin S,CTSS)在猪初乳中表达水平显著高于常乳,且CTSS有抑制病毒复制的作用,本研究旨在探究猪源CTSS对O型口蹄疫病毒(foot-and-mouth disease virus serotype O,FMDV-O)复制及对FMDV诱导的抗病毒细胞因子的影响。FMDV-O感染PK-15细胞,利用RT-qPCR和Western blot分别在转录和翻译水平探究FMDV-O感染对内源性CTSS表达的影响;使用CTSS活性检测试剂盒测定FMDV-O感染对CTSS酶活性的影响;根据GenBank公布的 CTSS 基因序列(XM_021089893.1)构建CTSS真核表达质粒,利用脂质体方法转染PK-15细胞,通过Western blot检测CTSS表达情况,并在此基础上通过Western blot和RT-qPCR检测过表达CTSS对FMDV-O复制及FMDV-O诱导的抗病毒细胞因子mRNA水平的影响;进一步针对CTSS设计合成3对特异性siRNA,利用Western blot和RT-qPCR检测CTSS和FMDV-O的变化。结果表明,FMDV-O感染PK-15细胞能显著上调猪源CTSS表达并增强CTSS酶活性;过表达CTSS能抑制FMDV-O在 PK-15 细胞中复制,这种抑制作用可能是通过促进FMDV-O诱导的抗病毒细胞因子产生而发挥功能的;干扰序列siRNA-2947下调内源性CTSS表达进而促进FMDV-O的复制。猪源CTSS促进宿主抗病毒细胞因子产生可能是抑制FMDV-O复制的原因之一,本研究为深入探究宿主CTSS在抗FMDV天然免疫应答中的作用及机制提供依据。

浅析人工智能医学影像应用的现实与挑战

人工智能是未来的发展方向,医学与人工智能的结合可谓是最有发展前景的领域,是造福人类的重要举措。当下的人工智能主要在医学的影像方面发挥作用,主要有深度学习和图像识别两种应用,在肿瘤检查、肿瘤诊断等多个内容中展现出了强大功效,在人工智能医学影像显现出强大优势的同时,挑战也随之而来。本文我们针对人工智能医学影像应用的现实与挑战进行详细阐述,进一步加深对人工智能医学影像的了解,希望能对人工智能医学影像发展做出积极影响。

应收账款管理浅谈

企业把赊销作为一种促销的手段,形成应收账款后,如管理不当使应收账款不能及时收回,会影响企业正常的生产经营活动。加强应收账款管理的方法主要有:(一)对购货方信用管理的调查;(二)与购货方签订正规合同;(三)合理采用现金折扣政策;(四)加强内部审计的监督作用;(五)建立应收账款坏账准备制度;(六)不断完善收账政策;(七)进行应收账款核对。

青钱柳的生物活性成分及其药用价值

青钱柳(Cyclocarya paliurus(Batal)Iljinskaja)为中国独有的一种双子叶植物。青钱柳中活性成分种类多样,目前分离得到的有多糖、黄酮、三萜类及一些无机元素等。此外,已有研究证明青钱柳有降血糖、降血脂、降血压及防治心脑血管疾病等疗效。同时,《中国中药志要》记载:其叶能清热消肿、生津止渴同时能治疗顽癣。对青钱柳的生物活性成分及其药用价值进行了综述。