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盐胁迫下7个刺榆无性系的叶片转录组分析
1
作者
刘立江
王丽丽
+8 位作者
王宁
鲁仪增
董智
仝伯强
庄振杰
鞠丽睿
姜春君
关凌珊
胡颖慧
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2024年第5期136-147,共12页
[目的]从转录组水平上探究刺榆叶片对盐胁迫的响应机制,筛选耐盐基因。[方法]本研究以7个不同耐盐能力刺榆无性系的扦插苗为试验材料,对0、100、150、200 mmol·L^(-1) NaCl溶液处理15 d的叶片进行了转录组测序与分析。[结果](1)除...
[目的]从转录组水平上探究刺榆叶片对盐胁迫的响应机制,筛选耐盐基因。[方法]本研究以7个不同耐盐能力刺榆无性系的扦插苗为试验材料,对0、100、150、200 mmol·L^(-1) NaCl溶液处理15 d的叶片进行了转录组测序与分析。[结果](1)除DW1上调数量略多于下调数量外,其他无性系核心差异基因下调数量均多于上调数量,且各无性系在200 mmol·L^(-1)盐溶液处理时差异表达基因数量最多,对盐胁迫的响应最为强烈。GO富集分析显示细胞壁等功能类别基因对盐胁迫的响应较强。KEGG富集分析显示植物激素信号转导等代谢通路在7个无性系响应盐胁迫时发挥了重要作用。(2)强耐盐型的无性系DJ1、DJ3与弱耐盐型的无性系DW1、DY1在200 mmol·L^(-1)盐溶液处理时的4个对比组合共有的差异基因数量为1406个,共同上调基因393个、共同下调基因996个,其中脱落酸调节因子蛋白磷酸酶PP2C基因AHG1、ABI2,乙烯受体基因ERS1、ETR2,以及环核苷酸门控离子通道基因CNGC10和CNGC15可能与DJ1、DJ3较强的耐盐能力有关。[结论]盐胁迫引起刺榆转录水平上功能类别基因与代谢通路的响应,其中6个显著差异表达基因将作为候选耐盐基因。本研究为揭示刺榆响应盐胁迫的转录组特征与筛选耐盐基因提供了理论参考,为进一步开展刺榆种质资源的研究与应用奠定了基础。
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关键词
刺榆
盐胁迫
差异表达基因
实时荧光定量PCR
耐盐基因
下载PDF
职称材料
67份牡丹种质资源表型多样性分析及综合评价
被引量:
6
2
作者
孙燕
冯筱涵
+11 位作者
仝伯强
关凌珊
刘金石
穆艳娟
孙涛
鲁仪增
刘涛
刘鵾
刘瑞杰
程丹丹
于春凤
高德民
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第15期130-140,共11页
以67份代表性牡丹种质资源为研究对象,选取表型的24个质量性状和26个数量性状进行描述和测定,采用变异分析、聚类分析、相关性分析、主成分分析和表型性状综合评价方法,结合多样性指数,对牡丹表型性状进行多样性分析及综合评价。67份牡...
以67份代表性牡丹种质资源为研究对象,选取表型的24个质量性状和26个数量性状进行描述和测定,采用变异分析、聚类分析、相关性分析、主成分分析和表型性状综合评价方法,结合多样性指数,对牡丹表型性状进行多样性分析及综合评价。67份牡丹种质资源的表型呈现出变异类型多、变异程度高等特点,质量性状Shannon-weaver指数为0.183~1.860,数量性状变异系数为6.02%~37.41%,单果种子数变异系数(37.41%)最大。当欧氏距离为17.5时,67份种质资源可分为7个类群,其中类群Ⅱ的种质数量最多(37个),初步明确了各类群的主要特征性状,表明牡丹品种在表型性状上具明显差异,而各数量性状间大部分存在显著相关性。前8个主成分累积贡献率达到80.973%,可综合代表牡丹表型数据的大部分信息。针对油用、观赏、综合利用等不同用途进行评价,共筛选出10份最优种质。牡丹种质资源表型多样性高、变异类型丰富,为牡丹品种选育奠定了物质基础,期待筛选出的不同用途牡丹种质可为牡丹的开发利用及新品种选育提供参考。
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关键词
牡丹
种质资源
表型性状
多样性
综合评价
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职称材料
题名
盐胁迫下7个刺榆无性系的叶片转录组分析
1
作者
刘立江
王丽丽
王宁
鲁仪增
董智
仝伯强
庄振杰
鞠丽睿
姜春君
关凌珊
胡颖慧
机构
暖温带林草种质资源保存与利用国家林草局重点实验室、山东省林草种质资源中心
山东农业大学林学院
出处
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2024年第5期136-147,共12页
基金
山东省重点研发计划(重大科技创新工程)项目“珍贵用材树种种质资源挖掘与精准鉴定”(2021LZGC02304)。
文摘
[目的]从转录组水平上探究刺榆叶片对盐胁迫的响应机制,筛选耐盐基因。[方法]本研究以7个不同耐盐能力刺榆无性系的扦插苗为试验材料,对0、100、150、200 mmol·L^(-1) NaCl溶液处理15 d的叶片进行了转录组测序与分析。[结果](1)除DW1上调数量略多于下调数量外,其他无性系核心差异基因下调数量均多于上调数量,且各无性系在200 mmol·L^(-1)盐溶液处理时差异表达基因数量最多,对盐胁迫的响应最为强烈。GO富集分析显示细胞壁等功能类别基因对盐胁迫的响应较强。KEGG富集分析显示植物激素信号转导等代谢通路在7个无性系响应盐胁迫时发挥了重要作用。(2)强耐盐型的无性系DJ1、DJ3与弱耐盐型的无性系DW1、DY1在200 mmol·L^(-1)盐溶液处理时的4个对比组合共有的差异基因数量为1406个,共同上调基因393个、共同下调基因996个,其中脱落酸调节因子蛋白磷酸酶PP2C基因AHG1、ABI2,乙烯受体基因ERS1、ETR2,以及环核苷酸门控离子通道基因CNGC10和CNGC15可能与DJ1、DJ3较强的耐盐能力有关。[结论]盐胁迫引起刺榆转录水平上功能类别基因与代谢通路的响应,其中6个显著差异表达基因将作为候选耐盐基因。本研究为揭示刺榆响应盐胁迫的转录组特征与筛选耐盐基因提供了理论参考,为进一步开展刺榆种质资源的研究与应用奠定了基础。
关键词
刺榆
盐胁迫
差异表达基因
实时荧光定量PCR
耐盐基因
Keywords
Hemiptelea davidii
salt stress
differentially expressed genes
qRT-PCR
salt tolerance genes
分类号
S722 [农业科学—林木遗传育种]
下载PDF
职称材料
题名
67份牡丹种质资源表型多样性分析及综合评价
被引量:
6
2
作者
孙燕
冯筱涵
仝伯强
关凌珊
刘金石
穆艳娟
孙涛
鲁仪增
刘涛
刘鵾
刘瑞杰
程丹丹
于春凤
高德民
机构
山东中医药大学药学院
山东省林草种质资源中心
山东农业大学林学院
北京农学院园林学院
山东农业工程学院农业科技学院
齐鲁工业大学(山东省科学院菏泽分院)
甘肃济临牡丹科技产业有限公司
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第15期130-140,共11页
基金
鲁甘科技协作项目(编号:YDZX2021103)
山东省重点研发计划(农业良种工程)项目(编号:2020LZGC009)
山东省重点研发计划(编号:2021SFGC1205)。
文摘
以67份代表性牡丹种质资源为研究对象,选取表型的24个质量性状和26个数量性状进行描述和测定,采用变异分析、聚类分析、相关性分析、主成分分析和表型性状综合评价方法,结合多样性指数,对牡丹表型性状进行多样性分析及综合评价。67份牡丹种质资源的表型呈现出变异类型多、变异程度高等特点,质量性状Shannon-weaver指数为0.183~1.860,数量性状变异系数为6.02%~37.41%,单果种子数变异系数(37.41%)最大。当欧氏距离为17.5时,67份种质资源可分为7个类群,其中类群Ⅱ的种质数量最多(37个),初步明确了各类群的主要特征性状,表明牡丹品种在表型性状上具明显差异,而各数量性状间大部分存在显著相关性。前8个主成分累积贡献率达到80.973%,可综合代表牡丹表型数据的大部分信息。针对油用、观赏、综合利用等不同用途进行评价,共筛选出10份最优种质。牡丹种质资源表型多样性高、变异类型丰富,为牡丹品种选育奠定了物质基础,期待筛选出的不同用途牡丹种质可为牡丹的开发利用及新品种选育提供参考。
关键词
牡丹
种质资源
表型性状
多样性
综合评价
分类号
S685.110.2 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
盐胁迫下7个刺榆无性系的叶片转录组分析
刘立江
王丽丽
王宁
鲁仪增
董智
仝伯强
庄振杰
鞠丽睿
姜春君
关凌珊
胡颖慧
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
67份牡丹种质资源表型多样性分析及综合评价
孙燕
冯筱涵
仝伯强
关凌珊
刘金石
穆艳娟
孙涛
鲁仪增
刘涛
刘鵾
刘瑞杰
程丹丹
于春凤
高德民
《江苏农业科学》
北大核心
2023
6
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职称材料
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