广东省巴戟天DNA条形码及遗传多样性分析

目的构建广东省巴戟天DNA条形码数据库以及研究广东省不同产地巴戟天的遗传多样性。方法采用DNA条形码技术对149个巴戟天样本进行分析,构建DNA条形码数据库。利用ISSR分子标记技术对广东省8个居群的巴戟天进行遗传多样性分析。结果巴戟天五个通用条形码的PCR测序成功率为psbA-trnH>rbcL>matK>ITS2>ITS,149个巴戟天样本建立了含有569条序列的数据库。研究筛选出6条ISSR引物,从巴戟天中扩增得80条条带,多态性比率为92.50%,遗传相似系数在0.5625-0.8910,表明广东省巴戟天的遗传多样性较高。ISSR标记揭示的PCoA结果、UPGMA聚类分析结果一致,八个居群分为两大支。结论广东省巴戟天具有较高的遗传多样性。

21种广东省珍稀保护药用植物的DNA条形码分析

目的研究广东省珍稀濒危药用植物和国家重点保护药用植物的DNA条形码,构建条形码数据库,为广东省珍稀保护药用植物分子鉴定提供依据。方法野外采集目标植物叶片,硅胶干燥保存。采取试剂盒法提取样品基因组DNA,扩增ITS2、psbA-trnH、ITS、matK、rbcL、ycf1等6种DNA条形码,Sanger法进行双向测序。对双向拼接后的序列进行测序成功率、序列特征和BLAST鉴定情况统计。结果共搜集广东省珍稀保护药用植物21种182份,经测序获得条形码543条,各条形码在全部样品中的测序成功率比较:psbA-trnH>rbcL>ITS2>matK>ycf1>ITS,在物种水平的BLAST鉴定成功率比较:psbA-trnH>ITS>ycf1>matK>ITS2>rbcL。同时统计各条形码在蕨类、裸子及被子植物等不同分类阶元中的相应数据。结论综合测序成功率和BLAST鉴定成功率的结果,psbA-trnH条形码表现最好,为最适用于鉴定广东省珍稀保护药用植物的DNA条形码。同时,该研究构建了广东省珍稀保护药用植物DNA条形码数据库,为这些物种的分子鉴定奠定基础。