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低氧胁迫下中华绒螯蟹血淋巴细胞的转录组学
被引量:
2
1
作者
候利波
陆银月
+4 位作者
任秋霖
孔祥会
朱雷
顾伟
孟庆国
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期25-39,共15页
为了探究低氧胁迫对中华绒螯蟹血淋巴细胞影响的分子机制,实验通过使用Nova Seq 6000测序技术,检测了低氧组(1.5±0.5)mg/L和对照组(6.0±0.5)mg/L分别处理24 h后的中华绒螯蟹血淋巴细胞的转录组数据变化。首先,对测序得到的原...
为了探究低氧胁迫对中华绒螯蟹血淋巴细胞影响的分子机制,实验通过使用Nova Seq 6000测序技术,检测了低氧组(1.5±0.5)mg/L和对照组(6.0±0.5)mg/L分别处理24 h后的中华绒螯蟹血淋巴细胞的转录组数据变化。首先,对测序得到的原始数据进行拼接、注释以及筛选,分析获得的128614个转录本和128614条基因,平均长度为2634 bp(N50),Q30>92%。其次,以1.2倍为阈值,共筛选出1687个差异表达基因,其中上调基因899个,下调基因788个。GO和KEGG分析发现,低氧胁迫对中华绒螯蟹血细胞的三羧酸循环、糖酵解途径、ECM-受体相互作用、间隙连接、细胞凋亡、酚氧化酶系统以及其他免疫相关基因等产生了显著影响。最后,随机挑选转录组数据中的10个基因进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证,结果显示与转录组数据分析相一致,其中包括6个上调的基因:整合素1、铜/锌超氧化物歧化酶、磷酸肌醇3激酶、磷酸甘油酸突变酶2、PDGF/VEGF相关因子1和relish;4个下调的基因:无脊椎连接蛋白7、热休克蛋白90、线粒体ATP合成酶α和天冬氨酸转氨酶。本研究初步阐明了中华绒螯蟹血淋巴细胞短时间内应对低氧胁迫的分子机制,同时该结果也可为今后研究其他甲壳动物在应对低氧胁迫时的生理机制和分子机制提供参考。
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关键词
中华绒螯蟹
血淋巴细胞
低氧胁迫
转录组分析
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职称材料
克氏原螯虾Rab5、Rab6蛋白及其抗体对血淋巴细胞吞噬活性的影响
2
作者
朱雷
赵彤
+3 位作者
王欣茹
蒋昕彧
候利波
孔祥会
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期1285-1292,共8页
为研究克氏原螯虾(Procambarus clarkii)Rab5(PcRab5)和Rab6(PcRab6)的生物学功能,利用同源重组技术构建了克氏原螯虾pET-B2m-PcRab5和pET-B2m-PcRab6原核表达载体,并进行了诱导表达和多克隆抗体的制备,采用ELISA和Western Blot技术检...
为研究克氏原螯虾(Procambarus clarkii)Rab5(PcRab5)和Rab6(PcRab6)的生物学功能,利用同源重组技术构建了克氏原螯虾pET-B2m-PcRab5和pET-B2m-PcRab6原核表达载体,并进行了诱导表达和多克隆抗体的制备,采用ELISA和Western Blot技术检测了抗体效价和特异性。将PcRab5和PcRab6的原核表达蛋白和多克隆抗体注射到健康克氏原螯虾体内,研究了其对血淋巴细胞吞噬活性的影响。实验结果表明构建的pETB2m-PcRab5和pET-B2m-PcRab6原核表达载体经诱导后可表达目的蛋白,分子量均为67 kD,纯化后蛋白条带单一,纯度较高。重组表达纯化后的PcRab5和PcRab6蛋白免疫日本大耳兔分别获得效价为1:2048 K和1:512 K的兔抗血清,制备的抗体可分别特异性识别PcRab5和PcRab6蛋白。将PcRab5和PcRab6蛋白注射健康克氏原螯虾后,其血淋巴细胞中可吞噬荧光微球的细胞比例分别显著上升至38%和30%(P<0.01)。而将纯化的PcRab5和PcRab6多克隆抗体分别注射至螯虾体内后,其血淋巴细胞的吞噬细胞比例均出现显著下降(P<0.05),PcRab5和PcRab6蛋白参与了血淋巴细胞吞噬功能。实验为进一步研究克氏原螯虾PcRab5和PcRab6分子功能奠定基础,也可为理解甲壳动物Rab5和Rab6在血淋巴细胞吞噬功能中的作用提供帮助。
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关键词
RAB蛋白
同源重组
蛋白表达
抗体制备
血淋巴细胞
吞噬活性
克氏原螯虾
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职称材料
题名
低氧胁迫下中华绒螯蟹血淋巴细胞的转录组学
被引量:
2
1
作者
候利波
陆银月
任秋霖
孔祥会
朱雷
顾伟
孟庆国
机构
河南师范大学水产学院
南京师范大学海洋科学与工程学院
出处
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期25-39,共15页
基金
国家重点研发计划(2018YFD0900602)
国家自然科学基金(31870168)
+1 种基金
江苏现代农业产业技术体系专项[JATS(2020)303]
河南省自然科学基金(212300410175)。
文摘
为了探究低氧胁迫对中华绒螯蟹血淋巴细胞影响的分子机制,实验通过使用Nova Seq 6000测序技术,检测了低氧组(1.5±0.5)mg/L和对照组(6.0±0.5)mg/L分别处理24 h后的中华绒螯蟹血淋巴细胞的转录组数据变化。首先,对测序得到的原始数据进行拼接、注释以及筛选,分析获得的128614个转录本和128614条基因,平均长度为2634 bp(N50),Q30>92%。其次,以1.2倍为阈值,共筛选出1687个差异表达基因,其中上调基因899个,下调基因788个。GO和KEGG分析发现,低氧胁迫对中华绒螯蟹血细胞的三羧酸循环、糖酵解途径、ECM-受体相互作用、间隙连接、细胞凋亡、酚氧化酶系统以及其他免疫相关基因等产生了显著影响。最后,随机挑选转录组数据中的10个基因进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证,结果显示与转录组数据分析相一致,其中包括6个上调的基因:整合素1、铜/锌超氧化物歧化酶、磷酸肌醇3激酶、磷酸甘油酸突变酶2、PDGF/VEGF相关因子1和relish;4个下调的基因:无脊椎连接蛋白7、热休克蛋白90、线粒体ATP合成酶α和天冬氨酸转氨酶。本研究初步阐明了中华绒螯蟹血淋巴细胞短时间内应对低氧胁迫的分子机制,同时该结果也可为今后研究其他甲壳动物在应对低氧胁迫时的生理机制和分子机制提供参考。
关键词
中华绒螯蟹
血淋巴细胞
低氧胁迫
转录组分析
Keywords
Eriocheir sinensis
hemocytes
hypoxia
transcriptome
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
克氏原螯虾Rab5、Rab6蛋白及其抗体对血淋巴细胞吞噬活性的影响
2
作者
朱雷
赵彤
王欣茹
蒋昕彧
候利波
孔祥会
机构
河南师范大学水产学院
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期1285-1292,共8页
基金
河南省自然科学基金(212300410177)
河南省重点科技攻关项目(212102110107)资助。
文摘
为研究克氏原螯虾(Procambarus clarkii)Rab5(PcRab5)和Rab6(PcRab6)的生物学功能,利用同源重组技术构建了克氏原螯虾pET-B2m-PcRab5和pET-B2m-PcRab6原核表达载体,并进行了诱导表达和多克隆抗体的制备,采用ELISA和Western Blot技术检测了抗体效价和特异性。将PcRab5和PcRab6的原核表达蛋白和多克隆抗体注射到健康克氏原螯虾体内,研究了其对血淋巴细胞吞噬活性的影响。实验结果表明构建的pETB2m-PcRab5和pET-B2m-PcRab6原核表达载体经诱导后可表达目的蛋白,分子量均为67 kD,纯化后蛋白条带单一,纯度较高。重组表达纯化后的PcRab5和PcRab6蛋白免疫日本大耳兔分别获得效价为1:2048 K和1:512 K的兔抗血清,制备的抗体可分别特异性识别PcRab5和PcRab6蛋白。将PcRab5和PcRab6蛋白注射健康克氏原螯虾后,其血淋巴细胞中可吞噬荧光微球的细胞比例分别显著上升至38%和30%(P<0.01)。而将纯化的PcRab5和PcRab6多克隆抗体分别注射至螯虾体内后,其血淋巴细胞的吞噬细胞比例均出现显著下降(P<0.05),PcRab5和PcRab6蛋白参与了血淋巴细胞吞噬功能。实验为进一步研究克氏原螯虾PcRab5和PcRab6分子功能奠定基础,也可为理解甲壳动物Rab5和Rab6在血淋巴细胞吞噬功能中的作用提供帮助。
关键词
RAB蛋白
同源重组
蛋白表达
抗体制备
血淋巴细胞
吞噬活性
克氏原螯虾
Keywords
Rab
Homologous recombination
Protein expression
Antibody preparation
Haemoctyes
Phagocytosis activity
Procambarus clarkii
分类号
S963.7 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
低氧胁迫下中华绒螯蟹血淋巴细胞的转录组学
候利波
陆银月
任秋霖
孔祥会
朱雷
顾伟
孟庆国
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
下载PDF
职称材料
2
克氏原螯虾Rab5、Rab6蛋白及其抗体对血淋巴细胞吞噬活性的影响
朱雷
赵彤
王欣茹
蒋昕彧
候利波
孔祥会
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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职称材料
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