利用Indel标记鉴定太白贝母及其近缘种

目的 建立基于插入缺失(Indel)标记的常规聚合酶链反应(PCR)方法对太白贝母及其近缘种开展分子鉴定研究。方法 从GenBank下载103条来自不同贝母来源植物的叶绿体基因组序列,序列比对筛选太白贝母的特异性Indel标记。在该Indel标记的上下游保守区中设计引物,通过常规PCR与凝胶电泳方法对不同贝母来源植物开展鉴定,并考察方法的特异性、灵敏性与最适反应温度。结果 太白贝母在accD-psaI基因间隔区具有一段长度为137 bp的缺失,可以作为太白贝母的特异性Indel标记。建立的常规PCR与凝胶电泳方法对太白贝母有良好的特异性,仅有太白贝母产生302 bp的条带,从而与暗紫贝母等其余12种不同贝母来源植物明显区分。该方法对贝母DNA模板的检测下限为0.239 ng·μL^(-1),最适熔解温度(T_(m))值为58℃。结论 该检测方法具有特异性高、快捷与成本低等特点,不仅能够实现对太白贝母及其近缘种的准确鉴定,还能够为其他重要来源植物的分子鉴定提供开发思路。