为了研究CR1-like基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和拷贝数变异(copy number variation,CNV),分析CR1-like的基因与蛋白质表达量、基因与蛋白质分子质量之间的关系,试验选择41头长白猪,采用直接测序和等...为了研究CR1-like基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和拷贝数变异(copy number variation,CNV),分析CR1-like的基因与蛋白质表达量、基因与蛋白质分子质量之间的关系,试验选择41头长白猪,采用直接测序和等位基因特异性PCR(Allele-specific PCR,AS-PCR)技术检测了CR1-like基因的SNP;用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)技术和2-ΔΔCt相对定量分析方法检测了CR1-like基因的CNV,并利用一般线性模型(general linear model,GLM)和相关分析检验了CR1-like基因多态性与猪红细胞CR1-like蛋白质性状的关联性。结果表明:CR1-like基因存在CNV,且长白猪CR1-like基因以拷贝数正常为主,占总数的68.30%,拷贝数缺失占总数的31.70%,拷贝正常数和拷贝缺失数间差异极显著(P〈0.01);CR1-like基因外显子上检测到8个SNP位点,rs321524247和rs330380626符合哈代-温伯格平衡且处于完全连锁(D'=1,r2=1),其中单倍型AT为主要单倍型,频率为0.915。说明CR1-like基因拷贝数对猪红细胞CR1-like蛋白质表达量有极显著影响。展开更多
文摘为了研究CR1-like基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和拷贝数变异(copy number variation,CNV),分析CR1-like的基因与蛋白质表达量、基因与蛋白质分子质量之间的关系,试验选择41头长白猪,采用直接测序和等位基因特异性PCR(Allele-specific PCR,AS-PCR)技术检测了CR1-like基因的SNP;用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)技术和2-ΔΔCt相对定量分析方法检测了CR1-like基因的CNV,并利用一般线性模型(general linear model,GLM)和相关分析检验了CR1-like基因多态性与猪红细胞CR1-like蛋白质性状的关联性。结果表明:CR1-like基因存在CNV,且长白猪CR1-like基因以拷贝数正常为主,占总数的68.30%,拷贝数缺失占总数的31.70%,拷贝正常数和拷贝缺失数间差异极显著(P〈0.01);CR1-like基因外显子上检测到8个SNP位点,rs321524247和rs330380626符合哈代-温伯格平衡且处于完全连锁(D'=1,r2=1),其中单倍型AT为主要单倍型,频率为0.915。说明CR1-like基因拷贝数对猪红细胞CR1-like蛋白质表达量有极显著影响。