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扎伊尔埃博拉病毒糖蛋白泛MHC Ⅱ限制性表位预测及验证
1
作者
刘洋
孙昊
+5 位作者
陆振华
兰明福
许家豪
孙报增
姜东伯
杨琨
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期308-314,共7页
目的生物信息学预测获得埃博拉病毒(EBOV)糖蛋白泛主要组织相容性复合体Ⅱ(MHCⅡ)限制性优势表位,分析其特征并筛选鉴定可用于疫苗研制的候选对象。方法通过IEDB分析预测EBOV糖蛋白的优势表位,并对优势表位进行聚类分析,保守性分析和分...
目的生物信息学预测获得埃博拉病毒(EBOV)糖蛋白泛主要组织相容性复合体Ⅱ(MHCⅡ)限制性优势表位,分析其特征并筛选鉴定可用于疫苗研制的候选对象。方法通过IEDB分析预测EBOV糖蛋白的优势表位,并对优势表位进行聚类分析,保守性分析和分子对接。同时,利用编码糖蛋白DNA的质粒pVAX-GP免疫小鼠,酶联免疫斑点试验(ELISpot)验证预测获得的表位。结果在构成人群覆盖率达99%的人类白细胞抗原Ⅱ(HLAⅡ)超家族限制性15表位肽预测中筛选获得19个优势表位,H-2筛选获得13个优势表位。ELISpot结果显示pVAX-GP可诱导小鼠脾细胞产生针对合成优势表位的细胞免疫反应,其中表位LFLRATTELRTFSIL和GYYSTTIRYQATGFG在C3H小鼠体内具有显著激活细胞免疫反应的效果。保守性分析结果中存在种间和种内均保守的优势表位,不存在种内不保守而种间保守的优势表位。分子对接显示实验鉴定的两条优势表位可在人HLAⅡ类超家族分子中均可获得良好的对接分数,进一步肯定其在人群免疫中应用的可行性。结论多肽LFLRATTELRTFSIL和GYYSTTIRYQATGFG可作为EBOV表位疫苗的候选表位。
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关键词
扎伊尔埃博拉病毒(EBOV)
泛主要组织相溶性复合体Ⅱ(pan-MHCⅡ)限制性表位
表位预测
保守性分析
分子对接
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职称材料
题名
扎伊尔埃博拉病毒糖蛋白泛MHC Ⅱ限制性表位预测及验证
1
作者
刘洋
孙昊
陆振华
兰明福
许家豪
孙报增
姜东伯
杨琨
机构
空军军医大学基础医学院免疫学教研室
空军军医大学军事预防医学系军队防疫与流行病学教研室
出处
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期308-314,共7页
基金
国家自然科学基金(82073154,81772763)。
文摘
目的生物信息学预测获得埃博拉病毒(EBOV)糖蛋白泛主要组织相容性复合体Ⅱ(MHCⅡ)限制性优势表位,分析其特征并筛选鉴定可用于疫苗研制的候选对象。方法通过IEDB分析预测EBOV糖蛋白的优势表位,并对优势表位进行聚类分析,保守性分析和分子对接。同时,利用编码糖蛋白DNA的质粒pVAX-GP免疫小鼠,酶联免疫斑点试验(ELISpot)验证预测获得的表位。结果在构成人群覆盖率达99%的人类白细胞抗原Ⅱ(HLAⅡ)超家族限制性15表位肽预测中筛选获得19个优势表位,H-2筛选获得13个优势表位。ELISpot结果显示pVAX-GP可诱导小鼠脾细胞产生针对合成优势表位的细胞免疫反应,其中表位LFLRATTELRTFSIL和GYYSTTIRYQATGFG在C3H小鼠体内具有显著激活细胞免疫反应的效果。保守性分析结果中存在种间和种内均保守的优势表位,不存在种内不保守而种间保守的优势表位。分子对接显示实验鉴定的两条优势表位可在人HLAⅡ类超家族分子中均可获得良好的对接分数,进一步肯定其在人群免疫中应用的可行性。结论多肽LFLRATTELRTFSIL和GYYSTTIRYQATGFG可作为EBOV表位疫苗的候选表位。
关键词
扎伊尔埃博拉病毒(EBOV)
泛主要组织相溶性复合体Ⅱ(pan-MHCⅡ)限制性表位
表位预测
保守性分析
分子对接
Keywords
Zaire Ebola virus(EBOV)
pan-MHCⅡrestricted epitope
epitope prediction
conservation analysis
molecular docking
分类号
R373.9 [医药卫生—病原生物学]
R392.1 [医药卫生—免疫学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
扎伊尔埃博拉病毒糖蛋白泛MHC Ⅱ限制性表位预测及验证
刘洋
孙昊
陆振华
兰明福
许家豪
孙报增
姜东伯
杨琨
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
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