基因芯片在肺癌发生相关基因筛查中的应用

目的研究人肺癌发生相关基因表达谱,探讨肺癌发生的分子机制。方法选取1 280个与肿瘤相关的基因克隆,制备成肿瘤相关cDNA芯片。提取人肺癌组织以及相应正常组织RNA,反转录后标记为cDNA探针,与cDNA芯片杂交,经扫描及Q uan tarray3.0软件分析后比较两种组织中的差异表达基因。结果共筛查出差异表达基因52条。其中表达上调基因35条,下调基因17条;按照基因功能可分为运输载体、代谢相关基因、细胞信号转导分子、细胞骨架、转录调控因子以及未知功能基因。结论基因芯片可用于肺癌相关基因表达谱的筛查,为明确肺癌发生机制提供重要参考。

光周期对毕氏海蓬子(Salicornia bigelovii Torr.)开花的影响

对毕氏海蓬子分别进行了不同日照长度处理及不同光周期数的短日照处理 ,发现 :(1)毕氏海蓬子开花的临界日长为 15h ;(2 )在光照 8h/d处理条件下 ,毕氏海蓬子开花所需最少光周期数为 13;(3)经过 13～18个短日照 (8h光照 /d)光周期数处理 ,再移至长日照 (17h光照 /d)条件下 。

金水乌鸡白羽丝毛系选育报告

以白羽丝毛乌骨鸡为基础，经６年９个世代闭锁群继代选育培育出金水乌鸡白羽丝毛系。白羽丝毛系９０日龄体重１０５ｋｇ，料肉比３０６∶１。采用家系选育控制乌骨鸡就巢性，就巢鸡比例由６０３０％下降到２２５１％。

2017-2022年淄博市诺如病毒流行特征及病原学基因分析

目的分析2017-2022年淄博市诺如病毒感染性疫情流行特征及优势基因型,为诺如病毒感染防控提供科学依据。方法用描述性流行病学方法,对2017-2022年淄博市诺如病毒感染性疫情流行病学资料和实验室检测资料进行统计分析。结果2017-2022年淄博市共报告35起诺如病毒感染性疫情,其中托幼机构23起,中学7起,餐饮机构3起,小学和养老机构各1起,不同场所罹患率有统计学意义;报告发病917人,罹患率为8.30%,疫情总体呈上升趋势,年均增长率为10.76%;城市29起,农村6起,罹患率城市高于农村,差异有统计学意义;85.71%的诺如病毒感染性疫情与人传人传播有关,每年10月至次年3月是诺如病毒感染性疫情高峰期(68.57%,24/35);35起疫情中,以诺如病毒GⅡ组为主(阳性率80.00%,176/220),GI组检出率为13.641%(30/220),GⅨ组检出率低(6.36%,14/220);基因分型GⅡ.2[P16]占比最高(占35.71%,10/28),其次GⅡ.4[P16](占14.29%,4/28)、GⅡ.3[P12](占10.71%,3/28)和少数其他重组基因型。结论淄博市诺如病毒感染性疫情呈现上升趋势,托幼机构是发生诺如病毒感染性疫情的主要场所,诺如病毒感染性疫情主要为GⅡ组为主,GⅡ.2[P16]基因型为优势基因型,合并多种重组型的流行特征,加强诺如病毒分子流行病学监测,有利于掌握诺如病毒流行病学特征,为科学防控提供理论依据。

一株GⅡ.12[P16]型诺如病毒毒株的全基因组序列分析

目的对一株诺如病毒分离株SD20200267进行鉴定和全基因组序列分析,了解其结构特征。方法取患者标本进行病毒核酸的提取,对样本核酸进行扩增,将扩增产物进行测序,根据核苷酸序列进行基因分型。采用宏基因组测序技术进行全基因组测序,对测序所得的核苷酸序列进行分析。结果获得SD20200267株病毒基因组全长,总长度为7465个核苷酸。SD20200267株在VP1区及RdRp区分别属于GⅡ.12和GⅡ.P16基因型。SD20200267株与其他GⅡ.12[P16]型毒株核苷酸一致性在96.0%~97.3%之间,有15个氨基酸位点变异。该毒株存在重组现象,重组位点位于ORF1与ORF2重叠区域。结论SD20200267株为GⅡ.12[P16]型毒株,ORF1与ORF2重叠区域存在重组现象。

山东省济宁市病毒性腹泻样本诺如病毒分子流行病学与基因特征分析

目的了解山东省济宁市诺如病毒的分子流行病学特征及诺如病毒的优势基因型,为诺如病毒感染防控提供科学依据。方法按照《山东省病毒性腹泻监测方案》,2018年1月-2020年12月从山东省济宁市每县(市、区)每月采集3~5份病毒性腹泻标本,进行流行病学调查,采用Real time RT-PCR方法检测诺如病毒GI/GⅡ组,对阳性样本进行基因型别鉴定。结果共采集粪便标本1230份,诺如病毒阳性165份(其中GⅠ8份、GⅡ157份),检出率为13.41%(165/1230)。每年除2月份外,其他月份均检出诺如病毒,以6月、7月检出率高。基因型分别为GⅡ.4型25份,占32.05%;GⅡ.2型18份,占23.08%;GⅡ.6型14份,占17.95%;GⅡ.3型13份,占16.67%。3年间优势毒株不同,2018年为GⅡ.3型9份,占69.23%;2019年为GⅡ.2型14份,占43.75%;2020年为GⅡ.4型17份,占53.13%。结论山东省济宁市诺如病毒感染6月和7月流行强度较强,以GⅡ组为主,基因型存在多样性,处于动态变化中,以GⅡ.2[P16]型和GⅡ.4[P31]型为主要型别。

诺如病毒GIX.1[GII.P15]型山东株SD20191568全基因组序列特征分析

目的分析诺如病毒山东株SD20191568全基因组序列,了解其基因组结构特点。方法取诺如病毒阳性者粪便,提取核酸。根据诺如病毒参考株序列设计引物,用RT-PCR分段扩增病毒全基因组,经测序后进行核苷酸、氨基酸序列比对和系统进化分析。结果通过扩增获得SD20191568株接近完整的基因组序列,由7470个核苷酸(nt)组成,在ORF1和ORF2分别属于GII.P15和GIX.1基因型,SD20191568株在ORF1、ORF2和ORF3与GIX.1[GII.P15]基因型参考株的核苷酸同源性分别是90.1%~98.8%、92.7%~98.8%和92.2%~97.3%。根据完整VP1核苷酸系统进化分析,来自GenBank的GIX.1型参考株分为6个基因群(ClusterA-F),SD20191568株与2016-2018年的毒株共同划分在F群,核苷酸同源性为97.2%~98.8%。通过衣壳区氨基酸比对,SD20191568株与F群参考株氨基酸序列相同,未发生变异。结论诺如病毒山东株SD20191568属于GIX.1[GII.P15]型毒株,VP1区核苷酸与原型株差异较大,全长序列可为病毒的遗传进化研究、快速诊断试剂的研制及疫苗的设计提供参考。

一起GⅡ.4[P16]型诺如病毒感染暴发疫情调查

目的分析2021年山东省某小区一起诺如病毒感染暴发疫情流行因素,为制定有效的防控措施提供科学依据。方法采用现场流行病学方法调查、分析疾病的流行情况,采集水样本、典型病例的粪便或呕吐物、密切接触者的肛拭子标本进行胃肠炎病毒检测,对阳性样本进行基因分型。结果搜索到病例69例(9例为小区内幼儿园儿童,60例为社区居民),临床表现主要为呕吐(76.81%),腹泻(69.57%)。0~5岁儿童罹患率最高(21.18%)。17份病例标本和2份密切接触者标本GⅡ组诺如病毒阳性,基因型均为GⅡ.4[P16]。结论本次事件是由GⅡ.4[P16]型诺如病毒引起的暴发疫情,是由患病儿童呕吐物造成环境污染,社区人员密切接触导致,及时识别和妥善处置是疫情防控的关键。

2017年山东省三个城市食源性腹泻中胃肠炎病毒的病原谱特征分析

目的分析山东省三个城市食源性腹泻病例中胃肠炎病毒病原谱的分布和流行特征。方法于2017年1—12月,以山东省济南、烟台和临沂市的6家哨点医院为研究现场,收集1397例食源性腹泻病例的粪便标本,同时获取其基本信息和临床症状。采用双重荧光定量RT PCR分别检测如病毒基因Ⅰ组(NoV GⅠ)和Ⅱ组(NoV GⅡ)、札如病毒(SaV)和人星状病毒(HAstV),采用单重荧光定量RT PCR检测轮状病毒A组(RVA),采用荧光定量PCR检测肠道腺病毒(EAdV),对病毒的特异性片段进行测序、分型。比较不同特征病例胃肠炎病毒阳性率以及阳性和阴性病例间临床症状的差异。结果年龄M(P25,P75)为23(1,42)岁;以男性为主,占57.48%(803例);≤5岁儿童居多,占36.36%(508例)。胃肠炎病毒阳性率为33.93%(474例),济南、临沂和烟台市分别为32.03%(147/459)、41.54%(189/455)和28.57%(138/483)(P<0.001);NoV GⅡ组的阳性率最高,为16.54%(231例),5月(24.75%,50/202)和6月(19.59%,38/194)出现高峰,以GⅡ.P16/GⅡ.2型(48.28%,56/116)为主。阳性病例中,44.51%(211/474)出现呕吐症状,高于阴性病例(34.13%,315/923),差异有统计学意义(P<0.001)。结论山东省食源性腹泻病例中男性、5岁以下儿童居多;NoV GⅡ流行强度较高,发病高峰为春夏季,病毒性胃肠炎临床症状不典型。

山东省2007/2008年度流行性脑脊髓膜炎病原学监测结果分析

目的分析山东省2007/2008年度(2007年10月～2008年9月)流行性脑脊髓膜炎(流脑)疫情及健康人群带菌调查结果,了解脑膜炎奈瑟菌(Neisseria Meningitides,Nm)菌群分布、变异状况及耐药特征。方法用Nm双抗培养基,对采集的脑脊液及咽拭子标本进行分离培养、鉴定及药物敏感性试验。脑脊液及血清标本辅以实时荧光定量聚合酶链反应检测。结果2007/2008年度,从流脑病例及接触者分离到Nm7株,其中B群3株,C群4株。健康人群2323人中带菌者44人,带菌率1.89%;其中A群11株(占25.00%),B群16株(36.36%),C群4株(9.09%),其它血清群13株(29.55%)。以15～19岁带菌率最高,为5.74%;性别、地区间差异均无统计学意义。A、B、C群Nm表现不同耐药特征。结论目前流脑疫情以C、B群为主,健康人群带菌以B群为主,其次为A、C群。应在以预防接种为主的综合措施基础上,继续加强流脑病原学及耐药特征监测。

2006-2012年山东省急性细菌性脑膜炎哨点监测及病原学监测结果分析

目的分析急性细菌性脑膜炎（Acute Bacterial Meningitis，ABM）哨点监测及病原学监测结果，了解山东省ABM流行特征。方法对6所哨点医院监测的ABM病例开展流行病学调查，采用细菌培养、乳胶凝集、实时荧光定量-聚合酶链反应等方法对病例标本进行常见病原菌检测，并通过Epi Info 2003、SPSS13．0等软件对数据进行分析。结果2006—2012年共报告ABM病例309例，男女性别比为1．81：1，以儿童、学生和农民为主。其中实验室确诊病例61例，脑膜炎奈瑟菌（Neisseria meningitidis，Nm）感染32例（B群2例，C群19例，W135群2例，不可分群9例），患者年龄主要为7～44岁（24例，75．00％），职业以学生和农民居多，4、5月为发病高峰期（15例，46．88％）；肺炎链球菌（Streptococcus pneumoniae，Sp）感染29例，以婴幼儿和老年人为主（18例，62．07％）；未检出流感嗜血杆菌（Haemophilus influenzae，Hi）。病例转归总体良好，痊愈或好转者占87．05％，实验室确诊ABM病例疗程显著低于非实验室确诊病例（t：2．762，P=0．006）。结论山东省哨点监测发现的ABM首要致病原是Nm，Sp次之，建议根据疾病的流行特征及病原谱分布，对ABM的防控策略做相应调整。病原体的检出对疾病治疗具有促进作用，需要进一步加强病原学监测。

2018-2020年济宁市病毒性腹泻患者轮状病毒感染率和基因型特征

目的了解济宁市病毒性腹泻患者轮状病毒感染率和轮状病毒基因型分布特征。方法2018-2020年在济宁市各县(市、区)每月采集3-5例病毒性腹泻患者的粪便标本,采用荧光定量RT-PCR方法检测轮状病毒核酸和进行基因型鉴定,分析轮状病毒核酸检测阳性率和基因型构成。结果本研究病毒性腹泻患者轮状病毒核酸检测总阳性率为6.6%(80/1217),0-4岁、5-9岁、10-14岁、≥15岁患者阳性率分别为11.6%、1.4%、1.3%、2.7%;1月份、2月份阳性率较高,分别为36.0%、25.0%。在34例基因型检出病例中,G2、G9基因型分别占2.9%、97.1%;P[4]、P[8]、P[4+8]基因型分别占2.9%、91.2%、5.9%;G2P[4]、G9P[8]、G9P[4+8]组合基因型分别占2.9%、91.2%、5.9%。结论2018-2020年济宁市病毒性腹泻患者轮状病毒感染以儿童为主,1-2月份感染风险高,G9P[8]基因型为优势流行毒株。

2008/2009年度山东省流行性脑脊髓膜炎病原学监测资料分析

[目的]了解脑膜炎奈瑟菌菌群分布、变异及耐药情况，为流行性脑脊髓膜炎（流脑）防治工作提供科学依据。[方法]对2008／2009年度山东省流脑疑似病例及流脑监测点流行期检测资料进行分析。[结果]调查健康人群1097人。从咽拭子检出脑膜炎双球菌13人，带菌率为1．19％，分离菌株中，A群3株，B群1株，C群1株，W135群4，I群2株，X群2株。带菌率，15～19岁为5．77％，其他年龄为0．43％（P〈0．01）。检测10例流脑病例脑脊液（或血清），其密切接触者咽拭子30份，“两脑”项目哨点医院送检脑炎、脑膜炎疑似病例脑脊液（或血清）标本184份，RT—PCR检出l株A群菌（流脑病例）、3株C群菌（“两脑”病例）。用分离的9株菌株进行药敏试验，1株B群菌株对12种抗生素均敏感；其他8株对氨苄青霉素、阿齐霉素、美洛培能、头孢曲松、头孢噻肟、阿齐霉素、氯霉素、利福平、萘啶酸均敏感，对复方新诺明均耐药，对青霉素1株耐药．对环丙沙星6株耐药，对左氧氟沙星6株耐药。[结论]目前山东省流脑疫情以A群、C群为主，从健康人群中检出W135群菌株，部分菌株对常用抗菌药物表现耐药。

2012—2017年山东省5岁以下儿童病毒性腹泻病原监测结果分析

目的分析山东省5岁以下儿童病毒性腹泻病原谱和流行病学特点,为病毒性腹泻防控提供参考依据。方法收集2012—2017年在山东省哨点医院就诊的所有5岁以下腹泻患儿发病3日内粪便标本共1017份,轮状病毒使用ELISA筛检,ELISA阳性标本使用RT-PCR方法进行轮状病毒G/P分型;诺如病毒(GI和GII)、札如病毒、星状病毒检测采用RT-PCR筛检,肠道腺病毒采用PCR方法检测。结果1017份粪便标本中,病毒总阳性率为51.62%(525/1017),检出至少含有1种病毒核酸421份、混合病毒感染104份,混合感染占全部感染的10.23%(104/1017)。轮状病毒、杯状病毒、肠道腺病毒和星状病毒阳性检出率分别为34.22%(348/1017)、16.91%(172/1017)、2.56%(26/1017)、9.64%(98/1017)。腹泻病毒总检出率和轮状病毒检出率在12~17月龄最高,分别为51.72%(105/203)和20.20%(41/203),2岁及以下患儿腹泻病毒阳性率为49.36%(502/1017),2岁以上患儿腹泻病原阳性率2.26%(23/1017)。病毒性腹泻高峰为每年11月份至次年4月份。轮状病毒G基因型以G9为优势型(82.76%),P基因型以P[8]型为主(80.46%),G/P组合以G9P[8]为主(83.87%)。杯状病毒中诺如病毒感染为主(87.21%)。结论2012—2017年山东省5岁以下儿童病毒性腹泻以轮状病毒为主,其次为诺如病毒,发病率处于全国的中等程度,秋冬季为流行季节。