基于非靶向脂质组学分析脂蛋白Rv1411c对结核分枝杆菌脂质代谢的影响

目的:基于非靶向脂质组学探索结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)脂蛋白Rv1411c在该菌脂质代谢中的作用。方法:构建敲除编码脂蛋白Rv1411c基因的MTB(ΔRv1411c)菌株,测定ΔRv1411c与MTB标准株H37Rv的吸光度值(A 600值)并绘制两者生长曲线。提取ΔRv1411c与H37Rv菌液上清脂质成分,使用液相色谱-质谱(LC-MS)联用技术及非靶向脂质组学分析平台对菌株的差异脂质进行分析。采用偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析等方法分析两者的差异脂质代谢产物及差异脂质分子的富集通路。结果:通过色谱分离及质谱分析,从ΔRv1411c与H37Rv菌株中成功鉴定出归属于28种脂质亚类的460个不同的脂质分子,再通过PLS-DA模型分析获得其中归属于17种脂质亚类的158个差异脂质分子[变量权重值(VIP)>1]。以变异倍数(FC)>1.5或<0.67且P<0.05为筛选标准,共筛选出36个具有显著差异的脂质分子,其中有12个脂质分子上调,24个脂质分子下调。经KEGG通路富集分析,差异脂质代谢产物主要富集于以下8种通路,即:甘油磷脂代谢、亚麻酸代谢、α-亚麻酸代谢、糖基磷脂酰肌醇(GPI)-锚的生物合成、甘油脂代谢、鞘脂代谢、花生四烯酸代谢及不饱和脂肪酸的生物合成通路;其中又以甘油磷脂的代谢通路最为重要,其次为甘油脂代谢及糖基磷脂酰肌醇(GPI)-锚的生物合成通路。结论:脂蛋白Rv1411c可显著影响MTB的脂质代谢,可能参与MTB脂质代谢的调控。

鸟苷酸结合蛋白家族在感染性疾病中调控炎症小体活化的研究进展

鸟苷酸结合蛋白(guanylate-binding proteins,GBP)是一类干扰素诱导蛋白,在应对细菌、病毒、衣原体以及寄生虫等病原体感染时,其发挥的作用存在差异,并且影响感染性疾病的发展和结局。目前,研究者发现在细菌等病原体感染引发的细胞自主免疫中,GBP蛋白通过影响炎症小体的经典和非经典活化途径调控细胞焦亡。本文对GBP家族成员结构、进化特征以及炎症小体的经典和非经典活化途径进行了介绍,综述了GBP蛋白调控炎症小体活化的相关研究进展,归纳总结了GBP蛋白影响不同病原体感染的作用机制,以期为感染性疾病的发病机制和诊疗提供新的基础研究线索。

GeneXpert MTB/RIF Ultra检测胃液标本对儿童肺结核的诊断价值

目的评价超敏结核分枝杆菌及利福平耐药基因检测(GeneXpert MTB/RIF Ultra,简称“Xpert Ultra”)技术检测胃液标本对儿童肺结核的诊断价值。方法采用回顾性研究方法选取2019年7月至2020年7月就诊于四川省凉山彝族自治州第一人民医院儿科的患儿作为研究对象,其中符合入组标准的173例,包括经临床综合诊断为活动性肺结核患儿114例(观察组),其他呼吸系统感染性疾病患儿59例(对照组)。收集患者胃液标本和(或)痰液标本行结核分枝杆菌(MTB)培养和Xpert Ultra检测。以临床综合诊断为参照标准,评价Xpert Ultra检测胃液和痰液标本对儿童肺结核的诊断价值。结果以临床综合诊断为参照标准,Xpert Ultra检测胃液标本对儿童肺结核诊断的敏感度、特异度、一致率和Kappa值分别为53.5%(61/114)、98.3%(58/59)、68.8%(119/173)和0.43;其中,检测0~6岁(学龄前组)患儿胃液标本对肺结核诊断的敏感度[66.7%(26/39)]明显高于6~14岁组(学龄期组)[敏感度为46.7%(35/75)],差异有统计学意义(χ^(2)=4.126,P=0.042)。而胃液标本MTB培养诊断儿童肺结核的敏感度仅为20.2%(23/114)。65例同时行胃液标本和痰液标本Xpert Ultra检测的患儿中,Xpert Ultra检测胃液标本诊断肺结核的敏感度为52.2%(24/46),高于检测痰液标本诊断肺结核的敏感度[43.5%(20/46)],但差异无统计学意义(χ^(2)=0.697,P=0.404)。MTB培养阴性的150例患儿,40例经Xpert Ultra检测阳性,其微量MTB的检出率为37.5%(15/40);而MTB培养阳性的23例患儿微量MTB的检出率为14.3%(3/21)。在Xpert Ultra检测阳性的61例患儿中,5例检出利福平耐药。结论Xpert Ultra检测胃液标本对儿童肺结核诊断具有较好的价值,有助于儿童结核病的早期诊断。对于无法咳痰或难以取得合格痰液标本的学龄前儿童,胃液标本是很有价值的替代标本类型。

呼吸道病原体多重核酸检测方法在社区获得性肺炎患儿诊断中的应用

目的评价呼吸道病原体多重核酸检测方法在社区儿童获得性肺炎(community acquired pneumonia,CAP)诊断中的价值。方法纳入2018年5月至12月于首都医科大学附属北京儿童医院住院的CAP患儿354例,采集痰液等标本,采用呼吸道病原体多重核酸检测方法,并分别评价其在肺炎支原体肺炎(mycoplasma pneumoniae pneumonia,MPP)和病毒性肺炎中诊断的灵敏度和特异性,以及分析其与七项呼吸道病原检测方法的一致性。结果155例MPP组患儿,152例病原体核酸检测MP阳性,即灵敏度为98.1%;以病毒性肺炎和细菌性肺炎患儿为非MPP对照组,病原体核酸检测结果显示MP阳性4例,特异性为98.0%(195/199)。158例病毒性肺炎患儿,病原体核酸检测出病毒141例,灵敏度为89.2%。以MPP和细菌性肺炎患儿为非病毒性肺炎对照组,196例患儿病原体核酸检测检出病毒39例(19.9%),特异性为80.1%。158例病毒性肺炎患儿中99份标本其病原体核酸检测结果与病毒抗原检测结果完全一致。59例不一致结果以病毒抗原检测为单一感染而病毒核酸检测为混合感染为主(30例),且主要来源于病毒抗原检测方法所不涵盖的其他病毒感染。结论呼吸道病原体多重核酸检测在MPP诊断中具有较高的灵敏度和特异性;与传统的病毒抗原检测相比,虽存在一定的假阴性,但具有高通量检测的优势,可同时完成更多种病毒类型的检出;具有快速、灵敏度高等特点,可以为儿童呼吸道病原体的诊断以及鉴别诊断提供很好的证据。

2016年至2019年北京住院儿童肺炎支原体感染流行病学特征和耐药性

目的研究2016年至2019年北京地区住院儿童肺炎支原体(MP)感染流行病学特征和耐药性,以期为儿童肺炎支原体肺炎(MPP)的防治提供依据。方法回顾性分析2016年1月至2019年9月在北京儿童医院住院治疗的8691例社区获得性肺炎患儿的临床资料,采用实时荧光核酸恒温扩增检测技术(SAT)试剂盒检测MP感染情况,采用MP核酸及耐药突变位点检测试剂盒(荧光PCR法)检测MP耐药情况。计数资料采用χ^(2)检验进行分析。结果8691例行SAT检测的患儿中,MP总检出率为28.10%(2442/8691例)。2016年至2019年MP检出率分别为26.23%、31.36%、27.84%、26.57%,2017年检出率明显高于其他年份(χ^(2)=16.11,P<0.05)。女性患儿MP检出率为29.65%(1107/3733例),明显高于男性患儿的26.93%(1335/4958例)(χ^(2)=7.85,P<0.05)。夏秋季MP检出率分别为32.21%(726/2254例)、39.76%(852/2143例),明显高于春冬季的17.00%(327/1924例)、22.66%(537/2370例)(χ^(2)=315.15,P<0.001)。学龄前期和学龄期MP检出率分别为35.06%(732/2088例)、37.71%(1160/3076例),明显高于婴儿期和幼儿期[11.20%(232/2072例)、22.01%(318/1445例)](χ^(2)=509.89,P<0.001)。1524例行荧光PCR耐药基因检测的患儿中,1386例发生耐药基因突变,耐药率为90.94%。2016年至2019年MP耐药率分别为88.19%、90.93%、90.56%和92.90%。MP耐药率不受性别、年龄和季节的影响。结论MP四季均可检出,以夏秋季检出率最高;女性患儿检出率高于男性患儿;MP检出率随年龄的增加逐渐升高,学龄前期和学龄期检出率较高;MP耐药率居高不降。