Hsa_circ_0005019在结直肠癌细胞增殖、侵袭和迁移中的作用及其预后预测价值

目的:评估环状RNA hsa_circ_0005019在结直肠癌细胞增殖、侵袭和迁移中的作用及对结直肠癌预后的影响。方法:人结肠癌细胞HCT116分为2组,分别转染hsa_circ_0005019 siRNA(siRNA组)和对照siRNA(阴性对照组)。采用CCK-8法和Transwell小室分别检测2组细胞增殖、侵袭和迁移能力。采用qRT-PCR检测结直肠癌和配对癌旁正常肠黏膜组织(n=66)中hsa_circ_0005019表达水平;根据hsa_circ_0005019表达水平的均值将结直肠癌患者分为高表达组和低表达组,绘制2组的生存曲线并比较预后,采用Cox回归分析hsa_circ_0005019对结直肠癌预后的影响。结果:与阴性对照组比较,siRNA组细胞增殖、侵袭和迁移能力增强(P<0.05)。结直肠癌组织中hsa_circ_0005019的相对表达量为(0.759±0.063),低于癌旁正常组织(1.000±0.082)(P<0.001)。生存分析显示,与低表达组相比,高表达组预后更好(P<0.05)。Cox回归分析表明在调整性别、年龄、病理学分级、TNM分期、肿瘤类型、浸润深度后,hsa_circ_0005019表达水平可以预测结直肠癌预后(HR=0.104,95%CI:0.013~0.854,P=0.035)。结论:Hsa_circ_0005019在结直肠癌中扮演抑癌基因的角色,有望成为结直肠癌预后标志物和生物治疗的新靶点。

利用TCGA数据库分析GRB2在肝细胞肝癌中的表达及临床意义

目的分析GRB2在肝细胞肝癌(HCC)中的表达与HCC患者临床特征及预后的相关性,进而预测GRB2与HCC发生发展的关系。方法从癌症基因组图谱(TCGA)中选取HCC中GRB2的基因表达谱及相关临床和病理资料,分析GRB2在HCC癌组织和癌旁组织中的表达情况以及HCC癌组织中GRB2表达量与HCC患者临床特征及预后的关系。结果 GRB2在HCC癌组织中的表达高于癌旁组织(P<0.05)。GRB2表达水平与HCC临床病理分级、TNM分期、血清甲胎蛋白(AFP)水平相关,HCC临床病理分级、TNM分期、血清AFP水平越高,GRB2表达量越高(P<0.05)。COX多因素分析显示GRB2高表达和TNM分期是影响HCC患者预后的独立危险因素。结论 GRB2可作为促癌基因在HCC患者的肿瘤组织中呈高表达,提示HCC患者预后不良,有望成为早期诊断HCC的分子标志物和判断预后的指标。

MLLT10在肝细胞肝癌中的表达及临床意义

目的探讨MLLT10的表达水平在肝细胞肝癌(HCC)中的表达及临床意义。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库对MLLT10在HCC癌组织及癌旁正常组织中的表达水平进行分析,分析MLLT10的表达水平与HCC患者的年龄、性别、血清甲胎蛋白(AFP)、肿瘤TNM分期、病理分级、整体生存率和无进展生存率的关系。结果 MLLT10在HCC癌组织中的表达水平高于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P<0.05)。性别、肿瘤TNM分期和病理分级与HCC癌组织MLLT10的表达水平有关(P<0.05)。年龄和血清AFP水平与HCC癌组织MLLT10的表达水平无关(P>0.05)。MLLT10高水平表达HCC患者的整体生存率和无进展生存率均低于MLLT10低水平表达者,差异有统计学意义(均P<0.05)。结论 MLLT10可能参与HCC的发生和发展,有望成为检测HCC的肿瘤标志物和预后判断因子。

miR-197在肝细胞肝癌组织中的表达及临床意义

目的探讨microRNA-197(miR-197)在肝细胞肝癌(HCC)中的表达及临床意义。方法从癌症基因组图谱(TCGA)中提取有关HCC的miR-197基因表达谱和相关临床特征及预后信息,利用SPSS统计学软件分析miR-197在HCC癌组织和癌旁正常组织中的表达情况,分析miR-197与HCC患者临床特征及预后的相关性。结果 miR-197在HCC癌组织中的表达量低于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P<0.05)。TNM分期与HCC癌组织miR-197表达水平有关(P<0.05)。性别、年龄、病理分级、血清AFP水平与HCC癌组织miR-197表达水平无关(P>0.05)。miR-197高表达组HCC患者的整体生存率高于miR-197低表达组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 miR-197可参与HCC的发生发展过程,有望被作为早期诊断HCC的生物标志物。

利用Y-STR单倍型推断样品间亲缘关系

目的通过对Y-STR单倍型的分析,推测不同样品间的亲缘关系远近。方法对郑州地区某单一姓氏男性182人取外周血,以Yfiler Plus试剂盒进行Y-STR基因座分型;以Arlequin分析单倍型多态性;以Network软件构建各样品间关系网络;以SPSS软件构建各样品间远近关系树状结构。结果单倍型分析发现,182例样品中共存在164种单倍型;Network软件分析显示,大部分样品间的网络距离呈均匀分布,但少部分样品距离较近;SPSS软件聚类分析发现,164个单倍型呈现出多个层级,大部分在短期内就发生了第一次聚集,再往根部又发生7次较大的汇集,最终全部汇集到两个分支上。结论即使在同姓男子中,Yfiler Plus试剂盒所包含的Y-STR基因座仍然有较高的基因差异度;以Y-STR检测结果进行Network分析及进化树分析,有助于揭示群体内个体间近代亲缘关系和遗传层级关系。该思路有望在法医学法医个体识别、亲权鉴定及族群迁徙等研究中发挥作用。

利用TCGA数据库分析PRAF2在肝细胞肝癌中的表达及临床意义

目的通过分析PRAF2在肝细胞肝癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)中的表达水平及其与肝细胞肝癌患者临床病理特征的相关性,探究PRAF2对HCC的检测及预后判断的作用和临床意义。方法从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库筛选出肝癌的数据及临床资料,并分析PRAF2基因表达水平与HCC患者的性别、年龄等一般资料和临床病理特征以及预后情况的相关性。结果 HCC患者癌组织中的PRAF2表达水平较癌旁组织明显上调(P<0.05),且表达水平的高低与患者的性别、年龄、肿瘤的病理学分级无关(P>0.05),与血清甲胎蛋白浓度、肿瘤的TNM分期有关(P<0.05)。PRAF2的高表达与患者总生存期及无进展生存期的缩短显著相关(P<0.05)。结论 PRAF2可作为促癌基因在HCC中高表达,有望成为HCC的早期诊断指标和预后判断指标。