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星星草类萌发素蛋白基因(PutGLP2)的克隆及生物信息学分析
1
作者
傅文上
李波
+1 位作者
戴绍军
李莹
《现代农业科技》
2019年第16期179-180,184,共3页
类萌发素蛋白是一类种子萌发相关的特异性标记,其在植物生物和非生物胁迫应答过程中起到了重要作用。本研究通过酵母cDNA文库筛选,获得全长为1065bp的PutGLP2基因,其5′非翻译区164bp,开放读码框666bp,编码221个氨基酸,3′非翻译区235b...
类萌发素蛋白是一类种子萌发相关的特异性标记,其在植物生物和非生物胁迫应答过程中起到了重要作用。本研究通过酵母cDNA文库筛选,获得全长为1065bp的PutGLP2基因,其5′非翻译区164bp,开放读码框666bp,编码221个氨基酸,3′非翻译区235bp。利用PCR技术,克隆获得PutGLP2的ORF序列。生物信息学分析发现,PutGLP2在氨基端(N端)具有一个跨膜结构域及N端信号肽,预测定位于细胞壁或胞外间质。将PutGLP2与水稻的43种GLP蛋白进行聚类分析,发现PutGLP2属于类萌发素亚家族2成员之一,并与水稻OsGLP1-1相似性最高。本研究将为丰富植物类萌发素蛋白基因信息提供参考。
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关键词
星星草
类萌发素蛋白
基因克隆
生物信息学分析
下载PDF
职称材料
番茄LeRma1基因的克隆与表达
2
作者
陈默
金晓霞
+4 位作者
于丽杰
朱宏
丁国华
傅文上
付畅
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第9期1735-1745,共11页
以番茄‘哈大粉801’为试材,利用RT-PCR技术,克隆得到1个E3泛素蛋白连接酶基因LeRma1(GenBank登录号XM_004243764.1)。对LeRma1基因进行序列分析,并对LeRma1基因在番茄植株的不同部位以及在非生物胁迫(干旱、盐、碱、高温、低温)下的表...
以番茄‘哈大粉801’为试材,利用RT-PCR技术,克隆得到1个E3泛素蛋白连接酶基因LeRma1(GenBank登录号XM_004243764.1)。对LeRma1基因进行序列分析,并对LeRma1基因在番茄植株的不同部位以及在非生物胁迫(干旱、盐、碱、高温、低温)下的表达和生理特性进行研究,为培育和改良番茄品种提供理论依据。结果表明:(1)序列分析显示,LeRma1基因的cDNA全长序列729bp,编码242个氨基酸,分子量为27.05kD,理论pI 7.97;同源分析显示,番茄LeRma1蛋白与马铃薯的一致性最高(91%)。(2)半定量PCR检测表明,LeRma1基因在番茄根、茎、叶、花、果实中均有表达,且表达差异不明显。(3)干旱胁迫下,LeRma1基因在番茄叶片中优势表达,而在整个干旱过程中根部的LeRma1基因表达量变化不明显;抗旱相关基因LEA、DREB2A、ABI3在干旱胁迫过程中,番茄叶片中均有表达,且其表达量呈上升趋势,而在根部DREB2A、ABI3基因基本没有检测到。(4)干旱胁迫过程中,番茄植株中丙二醛(MDA)含量呈显著升高趋势,质膜系统严重损伤,体内保护酶(SOD、POD、CAT)活性上升,且根部活性总体明显高于叶片。(5)在非生物逆境(盐、碱、高温、低温)胁迫过程中,LeRma1基因在番茄叶片和根部的表达几乎都有增强的趋势,且在叶片中均是胁迫3h后诱导起始增强表达。研究认为,LeRma1基因是一个受干旱胁迫诱导增强表达的基因,且在叶片中优势表达,说明LeRma1基因对植物耐受干旱胁迫所起的作用存在一定的组织差异性,而且LeRma1基因可能参与番茄的干旱应答及信号转导过程,在番茄抵抗其他非生物胁迫中LeRma1基因也可能具有一定的作用。
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关键词
番茄
LeRma1
克隆
表达
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职称材料
题名
星星草类萌发素蛋白基因(PutGLP2)的克隆及生物信息学分析
1
作者
傅文上
李波
戴绍军
李莹
机构
东北林业大学盐碱地生物资源环境研究中心
东北盐碱地植被恢复与重建教育部重点实验室
出处
《现代农业科技》
2019年第16期179-180,184,共3页
基金
中央高校基本科研业务专项资金资助项目(2572018BS03
2572017ET01)
文摘
类萌发素蛋白是一类种子萌发相关的特异性标记,其在植物生物和非生物胁迫应答过程中起到了重要作用。本研究通过酵母cDNA文库筛选,获得全长为1065bp的PutGLP2基因,其5′非翻译区164bp,开放读码框666bp,编码221个氨基酸,3′非翻译区235bp。利用PCR技术,克隆获得PutGLP2的ORF序列。生物信息学分析发现,PutGLP2在氨基端(N端)具有一个跨膜结构域及N端信号肽,预测定位于细胞壁或胞外间质。将PutGLP2与水稻的43种GLP蛋白进行聚类分析,发现PutGLP2属于类萌发素亚家族2成员之一,并与水稻OsGLP1-1相似性最高。本研究将为丰富植物类萌发素蛋白基因信息提供参考。
关键词
星星草
类萌发素蛋白
基因克隆
生物信息学分析
Keywords
Puccinellia tenuiflora
germin-like protein
gene cloning
bioinformatics analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
番茄LeRma1基因的克隆与表达
2
作者
陈默
金晓霞
于丽杰
朱宏
丁国华
傅文上
付畅
机构
哈尔滨师范大学生命科学与技术学院
密山市第一中学
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第9期1735-1745,共11页
基金
黑龙江省教育厅面上项目(12531204,12531178)
植物生物学黑龙江省高校重点实验室开放课题(ZK201205)
+2 种基金
哈尔滨师范大学青年学术骨干资助计划(KGB201218,09KXQ-01)
黑龙江省普通高等学校青年学术骨干支持计划
哈尔滨师范大学硕士研究生创新科研项目(HSDSSCX2014-32)
文摘
以番茄‘哈大粉801’为试材,利用RT-PCR技术,克隆得到1个E3泛素蛋白连接酶基因LeRma1(GenBank登录号XM_004243764.1)。对LeRma1基因进行序列分析,并对LeRma1基因在番茄植株的不同部位以及在非生物胁迫(干旱、盐、碱、高温、低温)下的表达和生理特性进行研究,为培育和改良番茄品种提供理论依据。结果表明:(1)序列分析显示,LeRma1基因的cDNA全长序列729bp,编码242个氨基酸,分子量为27.05kD,理论pI 7.97;同源分析显示,番茄LeRma1蛋白与马铃薯的一致性最高(91%)。(2)半定量PCR检测表明,LeRma1基因在番茄根、茎、叶、花、果实中均有表达,且表达差异不明显。(3)干旱胁迫下,LeRma1基因在番茄叶片中优势表达,而在整个干旱过程中根部的LeRma1基因表达量变化不明显;抗旱相关基因LEA、DREB2A、ABI3在干旱胁迫过程中,番茄叶片中均有表达,且其表达量呈上升趋势,而在根部DREB2A、ABI3基因基本没有检测到。(4)干旱胁迫过程中,番茄植株中丙二醛(MDA)含量呈显著升高趋势,质膜系统严重损伤,体内保护酶(SOD、POD、CAT)活性上升,且根部活性总体明显高于叶片。(5)在非生物逆境(盐、碱、高温、低温)胁迫过程中,LeRma1基因在番茄叶片和根部的表达几乎都有增强的趋势,且在叶片中均是胁迫3h后诱导起始增强表达。研究认为,LeRma1基因是一个受干旱胁迫诱导增强表达的基因,且在叶片中优势表达,说明LeRma1基因对植物耐受干旱胁迫所起的作用存在一定的组织差异性,而且LeRma1基因可能参与番茄的干旱应答及信号转导过程,在番茄抵抗其他非生物胁迫中LeRma1基因也可能具有一定的作用。
关键词
番茄
LeRma1
克隆
表达
Keywords
tomato
LeRma1
clone
expression
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
星星草类萌发素蛋白基因(PutGLP2)的克隆及生物信息学分析
傅文上
李波
戴绍军
李莹
《现代农业科技》
2019
0
下载PDF
职称材料
2
番茄LeRma1基因的克隆与表达
陈默
金晓霞
于丽杰
朱宏
丁国华
傅文上
付畅
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
下载PDF
职称材料
已选择
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