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基于COVID-19相关基因的肝细胞癌分子分型及预后模型构建与验证
1
作者
元喆悦
白易
+2 位作者
童文
张晓雨
崔壮
《天津医科大学学报》
2024年第1期15-22,共8页
目的:基于新型冠状病毒肺炎(COVID-19)相关基因对肝细胞癌进行分子分型,并建立预后模型。方法:收集GeneCard数据库中COVID-19相关基因,分析其在肝细胞癌患者癌与癌旁组织的基因表达量差异,通过一致聚类分析进行分子分型。使用limma包计...
目的:基于新型冠状病毒肺炎(COVID-19)相关基因对肝细胞癌进行分子分型,并建立预后模型。方法:收集GeneCard数据库中COVID-19相关基因,分析其在肝细胞癌患者癌与癌旁组织的基因表达量差异,通过一致聚类分析进行分子分型。使用limma包计算不同分子亚型之间差异表达基因并进行功能富集分析。使用R软件包“ESTIMATE”评估不同分子亚型的免疫评分。使用Cox比例风险回归模型和lasso回归构建多基因预后模型,并在其他数据库进行外部验证。结果:基于28个COVID-19相关基因将TCGA的365个肝细胞癌(LIHC)样本分成3个亚型,预后较差的C2亚型具有更高的免疫评分。多因素Cox回归分析结果说明5基因模型是肝细胞癌患者的独立预后危险因素。细胞周期、同源重组等肿瘤相关通路随着风险评分的升高而增加,提示高风险组具有更强的侵袭性。结论:构建了基于COVID-19相关基因的肝细胞癌分子亚型,并开发了预后相关的5基因模型(VEGFA、CD14、CD209、REN、PSMD1)。
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关键词
肝细胞癌
COVID-19基因
分子分型
基因标记
预后
下载PDF
职称材料
肝切除术后肝脏再生与肿瘤复发相关性的研究进展
被引量:
3
2
作者
杨龙
元喆悦
张雅敏
《中华外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期554-557,共4页
肝部分切除术仍是治疗肝癌的首选治疗方法,近年来大量体内及体外试验研究了促进术后肝脏再生以预防小肝综合征和肝功能衰竭发生的方法。但多项研究结果表明,肝切除术后肝再生过程可以促进肿瘤细胞的生长从而激活隐匿性微小病灶导致肿瘤...
肝部分切除术仍是治疗肝癌的首选治疗方法,近年来大量体内及体外试验研究了促进术后肝脏再生以预防小肝综合征和肝功能衰竭发生的方法。但多项研究结果表明,肝切除术后肝再生过程可以促进肿瘤细胞的生长从而激活隐匿性微小病灶导致肿瘤复发,肝再生的三个阶段中起关键作用的细胞因子及基因均不同程度地参与了肝癌的形成、迁移、浸润和复发。如何权衡促进术后肝脏再生和抑制肿瘤复发成为肝脏外科一个亟待解决的问题,二者之间的关系十分复杂。
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关键词
肝肿瘤
肝切除术
肝脏再生
肿瘤复发
原文传递
题名
基于COVID-19相关基因的肝细胞癌分子分型及预后模型构建与验证
1
作者
元喆悦
白易
童文
张晓雨
崔壮
机构
天津医科大学公共卫生学院
天津市第一中心医院肝胆胰外科
天津医科大学临床医学系
出处
《天津医科大学学报》
2024年第1期15-22,共8页
文摘
目的:基于新型冠状病毒肺炎(COVID-19)相关基因对肝细胞癌进行分子分型,并建立预后模型。方法:收集GeneCard数据库中COVID-19相关基因,分析其在肝细胞癌患者癌与癌旁组织的基因表达量差异,通过一致聚类分析进行分子分型。使用limma包计算不同分子亚型之间差异表达基因并进行功能富集分析。使用R软件包“ESTIMATE”评估不同分子亚型的免疫评分。使用Cox比例风险回归模型和lasso回归构建多基因预后模型,并在其他数据库进行外部验证。结果:基于28个COVID-19相关基因将TCGA的365个肝细胞癌(LIHC)样本分成3个亚型,预后较差的C2亚型具有更高的免疫评分。多因素Cox回归分析结果说明5基因模型是肝细胞癌患者的独立预后危险因素。细胞周期、同源重组等肿瘤相关通路随着风险评分的升高而增加,提示高风险组具有更强的侵袭性。结论:构建了基于COVID-19相关基因的肝细胞癌分子亚型,并开发了预后相关的5基因模型(VEGFA、CD14、CD209、REN、PSMD1)。
关键词
肝细胞癌
COVID-19基因
分子分型
基因标记
预后
Keywords
hepatocellular carcinoma
COVID-19 genes
molecular typing
gene signature
prognosis
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
肝切除术后肝脏再生与肿瘤复发相关性的研究进展
被引量:
3
2
作者
杨龙
元喆悦
张雅敏
机构
天津市第一中心医院肝胆外科
出处
《中华外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期554-557,共4页
文摘
肝部分切除术仍是治疗肝癌的首选治疗方法,近年来大量体内及体外试验研究了促进术后肝脏再生以预防小肝综合征和肝功能衰竭发生的方法。但多项研究结果表明,肝切除术后肝再生过程可以促进肿瘤细胞的生长从而激活隐匿性微小病灶导致肿瘤复发,肝再生的三个阶段中起关键作用的细胞因子及基因均不同程度地参与了肝癌的形成、迁移、浸润和复发。如何权衡促进术后肝脏再生和抑制肿瘤复发成为肝脏外科一个亟待解决的问题,二者之间的关系十分复杂。
关键词
肝肿瘤
肝切除术
肝脏再生
肿瘤复发
Keywords
Liver neoplasms
Hepatectomy
Liver regeneration
Recurrence
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于COVID-19相关基因的肝细胞癌分子分型及预后模型构建与验证
元喆悦
白易
童文
张晓雨
崔壮
《天津医科大学学报》
2024
0
下载PDF
职称材料
2
肝切除术后肝脏再生与肿瘤复发相关性的研究进展
杨龙
元喆悦
张雅敏
《中华外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
原文传递
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