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逆转录聚合酶链反应检测广东地区高危人群庚型肝炎病毒RNA
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作者 傅涌水 吕凌 +1 位作者 周伯平 罗红涛 《实用医学杂志》 CAS 1998年第10期724-726,共3页
为了解广东地区庚型肝炎病毒(HGV)流行情况,为广东地区庚型肝炎的防治提供客观资料。以DNASIS软件对Genbank收录的3株HGV全序列:U44402、U45966和U36380进行同源性比较,取高度保守的5'非翻译区(5'UTR)设计合成两对套式... 为了解广东地区庚型肝炎病毒(HGV)流行情况,为广东地区庚型肝炎的防治提供客观资料。以DNASIS软件对Genbank收录的3株HGV全序列:U44402、U45966和U36380进行同源性比较,取高度保守的5'非翻译区(5'UTR)设计合成两对套式引物,建立检测HGVRNA的逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术,并对其中一输血后非甲-戊型肝炎血清PCR产物进行分子克隆与核苷酸序列分析以鉴定其特异性。结果表明,431例肝炎患者,185例静脉吸毒者及106例献血员HGVRNA阳性率分别为10.7%(46/431)、33.5%(62/185)和8.5%(9/106)。提示上述三种易感人群存在不同程度HGV感染。 展开更多
关键词 庚型肝炎病毒 聚合酶链反应 基因 序列分析
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丙肝诊断的竞争定量PCR法的实验研究及应用 被引量:1
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作者 冯卓 彭文伟 +1 位作者 吕凌 傅涌水 《广州医学院学报》 1997年第5期7-12,共6页
迫于丙型肝炎病毒(HCV)的基础研究与实际应用中定量病毒基因的需要,本文利用体外构建的野生型与突变型模板,建立HCVRNA的竞争性聚合酶链反应(PCR)定量检测,进行了敏感性、特异性一重复性实验,并试用于检测血清标本。结果表明,... 迫于丙型肝炎病毒(HCV)的基础研究与实际应用中定量病毒基因的需要,本文利用体外构建的野生型与突变型模板,建立HCVRNA的竞争性聚合酶链反应(PCR)定量检测,进行了敏感性、特异性一重复性实验,并试用于检测血清标本。结果表明,野生型与突变型模板的灵敏度达到RNA为100fg,DNA为10fg;同一条件下,野生型与突变型模板进行竞争反应存在良好的稳定的比例关系,通过已知量的参照模板可较准确地推算出血清标本中的原始浓度。因此,此野生型模板可作为HCVRNA的逆转录及PCR定性诊断中的金标准;而突变型模板则作为内参照用于HCVRNA的竞争性逆转录PCR定量。丙肝诊断从定性走向定量,在实际工作中具有重大意义。 展开更多
关键词 丙肝病毒 竞争PCR 定量分析
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佛山市庚型肝炎病毒检测和部分基因序列分析 被引量:2
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作者 罗红涛 钟锐兴 +3 位作者 吕凌 傅涌水 张瑞娴 许炜 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1998年第4期219-221,共3页
目的了解佛山庚型肝炎病毒(HGV)感染状况,分析HGV非结构基因(NS)3区部分核苷酸序列。方法采用逆转录聚合酶链反应检测血清HGVRNA,对一例肝炎患者的HGV(HGVC-FS)NS3区818bp片段作克隆及序列分... 目的了解佛山庚型肝炎病毒(HGV)感染状况,分析HGV非结构基因(NS)3区部分核苷酸序列。方法采用逆转录聚合酶链反应检测血清HGVRNA,对一例肝炎患者的HGV(HGVC-FS)NS3区818bp片段作克隆及序列分析。结果80例非甲-戊型肝炎患者和105例静脉吸毒者HGVRNA检出率分别为6.3%(5/80)和23.8%(25/105),HGVC-FSNS3区片段核苷酸序列与HGV-U44402、U45966、U36380及HGVC964相同区段同源性为85.5%、85.6%、88.0%、89.2%。结论佛山存在HGV感染,静脉吸毒者感染率较高,HGV可能不是非甲-戊型肝炎主要致病因素。HGVC-FS与HGVC964同源性最高。 展开更多
关键词 庚型肝炎病毒 分子克隆 基因 序列分析
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HCV5′NCR和结构蛋白编码序列的克隆及对PA317细胞的转染
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作者 傅涌水 吕凌 王斌 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1998年第3期137-139,共3页
目的进一步研究丙型肝炎病毒5′NCR对结构蛋白编码基因的表达调控。方法以拼接好的HCV5′NCR,C,E1和E2/NS1区基因共长2547个核苷酸片段克隆于逆转录病毒载体LNSX得重组体pLHC2547,用聚合酶链反... 目的进一步研究丙型肝炎病毒5′NCR对结构蛋白编码基因的表达调控。方法以拼接好的HCV5′NCR,C,E1和E2/NS1区基因共长2547个核苷酸片段克隆于逆转录病毒载体LNSX得重组体pLHC2547,用聚合酶链反应(PCR)及核苷酸序列分析等方法对重组体进行鉴定。通过磷酸钙-DNA共沉淀法把经鉴定的重组体转染入PA317细胞,用G418进行克隆筛选,以NIH3T3细胞测其病毒滴度。提取转染细胞DNA及培养上清RNA分别用PCR和逆转录PCR进行鉴定。结果培养上清的病毒滴度为2×105CFU/ml,PCR及逆转录PCR(RT-PCR)分别可以从转染的细胞DNA及培养上清中扩增出HCV的基因片段。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 分子克隆 逆转录病毒 转染
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