广西猕猴中发现GⅡ.17型诺如病毒及其全基因组序列分析

目的 了解广西省龙虎山猕猴粪便标本中的GⅡ.17型诺如病毒的流行情况、基因结构和进化特征.方法 2015年3月～8月收集400份野生猕猴粪便标本,利用建立好的HISEQ高通量测序技术在粪便标本中发现了GⅡ.17型诺如病毒,命名为GX213.采用反转录-聚合酶链反应（Reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR）技术对其进行了序列鉴定、全长扩增和检测研究,并对三个开放阅读框（Open reading frames,ORFs）进行了序列和遗传进化分析.结果 筛查结果显示阳性率为0.5％ （2/400）.诺如病毒GX213毒株基因组全长为7 565 bp（包括PloyA尾）,其基因组分为三个ORFs：ORF1（10～5112nt）、ORF2（5093 ～ 6715 nt）和ORF3（6715 ～ 7494nt）,其中ORF1与ORF2之间重叠20 bp,ORF2和ORF3之间重叠1 bp.GX213病毒株全基因组序列分析显示,其与引起2014年至2015年亚洲部分地区暴发的新型人GⅡ.17型诺如病毒变异株CUHK-NS-613（GenBank ID：KU561248）同源性最高（同源性最高为99.5％）.ORF1和ORF3区核苷酸和氨基酸序列都与CUHK-NS-613同源性最高（分别为99.5％,99.4％;99.5％,99.2％）.ORF2区分析序列发现其与CUHK-NS-491毒株（GenBank ID：KP698928）同源性最高,核苷酸和氨基酸同源性分别为99.4％和99.8％,仅P1.1区发现了一个氨基酸的突变aa245P→S.另外,RdRp核苷酸和VP1氨基酸序列进化树分析显示该病毒株与人GⅡ.17型诺如病毒CUHK-NS-613和CUHK-NS-491的进化关系最近,而与首次被发现的猴GⅡ.17型诺如病毒KM1509（GenBank ID：KX356908）次之.结论 本研究发现的GX213属于2014年至2015年在亚洲地区引起暴发的新型人GⅡ.17型诺如病毒变异株,提示GⅡ.17型诺如病毒为人猕猴共患病毒.

云南蝙蝠携带新型汉坦病毒及其基因组分析

目的探索云南地区蝙蝠携带的新型汉坦病毒。方法本研究于2016年7～8月在云南普洱地区采集到84只蝙蝠，利用病毒宏基因组学分析蝙蝠携带病毒种类，采用巢式或半巢式PCR鉴定汉坦病毒。采用MegAlign进行同源性分析，使用MEGA6.0进行序列比对及系统进化分析。结果本研究在小蹄蝠体内发现了1株汉坦病毒，命名为DodeHV，阳性标本均为小蹄蝠，通过PCR筛查发现在小蹄蝠中阳性率为5.97%（4/67）。本实验获得了DodeHV S节段完整编码区序列和L节段的全部序列，以及M节段的部分序列。序列分析发现DodeHV与2013年在越南富寿省发现的XSV-VN1982B4毒株同源性最高，S、M、L节段的核苷酸序列相似度分别为79.0%、79.2%和79.9%，对应的氨基酸序列相似度分别为93.4%、94.8%和96.6%。系统进化分析也显示它们的进化关系最近。结论本研究在云南小蹄蝠体内发现了1株新的汉坦病毒DodeHV，进一步丰富了我国的蝙蝠病毒库，同时也提示我国边境地区蝙蝠携带该病毒传播的风险，具有一定的公共卫生学意义。