生物信息学教学中学生创新能力培养探讨

生物信息学是一门新兴的交叉学科,其理论和方法不断更新,有助于培养学生的创新能力。结合生物信息学教学实践,从教学团队、教学内容、学生主体作用、实践教学、考核方式等方面,对学生创新能力的培养进行了探索。

企业一套表和联网直报的现状及优化方案

文章分析了统计"四大工程"建设中的"企业一套表"和"联网直报系统"的现状、存在的问题,并提出了相应的优化方案。

中国进口贸易关系持续时间及其影响因素的经验分析

根据2000～2006年海关进口贸易数据,运用Kaplan-Meier曲线和Cox比例风险模型考察中国公司与各贸易伙伴进口贸易关系持续时间及其影响因素。分析发现:(1)从"公司—产品"微观层面上看,中国进口贸易关系持续时间短,中国进口贸易关系是在动态中不断调整的:在大量贸易关系结束的同时,又不断地形成新的贸易关系。(2)语言、人均GDP、GDP、产品交易额和初始交易额等因素对于进口贸易关系持续时间的影响为正,距离因素对于进口贸易关系持续时间的影响为负。

基于物理化学性质优化的蛋白质相互作用预测研究

蛋白质相互作用预测是生物信息学研究的重要问题之一.提出了一种基于物理化学性质优化的蛋白质相互作用预测方法,与现有方法的显著不同就是,并未使用已知的氨基酸残基的物理化学性质,而是通过粒子群算法优化得到有益于相互作用预测的物理化学性质数值.对真实的数据集测试表明,优化得到的物理化学性质比现有的物理化学性质更有益于提高蛋白质相互作用的预测性能,与其它方法相比,也具有一定的优势,说明该方法是一种有效的蛋白质相互作用预测方法.

基于贝叶斯网络和相互作用可信度的蛋白质功能预测方法

蛋白质功能注释是后基因组时代研究的核心内容之一，基于蛋白质相互作用网络的蛋白质功能预测方法越来越受到研究者们的关注。提出了一种基于贝叶斯网络和蛋白质相互作用可信度的蛋白质功能预测方法。该方法在功能预测过程中为待注释的蛋白质建立贝叶斯网络预测模型，并充分考虑了蛋白质相互作用的可信度问题。在构建的芽殖酵母数据集上的三重交叉验证测试表明，在功能预测过程中考虑蛋白质可信度能够有效地提高功能预测的性能。与现有一些算法相比，该方法能够给出令人满意的预测效果。

公正观念与分配公正

文章在住户调查数据的基础上,对居民关于收入分配的公平感及其与主客观因素之间的关联性进行了描述。结论显示,对不同收入来源的公平性评价与总体收入分配公平感之间通常具有较强的关联性;而这些公平性评价与个人年龄、教育程度以及收入水平之间也存在着较强的关联性。从总体收入分配公平性评价的回归分析中可推论,总体收入分配公平感较低可能源于实际收入决定机制与人们公正观念之间的背离。

基于局部支持向量机的蛋白质相互作用的预测方法

针对蛋白质相互作用的预测问题,我们提出了一种基于局部支持向量机的预测方法。该方法充分考虑了蛋白质相互作用数据的局部相似性特征,提出在待测样本附近构建支持向量机模型。对两个真实的蛋白质相互作用数据集H.pylori和Human的测试表明。

基因表达芯片探针选择的一种有效方法

为了减少基因表达芯片探针选择的计算量,采用最大共有序列准则大大减少了需要计算的候选探针数量,并通过不断扩大进行计算的探针数目保证探针选择的效果.结果表明该方法是十分有效的,探针选择的结果也是令人满意的.

经济转型中城镇居民受益均衡性的经验分析

基于1985～2012年城镇居民收入分组数据，分析了经济结构转换、投资增长以及经济开放程度的改变对于各收入组收入增长的不同效应，以及这一期间相应宏观经济变量对城镇居民收入增长均衡性的影响。结果表明：产业结构升级会拉大城镇居民收入差距，第三产业比重增加更有利于高收入人群收入提高；国内投资与利用外资、经济开放程度对城镇不同收入组收入增长都具有不同的影响。

基于K近邻的蛋白质功能的预测方法

蛋白质功能预测是后基因组时代研究的重要问题之一。利用蛋白质相互作用网络,提出了一种基于K近邻的蛋白质功能的注释方法,该方法首先计算待注释的蛋白质与所有已知功能的蛋白质间的注释环境相似度,选择其中最相似的K个蛋白质,将该K个蛋白质的功能注释进行加权平均,作为待注释的蛋白质最终的功能注释。在构建的芽殖酵母的两组大规模相互作用数据集上的测试表明,该方法能够有效的对蛋白质功能进行预测,在蛋白质功能预测性能上优于现有的一些方法。

医学院校生物信息学实践教学初探

生物信息学是一门新兴的交叉学科,在生命科学研究的诸多方面发挥着重要的作用,掌握生物信息学的基本理论和方法对医学院学生具有重要的意义。针对医学院校生物信息学教学现状,分析了生物信息学实践课的重要性和教学中存在的问题,对具体的教学实施进行了初步探讨,为生物信息学课程教学提供了参考。

市场化改革与收入分配变化──以劳动力的流动为例

从劳动力跨部门流动的角度,对市场化过程中的收入分配进行了初步的研究。劳动力跨部门流动模型表明,库兹涅茨倒U假说可能是成立的。在劳动力流动性不断增强的市场化改革过程中,早期收入分配的不均等程度可能会上升,一定时期后收入差距会逐步缩小。国家干预、市场化进程本身也可以成为调节收入分配的可能途径。

一种基于预测搜索的基因芯片优化方法

掩模板在高密度基因芯片的探针合成过程中起着重要的作用 ,由于其制造工艺复杂、造价较高 ,因此在不改变探针合成结果的条件下 ,需要尽可能的减少基因芯片探针合成过程中所用的掩模板数量。提出了一种新的预测搜索算法 ,对掩模板进行了优化设计 ,对设计结果的测试显示 ,其减少的掩模板数量超过了传统方法的 2 0 % 。

论中小企业美国上市的方式选择

国内很多中小企业试图通过海外上市获得资金支持,而美国资本市场反向收购由于其时间短、成本低、成功率高等特点,越来越受青睐。本文通过详细介绍美国资本市场反向收购的相关知识,以期为国内企业海外上市指明方向。

上市公司多个大股东并存时的监督与共谋行为博弈分析

本文通过构建多个大股东并存时的监督与共谋博弈模型,分析发现如果国有股减持后形成国有股、法人股和机构投资者等多个大股东并存的股权结构,在多个大股东并存且达到了混合策略均衡时,有利于上市公司价值的提高,并在一定程度上可以抑制大股东的侵害行为。

宏观经济对股票、国债和企业债券动态相关性的影响分析

文章首先计算了上证股指、债指和企指收益率的动态相关系数,并且通过编程绘制了三者动态相关曲线的结构断点图。通过图看到国债和企业债券指数收益率的动态相关系数存在结构突变点。通过这个结论能够通过调整企业债券和国债的投资比例,更好的规避风险。更有意义的是本文通过利用宏观经济变量作为工具变量对股市、国债、企债市场的动态相关系数做回归,显著性检验使得宏观经济变量的变化为资本市场收益率相关关系的变动提供了分析依据。

中国五大城市群R&D资本存量差异与分布特征

使用Dagum基尼系数、描述性统计等方法,研究中国五大城市群R&D资本存量差异与分布特征。结果显示:中国五大城市群R&D资本存量差异大,但呈缓慢下降趋势,差异主要来源于不同城市群之间;不同城市群内部以及不同城市群之间R&D资本存量差异大小及其演进趋势具有显著差异。R&D资本存量向五大城市群特别是长三角城市群以及粤港澳大湾区集聚。五大城市群内部R&D资本存量分布特点及演进趋势各不相同。鉴于此,揭示了中国五大城市群R&D资本存量差异与分布特征,从而为城市创新发展战略及政策制定提供理论依据。

利用蛋白质相互作用关系改善基因芯片缺失数据估计的精度

针对基因芯片数据缺失问题,利用蛋白质相互作用关系与基因表达的内在联系,提出了一种利用蛋白质相互作用信息提高基因芯片缺失数据估计精度的方法.将蛋白质间的相互作用关系与基因表达数据间的距离相结合来计算基因间的表达相似度,根据这个新的相似性度量标准为含有缺失数据的基因选择更为合适的用于估计缺失值的基因集合.将新的相似性度量标准与传统的KNNimpute、LLSimpute方法相结合,描述了对应的改进算法PPI-KNNimpute、PPI-LLSimpute.对真实的数据集测试表明,蛋白质相互作用信息能有效改善基因缺失数据估计的精度.

基于马尔可夫链的基因芯片特异性探针选择方法

对于基因表达芯片,特异性探针的选择是探针设计的重要环节,由于基因组序列数据量极大,不可能对每个候选探针都在全序列中进行特异性评价并进行取舍。对此问题,提出了一种采用马尔可夫链概率准则的探针特异性选择方法,即把基因组序列看作马尔可夫链,任何探针序列的互补序列作为它的一个子序列,都具有一定的出现概率,概率越小,越可能具有特异性。据此,选择其中概率最小的N个候选探针,能够大大减少进行特异性评价的探针数量,缩短探针设计的计算时间。对实际数据的测试结果表明,该方法选择的探针具有很高的特异性。