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莱茵衣藻响应缺硫的环状RNA的预测与鉴定
1
作者
候恺玥
娄素琳
+2 位作者
曾志勇
胡章立
李辉
《深圳大学学报(理工版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期221-223,共3页
环状核糖核酸(circular ribonucleic acid,circular RNA或circRNA)是一类无5′帽子结构及3′poly A尾,以共价键连接形成闭合环形结构的非编码RNA分子,通过转录后调控的方式参与动植物细胞的众多代谢途径.莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhar...
环状核糖核酸(circular ribonucleic acid,circular RNA或circRNA)是一类无5′帽子结构及3′poly A尾,以共价键连接形成闭合环形结构的非编码RNA分子,通过转录后调控的方式参与动植物细胞的众多代谢途径.莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii,C.reinhardtii)是一种重要的真核单细胞模式微藻,为探究其是否存在环状RNA,本研究通过RNA-Seq高通量测序分析正常与缺硫培养的C.reinhardtii RNA组学数据,首次预测获得218条环状RNA序列,通过对比缺硫处理前后莱茵衣藻环状RNA序列,获得8条差异表达的环状RNA序列(其中,5条为表达上调、3条为表达下调).本研究首次对单细胞真核微藻莱茵衣藻进行环状RNA的生物信息学预测,确认莱茵衣藻环状RNA响应缺硫胁迫,为下一步揭示莱茵衣藻环状RNA参与响应莱茵衣藻缺硫的作用机制奠定基础.
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关键词
分子生物学
真核微藻
莱茵衣藻
非编码核糖核酸
环状核糖核酸
缺硫
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职称材料
题名
莱茵衣藻响应缺硫的环状RNA的预测与鉴定
1
作者
候恺玥
娄素琳
曾志勇
胡章立
李辉
机构
广东省植物表观遗传学重点实验室
深圳市海洋藻类生物工程技术研究中心
出处
《深圳大学学报(理工版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期221-223,共3页
基金
国家重点研发计划资助项目(2018YFA0902500)
国家自然科学基金资助项目(31800300,31970366,31870343)
广东省自然科学基金资助项目(2018A030310445,2018A030313507)。
文摘
环状核糖核酸(circular ribonucleic acid,circular RNA或circRNA)是一类无5′帽子结构及3′poly A尾,以共价键连接形成闭合环形结构的非编码RNA分子,通过转录后调控的方式参与动植物细胞的众多代谢途径.莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii,C.reinhardtii)是一种重要的真核单细胞模式微藻,为探究其是否存在环状RNA,本研究通过RNA-Seq高通量测序分析正常与缺硫培养的C.reinhardtii RNA组学数据,首次预测获得218条环状RNA序列,通过对比缺硫处理前后莱茵衣藻环状RNA序列,获得8条差异表达的环状RNA序列(其中,5条为表达上调、3条为表达下调).本研究首次对单细胞真核微藻莱茵衣藻进行环状RNA的生物信息学预测,确认莱茵衣藻环状RNA响应缺硫胁迫,为下一步揭示莱茵衣藻环状RNA参与响应莱茵衣藻缺硫的作用机制奠定基础.
关键词
分子生物学
真核微藻
莱茵衣藻
非编码核糖核酸
环状核糖核酸
缺硫
Keywords
molecular biology
eukaryotic microalga
Chlamydomonas reinhardtii(C.reinhardtii)
non-coding RNA
circular RNA(circRNA)
sulfur deprivation
分类号
Q173 [生物学—水生生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
莱茵衣藻响应缺硫的环状RNA的预测与鉴定
候恺玥
娄素琳
曾志勇
胡章立
李辉
《深圳大学学报(理工版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
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