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基于长短时记忆神经网络的手足口病发病趋势预测 被引量:10
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作者 马停停 冀天娇 +3 位作者 杨冠羽 陈阳 许文波 刘宏图 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2021年第1期265-269,共5页
针对传统手足口病(HFMD)发病趋势预测算法预测精度不高、未结合其他影响因素、预测时间较短等问题,提出结合气象因素使用长短时记忆(LSTM)网络进行长期预测的方法。首先,将发病序列通过滑动窗口的方式转化为网络的输入和输出;然后采用L... 针对传统手足口病(HFMD)发病趋势预测算法预测精度不高、未结合其他影响因素、预测时间较短等问题,提出结合气象因素使用长短时记忆(LSTM)网络进行长期预测的方法。首先,将发病序列通过滑动窗口的方式转化为网络的输入和输出;然后采用LSTM网络进行数据建模和预测,并使用迭代预测的方式获得较长期的预测结果;最后在网络中增加温度和湿度变量,比较这些变量对预测结果的影响。实验结果表明,加入气象因素能够提高模型的预测精度,所提模型在济南市数据集上的平均绝对误差(MAE)为74.9,在广州市数据集上的MAE为427.7,相较于常用的季节性差分自回归移动平均(SARIMA)模型和支持向量回归(SVR)模型,该模型的预测准确率更高。可见所提模型是HFMD发病趋势预测的一种有效的实验方法。 展开更多
关键词 手足口病 时间序列 相关分析 长短时记忆网络 传染病预测
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阜阳市2008~2016年手足口病流行病学及病原学特征分析 被引量:18
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作者 马婉婉 吴家兵 +9 位作者 孙良 许文波 龚磊 陈芳 冀天娇 史永林 万俊峰 陈国平 宋丹丹 李李 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2018年第12期1898-1902,共5页
目的分析手足口病(HFMD)的流行病学特征及病原谱变化,为减少重症和死亡病例所采取的控制措施提供科学依据。方法采用描述流行病学方法对阜阳市2008~2016年HFMD监测数据进行分析,用Real-time PCR法对HFMD标本进行肠道病毒核酸检测和分... 目的分析手足口病(HFMD)的流行病学特征及病原谱变化,为减少重症和死亡病例所采取的控制措施提供科学依据。方法采用描述流行病学方法对阜阳市2008~2016年HFMD监测数据进行分析,用Real-time PCR法对HFMD标本进行肠道病毒核酸检测和分型鉴定。结果2008~2016年阜阳市累计报告HFMD 184 133例,重症1 504例,死亡40例;发病呈双峰分布特点,4~7月为流行主高峰,10~12月为小高峰;年均发病率排在前3位的是颍州区、颍泉区和颍东区;发病以散居儿童为主,5岁以下儿童占94. 20%,男女性别比为1. 67∶1,比例呈逐年下降趋势;实验室诊断病例中EV-A71占50. 94%,CV-A16占9. 25%,其他肠道病毒占39. 81%;不同年份优势病原呈现动态变化,其他肠道病毒取代EV-A71成为近两年的优势病原;当EVA71为优势病原时,重症和死亡病例的比重增加,EV-A71仍是导致重症和死亡病例的绝对优势病原。结论阜阳市HFMD发病呈现明显的季节、人群和地区分布,病原谱不断变化。应加强实验室检测,根据病原构成动态变化对重点县区和人群采取针对性防控措施。 展开更多
关键词 手足口病 流行病学 病原学
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2012-2023年882例重症手足口病病例病原谱及CV-A6基因特征分析
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作者 路环环 肖金波 +4 位作者 严冬梅 冀天娇 杨倩 祝双利 张勇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期383-391,共9页
为了解重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)病原谱变化情况以及重症HFMD相关柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6, CVA6)的基因特征,本研究收集了2012-2023年各省级HFMD监测网络实验室送检的882份重症HFMD病例病毒分离物,... 为了解重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)病原谱变化情况以及重症HFMD相关柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6, CVA6)的基因特征,本研究收集了2012-2023年各省级HFMD监测网络实验室送检的882份重症HFMD病例病毒分离物,通过扩增病毒的VP1编码区进行分子分型以确定肠道病毒的血清型,并对其中的CVA6进行全长VP1区扩增和核苷酸序列测定分析,进行最大似然法系统进化树和氨基酸置换熵值等生物信息学分析。结果发现,2018年开始,以CVA6和CVA10为主的肠道病毒逐渐取代EV-A71和CV-A16成为导致重症HFMD的主要病原体,在每年检出的病原体中的比例均超过50.0%。除2013年重症HFMD中分离的CVA6属于D2基因亚型外,2013年后重症HFMD中分离的CVA6均属于D3a基因亚型,但2019年以后分离的CVA6序列与以往分离株序列的进化距离明显增大。此外,针对氨基酸位点的置换熵值研究表明,参与构成构象表位的VP1-283易发生突变,该位点从2017年开始由亲水的苏氨酸突变成疏水的丙氨酸,导致其可能分别与VP3-57N、VP3-66R之间形成氢键,这可能会影响到病毒的感染过程。本研究明确了2012-2023年中国重症HFMD病原谱的变化特征,探究了导致重症HFMD的CVA6的进化特点以及重要氨基酸变异特征,为重症HFMD的预防控制策略的制定提供了理论依据。 展开更多
关键词 重症手足口病 病原谱 柯萨奇病毒A组6型 系统进化 氨基酸置换熵值
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新型冠状病毒Omicron BA.4/5变异株RBD-Fc蛋白的表达及其免疫效果的评价 被引量:1
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作者 时雨晴 李海 +12 位作者 宋洋 任虎 祝双利 冀天娇 胡宏俏 曹蕾 赵建楠 郭宏 黄星湖 江洁 张燕 李栋 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期620-630,共11页
本研究针对新冠病毒Omicron BA.4/5的受体结合域(Receptor binding domain, RBD)构建一个连接Fc受体的二聚体蛋白BA.4/5-RBD-Fc(BRF)并评价其免疫原性。结果显示,两种佐剂组小鼠的二免后血清均可产生高滴度的IgG抗体且显著高于一免后血... 本研究针对新冠病毒Omicron BA.4/5的受体结合域(Receptor binding domain, RBD)构建一个连接Fc受体的二聚体蛋白BA.4/5-RBD-Fc(BRF)并评价其免疫原性。结果显示,两种佐剂组小鼠的二免后血清均可产生高滴度的IgG抗体且显著高于一免后血清(P<0.0001),BRF+AlOH/CpG组小鼠血清产生较为平衡的IgG1和IgG2a抗体应答,而BRF+BFA03组小鼠血清能产生更多的偏向Th2应答的IgG1抗体,且IgG1/IgG2a比值显著高于BRF+AlOH/CpG组(P<0.0001)。BRF+AlOH/CpG组产生的Th1应答的细胞因子干扰素γ(Interferon-γ,IFN-γ)高于BRF+BFA03组(P<0.01),而产生的Th2应答细胞因子白介素4(Interleukin-4,IL-4)IL-4显著低于BRF+BFA03组(P<0.01)。BRF蛋白结合不同佐剂两次免疫小鼠后的血清均可以有效中和目前Omicron主要的流行亚型BA.2与BA.4活病毒,产生高达19 334 598和17 224 096的中和抗体滴度。因此,BRF蛋白诱导小鼠血清产生的中和抗体针对Omicron系列变异株具有一定的广谱性,AlOH/CpG佐剂可以使BRF蛋白产生偏向Th1的免疫应答反应,而BFA03佐剂产生明显偏向Th2的免疫应答反应。本研究为新冠Omicron变异株亚单位疫苗的研发提供有效的科学依据。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 RBD蛋白 FC受体 佐剂 免疫效果
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2023年5月中国需关注的突发公共卫生事件风险评估 被引量:1
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作者 笃梦雪 涂文校 +5 位作者 冯晔囡 刘斯宇 王霄晔 冀天娇 施国庆 向妮娟 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期507-510,共4页
目的评估2023年5月在我国(不含香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同)发生或者可能由境外输入的突发公共卫生事件风险。方法根据国内外突发公共卫生事件报告及重点传染病监测等各种资料和部门通报信息,采用专家会商法,并通过视频会议形... 目的评估2023年5月在我国(不含香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同)发生或者可能由境外输入的突发公共卫生事件风险。方法根据国内外突发公共卫生事件报告及重点传染病监测等各种资料和部门通报信息,采用专家会商法,并通过视频会议形式邀请省(自治区、直辖市)疾病预防控制中心专家参与评估。结果预计2023年5月突发公共卫生事件报告数可能较4月增多,以新型冠状病毒感染、水痘、诺如病毒肠炎和手足口病等传染病类事件为主。我国本土新型冠状病毒感染疫情在2023年4月上旬达到2022年11月以来的最低水平,4月中下旬疫情开始出现上升趋势,XBB进化分支病毒已成为我国疫情主要流行株,预计再感染疫情将逐渐增多,但出现对医疗和社会冲击的规模性疫情可能性则较小。目前全国手足口病整体疫情处于快速上升初期,预计5月疫情将上升。根据既往趋势预测,5月开始进入食物中毒事件高发期。结论对新型冠状病毒感染予以特别关注,对食物中毒和手足口病予以一般关注。 展开更多
关键词 突发公共卫生事件 传染病疫情 风险评估
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CpG联合铝佐剂增强RBD-Fc重组蛋白诱导小鼠免疫反应效果的研究
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作者 任虎 何远薇 +7 位作者 张亚楠 李海 郭晋源 张燕 祝双利 冀天娇 曹蕾 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1549-1560,共12页
由严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)引起的2019冠状病毒病(Coronavirus disease 2019,COVID-19)大流行对全球健康和经济构成了严重威胁,SARS-CoV-2关切变异株(Variants of... 由严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)引起的2019冠状病毒病(Coronavirus disease 2019,COVID-19)大流行对全球健康和经济构成了严重威胁,SARS-CoV-2关切变异株(Variants of concern,VOCs)的出现更增加了疫苗研发的难度,因此,优化设计对突变株具有广谱免疫反应的疫苗显得尤为重要。本研究选取具有大量显性中和表位的受体结合域(Receptor-binding domain,RBD)蛋白作为目标抗原,在SARS-CoV-2经典株RBD序列的基础上引入多个VOCs的关键突变位点,将其与人IgG1 Fc片段融合表达,并结合CpG单佐剂、氢氧化铝单佐剂或CpG与氢氧化铝复合佐剂两剂次免疫小鼠,比较CpG联合铝佐剂相比单独使用铝或CpG佐剂诱导细胞免疫和体液免疫反应的增强作用,同时观察小鼠产生抗不同VOCs活病毒的交叉中和抗体滴度。结果显示,与单佐剂相比,RBD-Fc蛋白结合CpG与氢氧化铝复合佐剂免疫小鼠可产生最高的IgG结合抗体及高水平Th1偏向的细胞免疫应答。同时,小鼠血清还可以有效地中和SARS-CoV-2贝塔株(GMT:11143)、德尔塔株(GMT:4850)、经典株(GMT:3675),甚至是奥密克戎BA.1株(GMT:1393)和BA.5株(GMT:459)的感染。这些结果表明含有突变位点的SARS-CoV-2 RBD-Fc重组蛋白具有良好的潜力,联合使用CpG和铝佐剂可明显提高和平衡小鼠的细胞免疫反应,产生对不同SARS-CoV-2高滴度的交叉中和抗体,可作为一种广谱疫苗进一步研究和开发。 展开更多
关键词 RBD-Fc 佐剂 体液免疫 细胞免疫 交叉中和抗体
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2009-2019年中国大陆柯萨奇病毒A14型基因特征分析
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作者 于力恒 郭琴 +14 位作者 卫海燕 童文彬 刘莹莹 祝双利 王东艳 杨倩 冀天娇 肖金波 路环环 刘莹 李冀琛 王雯慧 张勇 许文波 严冬梅 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1570-1577,共8页
柯萨奇病毒A14型属于肠道病毒A组,可引起手足口病和无菌性脑膜炎等疾病,但目前全球对CVA14的分子流行病学研究较少,尚无对CVA14基于全长VP1区进行明确分型的相关研究。因得到中国手足口病监测网络的技术支持,本研究获得2009-2019年在中... 柯萨奇病毒A14型属于肠道病毒A组,可引起手足口病和无菌性脑膜炎等疾病,但目前全球对CVA14的分子流行病学研究较少,尚无对CVA14基于全长VP1区进行明确分型的相关研究。因得到中国手足口病监测网络的技术支持,本研究获得2009-2019年在中国大陆分离到的15株CVA14,应用RT-PCR对其全长VP1区进行扩增、测序和分析,并与GenBank中下载的22条CVA14全长VP1序列共同构建系统发育树。结果显示,2009-2019年中国大陆分离的15株CVA14与原型株G-14的核苷酸与氨基酸相似性分别为81.8%~82.9%与95.6%~96.9%,15株CVA14之间的核苷酸与氨基酸相似性分别为91.7%~99.7%与98.3%~100%。中国大陆所有的22条CVA14序列之间的核苷酸与氨基酸相似性分别为91.7%~100.0%与98.3%~100.0%。中国大陆所有的CVA14与国外8条CVA14序列之间的核苷酸与氨基酸相似性分别为80.7%~86.0%与94.9%~97.9%。基于全长VP1系统发育树,全球CVA14可划分为A-G七个基因型,目前全球范围内流行的CVA14的基因型主要为G基因型,中国大陆流行的基因型全部为G基因型。本研究建立了全球CVA14基于全长VP1的基因分型方法,揭示了CVA14在中国大陆及全球范围内的分子流行特征,为CVA14的致病机制研究提供了分子流行病学方面的基础。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A14型(CVA14) 手足口病(HFMD) 基因型 分子流行病学
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中国内地地区埃可病毒25型全基因组进化与重组分析
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作者 王晓艺 李世康 +12 位作者 寸建萍 施勇 刘莹莹 卫海燕 张勇 王雯慧 肖金波 宋洋 严冬梅 杨倩 孙强 冀天娇 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1008-1016,共9页
埃可病毒25型(Echovirus 25,E25)属于肠道病毒B组(Enterovirus B,EV⁃B),其在临床上可引起包括手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD),无菌性脑膜炎(Aseptic meningitis,AM),急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)等在内的... 埃可病毒25型(Echovirus 25,E25)属于肠道病毒B组(Enterovirus B,EV⁃B),其在临床上可引起包括手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD),无菌性脑膜炎(Aseptic meningitis,AM),急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)等在内的多种疾病。本文从全国HFMD监测网络选取了2009⁃2018年的18株E25毒株进行全基因组测序,将所得全长序列及GenBank上目前已发表的E25全长序列,以及EV⁃B组其它原型株全长序列分别构建全基因组和各编码区的亲缘进化树,并依据不同进化分支选取具有代表性的两株E25毒株进行重组分析。结果显示,中国内地地区E25在P1区具有更高的亲缘关系,而P2和P3区建树中各出现了两个分支,且在每个分支上,与多个EV⁃B组的原型株具有较高的核苷酸同源性,提示E25可能存在多种重组模式。此外所选的两株毒株均与EV⁃B的其它血清型流行株在P2及P3不同区域发生重组,且重组的模式不相同,因此中国内地地区的E25至少存在两种重组模式,并且致病力可能与基因的重组有关。通过本研究的分析,进一步的揭示中国内地地区E25的重组特征,对其进化变异及后续的预防与治疗具有重要意义。 展开更多
关键词 埃可病毒25型 全基因组 基因重组
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2017-2018重庆市手足口病病原谱及主要病原体基因特征分析
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作者 王雯慧 王江峡 +13 位作者 许红梅 张勇 孙强 何云 郭琴 王晓艺 路环环 肖金波 赵鹤鹤 韩振志 严冬梅 许文波 冀天娇 张乐 《国际病毒学杂志》 2023年第5期393-399,共7页
目的分析2017—2018年重庆地区手足口病病原谱及其主要病原体的基因特征。方法选择重庆市儿童医院作为研究对象,收集并整理该院区2017—2018年1071例诊断为手足口病患者的核酸检测信息,其中810份已明确了肠道病毒血清型,剩余175份血清... 目的分析2017—2018年重庆地区手足口病病原谱及其主要病原体的基因特征。方法选择重庆市儿童医院作为研究对象,收集并整理该院区2017—2018年1071例诊断为手足口病患者的核酸检测信息,其中810份已明确了肠道病毒血清型,剩余175份血清型待鉴定,另有86份肠道病毒为阴性。通过病毒分离、核酸浓缩及基因测序等方法对上述261份样本进行鉴定,获得该地区手足口病完整的病原谱。使用MEGA 7.0软件构建四种主要病原体的系统进化树,进行基因特征的研究。结果通过改良的鉴定方法,261份标本中,除3份被鉴定为人副肠孤病毒(Human parechovirus,HPeV)外,其余258份样本均为肠道病毒阳性。其中CVA6(coxsackievirus A6)血清型占比最多,其次为EV-A71(enterovirus A71)另有CVA16(coxsackievirus A16)和CVA10(coxsackievirus A10)以及其他肠道病毒共计13种血清型。系统进化结果显示,重庆市CVA6血清型均为D3a基因亚型,EV-A71、CVA10和CVA16的优势基因亚型分别为C4a,C2b和B1b,这四种优势基因型与全国其他地区的基因型共同循环进化。结论本研究通过优化鉴定方法,提高了肠道病毒的检出率,进一步明确了重庆地区手足口病病原谱构成,CVA6是该地区2017—2018年手足口病的主要病原体,其次是EV-A71,同时这两种血清型也是导致重庆地区重症手足口病主要的病原体。 展开更多
关键词 手足口病 病原谱 VP1基因
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广东省2008~2015年手足口病流行病学特征及病原学监测分析 被引量:65
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作者 冀天娇 谭小华 +7 位作者 刘冷 顾新蕊 刘俐 郑焕英 曾汉日 杨倩 李晖 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期713-720,共8页
为阐明广东省手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的流行病学特征及病原学构成,探索全省HFMD发病风险变化的趋势。本研究利用广东省2008-2015年HFMD监测数据、人口数据和地理资料,采用描述流行病学方法,对全省的HFMD发病趋势... 为阐明广东省手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的流行病学特征及病原学构成,探索全省HFMD发病风险变化的趋势。本研究利用广东省2008-2015年HFMD监测数据、人口数据和地理资料,采用描述流行病学方法,对全省的HFMD发病趋势、人群分布特征以及病原构成等进行了系统分析。结果显示:广东省2008-2015HFMD报告人数2 133 722,重症人数5 066,死亡人数259;各地市均有不同严重程度的病例报道,尤以珠三角区域为重点高发区域;发病曲线呈双峰分布,春夏季是主高峰,秋季是次高峰;5岁以下儿童在全部发病人群、重症及死亡病例中比例分别为90.58%、95.93%和97.30%,其中3岁以下年龄组分别占65.24%、77.32%和81.85%;男性高发于女性。不同年份和不同季节的优势病原呈现动态变化,2009年主要以CV-A16流行为主;2013和2015年以非EV-A71非CV-A16其他肠道病毒为主,特别是2015年,其他EV占71.97%;但EV-A71一直是导致广东省重症病例和死亡病例的优势病原和绝对优势病原。本研究提示应继续加强广东省HFMD流行病和实验室监测,为广东省进一步完善HFMD防控策略提供科学数据支持。 展开更多
关键词 手足口病 流行病学特征 病原学监测 广东省
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2018~2020年广西边境地区手足口病流行特征及病原学分析 被引量:3
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作者 冀天娇 居昱 +6 位作者 程文隽 陈敏玫 张勇 肖金波 张珂艺 刘宏图 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期591-599,共9页
手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)是一种由肠道病毒引起的儿童常见传染病,近年来在亚太地区尤其是东南亚地区发生了多起HFMD的大暴发,而我国广西壮族自治区与越南接壤,往来密切。为了解其边境地区HFMD的流行概况和病原学构成... 手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)是一种由肠道病毒引起的儿童常见传染病,近年来在亚太地区尤其是东南亚地区发生了多起HFMD的大暴发,而我国广西壮族自治区与越南接壤,往来密切。为了解其边境地区HFMD的流行概况和病原学构成,比较该地区病原优势基因型与相邻地区的变异与进化关系。本研究选取与越南接壤的百色、崇左、防城港作为研究对象,收集其2018-2020年HFMD疫情资料进行流行病学分析,并随机采集这三个地市的375份手足口病患儿的临床标本进行荧光定量PCR鉴定,对阳性毒株进行VP1编码区基因扩增及测定,获得的序列与GenBank上下载的各基因型/亚型的代表序列构建系统发生树。结果显示2018-2020年,广西边境地区的报告发病数、重症数、重症比例(重症/发病)和重症率均呈下降趋势,5岁以下儿童为主要发病人群,除2020年以外,其发病流行曲线呈典型的双峰分布。病原谱分析显示,整体上以其他EV为优势循环血清型,且CVA6、CVA16、CVA10和EVA71为该地区的优势病原。同时,2018-2020年期间广西边境流行的EVA71、CVA16、CVA6和CVA10的优势基因亚型分别为C4a、B1b、D3a和C2,且与东南亚临近国家同基因型的流行株具有较近的亲缘关系,提示病毒共同循环进化。而边境地区环境复杂、人员往来密切,因此加强边境地区手足口病的监测及预警系统的建设是西南边境地区手足口病防控的关键。 展开更多
关键词 手足口病 边境地区 流行特征 病原学特点
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陕西省2010-2012年柯萨奇病毒A组16型VP1基因特征分析 被引量:2
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作者 冀天娇 关路媛 +5 位作者 檀晓娟 徐艺 张宝敏 王敬军 余鹏博 许文波 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2014年第3期181-183,共3页
目的 对陕西省2010-2012年来源于手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例的科萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CVA16)毒株的VP1基因特征进行分析,以阐明其分子流行病学特征.方法 利用特异性引物对分离鉴定为CVA16的21... 目的 对陕西省2010-2012年来源于手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例的科萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CVA16)毒株的VP1基因特征进行分析,以阐明其分子流行病学特征.方法 利用特异性引物对分离鉴定为CVA16的21株病毒进行VP1编码区扩增.对阳性产物进行序列测定,并用MEGA软件进行序列的生物信息学分析.结果 根据亲缘性分析,本研究的CVA16分别属于B1a和B1b基因亚型,其中仅2011年分离自宝鸡市的10株属于B1a基因亚型,分离自其他4个地市的11株则属于B1b基因亚型.B1a和B1b基因亚型内核苷酸序列同源性分别为99.9% ~100%和92.93% ~ 100%.不同基因亚型毒株间核苷酸序列差异为8.43%~9.45%.结论 2010-2012年,属于B1a和B1b基因亚型的CVA16在陕西省共同循环,其中B1b基因亚型流行范围较广,可能为陕西省的优势亚型. 展开更多
关键词 手足口病 科萨奇病毒感染 流行病学分子
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疫苗接种人群和安慰剂人群肠道病毒A71型基因特征分析 被引量:1
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作者 冀天娇 胡雅灵 +8 位作者 祝双利 檀晓娟 张宝敏 郑鹏 王二强 孔凡胜 陈江婷 宋俐霏 许文波 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2016年第1期1-5,9,共6页
目的 分析比较健康人群接种肠道病毒A71型(Enterovirus A71,EV-A71)灭活疫苗和安慰剂后EV-A71感染的基因特征。方法 按照1∶1配对的病例对照研究,统计比较接种组和安慰剂组人群中EV-A71导致相关疾病流行病学差异;利用Sequencher 5.0和... 目的 分析比较健康人群接种肠道病毒A71型(Enterovirus A71,EV-A71)灭活疫苗和安慰剂后EV-A71感染的基因特征。方法 按照1∶1配对的病例对照研究,统计比较接种组和安慰剂组人群中EV-A71导致相关疾病流行病学差异;利用Sequencher 5.0和MEG5.0等生物信息学软件分析不同组别的EV-A71的VP1区核苷酸和氨基酸差异,获得不同人群中EV-A71的分子流行病学特征。结果 本研究共有接种组病例13例(0.3%),安慰剂组106例(2.1%);EV-A71相关疾病发生呈现夏季和冬季两个高峰,主高峰集中在夏季(4~7月),次高峰集中在冬季(11~12月),以安慰剂组人群为主。所有EV-A71毒株与中国2007年以来其他省代表毒株相同,属于C4a亚型;各序列同源性较高,其核苷酸同源性为95.16%~100%,氨基酸同源性为96.94%~100%,与周边省市近3年序列亲缘关系较相近。结论 本研究安慰剂组人群中EV-A71除夏季流行外,在冬季仍有少量EV-A71的循环传播;EV-A71仍为C4a亚型且同源性较高,与周边省市的C4a亚型序列存在共同进化关系。 展开更多
关键词 肠道病毒A71型 肠道病毒A71型灭活疫苗 安慰剂 基因型
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2009—2017年浙江省手足口病流行病学特征及病原学监测分析 被引量:53
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作者 王笑笑 蔡剑 +4 位作者 韩桃利 王琦梅 曹艳丽 葛琼 冀天娇 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2019年第1期1-5,共5页
目的分析浙江省2009-2017年手足口病流行病学特征和病原学监测结果,为手足口病的防控提供科学依据。方法运用描述流行病学方法分析手足口病在浙江省的三间分布特征,运用荧光定量逆转录聚合酶链反应的方法对标本进行检测。结果2009-2017... 目的分析浙江省2009-2017年手足口病流行病学特征和病原学监测结果,为手足口病的防控提供科学依据。方法运用描述流行病学方法分析手足口病在浙江省的三间分布特征,运用荧光定量逆转录聚合酶链反应的方法对标本进行检测。结果2009-2017年,浙江省共累计报告手足口病病例1108093例,年平均发病率226.24/10万。浙江省手足口病呈周期性流行,2010、2012,2014和2016年的发病水平高于其他年份。4~7月份呈现发病主高峰.秋冬呈现次高峰。温州、台州和宁波等地市的手足口病发病水平高于其他地市。1~3岁儿童发病占65.67%,散居儿童占69.27%。病原学监测数据显示轻症手足口病病例肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)所占比例呈下降趋势,非EV-A71、非柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)的其他肠道病毒明显升高,重症和死亡病例仍以EV-A71为主(56.3%)。结论浙江省手足口病的地区、季节和人群特征明显,近年来轻症病例以非EV-A71、非CV-A16的其他肠道病毒为主,重症和死亡病例以EVA71病原为主。持续的病原学监测有助于掌握优势病原型别,从而为防控提供依据。 展开更多
关键词 手足口病 流行病学特征 病原学监测
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2008~2017年安徽省手足口病重症病例流行病学及病原学分析 被引量:19
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作者 杨倩 史永林 +9 位作者 葛盈露 马婉婉 陈国平 吴家兵 张勇 张燕 严冬梅 冀天娇 张曼 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期461-466,共6页
手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)为自限性疾病,但部分病例会发展成重症,甚至死亡。目前部分省份已经针对HFMD重症病例展开研究。本研究基于2008~2017年安徽省HFMD重症病例的监测数据、人口数据和地理资料,采用描述性流行... 手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)为自限性疾病,但部分病例会发展成重症,甚至死亡。目前部分省份已经针对HFMD重症病例展开研究。本研究基于2008~2017年安徽省HFMD重症病例的监测数据、人口数据和地理资料,采用描述性流行病学方法对安徽省HFMD重症病例的流行病学及病原学构成进行系统分析。结果显示:2008~2017年,安徽省累计报告HFMD重症病例共4 738例,在全国排名第11位,其中死亡病例147例,在全国排名第9位。2008~2017年,安徽省各个地市均有HFMD重症病例报道,尤其以皖北地区为重点高发地区。流行病学分析提示,夏季为发病主高峰,秋冬季为次高峰,2008~2017年安徽省HFMD重症病例最主要的发病人群为5岁以下散居儿童,且男性多于女性。肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)仍是引起HFMD重症病例的绝对优势病原体,占全部重症病例的84.09%。本研究提示安徽省HFMD重症病例发病分布呈现明显季节性和地区差异以及特定人群高发。今后应继续加强安徽省HFMD重症病例流行病学与实验室监测,在高发季节,针对HFMD重症病例高发人群,采取积极有效干预措施,以降低重症病死率。 展开更多
关键词 手足口病(HFMD) 重症病例 流行病学 病原学
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陕西省急性弛缓性麻痹病例中柯萨奇病毒A组4型的基因特征 被引量:14
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作者 王东艳 徐艺 +7 位作者 张勇 祝双利 司源 严冬梅 朱晖 杨倩 冀天娇 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期145-149,共5页
阐明从陕西省2006~2010年急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例中分离的柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CV-A4)VP1编码区的基因特征,探索其在我国流行的优势基因型及其与AFP病例之间的关系。本研究通过逆转录-聚... 阐明从陕西省2006~2010年急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例中分离的柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CV-A4)VP1编码区的基因特征,探索其在我国流行的优势基因型及其与AFP病例之间的关系。本研究通过逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)对连续5年从AFP病例中分离的68株非脊灰肠道病毒(non-polio enteroviruses,NPEVs)进行分子定型,其中7株鉴定为CV-A4(7/68,10.3%);使用特异性引物扩增CV-A4VP1编码区并进行核苷酸序列测定分析和基因进化分析,将CV-A4划分为A(基因组1)、B(基因组2)和C三个基因型,其中C基因型又划分为C1(基因组3)和C2(基因组4)两个基因亚型。中国分离的CV-A4均位于第4基因组,属于C2基因亚型,提示其可能为中国大陆CV-A4的优势基因亚型;7株陕西CV-A4毒株依据分离年代的不同位于不同的三个小进化分支里,且和来自山东和吉林两省的邻近年份的CV-A4毒株位于同一小分支,提示7株陕西CV-A4分离株和它们存在共同进化和共循环。在无脊髓灰质炎时代应进一步加强监测CV-A4在AFP病例NPEV所占的比例和动态变化。 展开更多
关键词 急性弛缓性麻痹病例 柯萨奇病毒A组4型 亲缘关系进化树 优势基因型
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柯萨奇病毒A组2型江苏分离株(JS16-80)全基因组序列分析 被引量:4
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作者 杨倩 严冬梅 +5 位作者 张勇 樊欢 嵇红 冀天娇 宋洋 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期512-518,共7页
柯萨奇病毒A组2型(CV-A2)是引起手足口病和疱疹性咽峡炎暴发流行的重要病原体。本文选取中国大陆流行的D基因型代表毒株JS16-80/JS/CHN/2016(简写JS16-80)进行全基因组序列测定和分析,了解其基因特征,并进行重组和进化分析。结果提示,JS... 柯萨奇病毒A组2型(CV-A2)是引起手足口病和疱疹性咽峡炎暴发流行的重要病原体。本文选取中国大陆流行的D基因型代表毒株JS16-80/JS/CHN/2016(简写JS16-80)进行全基因组序列测定和分析,了解其基因特征,并进行重组和进化分析。结果提示,JS16-80在非结构蛋白P2和P3多区段均有出现重组现象,并且多个A组肠道病毒血清型参与了非结构蛋白的重组。本研究可帮助了解CV-A2的全基因组特征和重组特点,进一步为CV-A2重组对其进化和潜在致病力的影响提供基础数据。 展开更多
关键词 手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒A组2型(CV-A2) 全基因组序列 基因重组
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2012~2016年新疆柯萨奇病毒A6的分子流行病学特征分析 被引量:4
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作者 邓红 冀天娇 +7 位作者 黄永迪 韩桃利 张璇 宋欣欣 赵俊 阿依古丽·伊尔哈力 王凤英 岳锡宏 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期839-843,共5页
分析新疆手足口病相关的柯萨奇病毒A6(Coxsackievirus A6,CV-A6)毒株VP1区基因特征。2012~2016年从新疆手足口病病例标本中分离到75株CV-A6,对75株CV-A6采用RT-PCR方法扩增VP1区基因片段并进行核苷酸序列测定,应用MEGA5.05和BioEdit7.... 分析新疆手足口病相关的柯萨奇病毒A6(Coxsackievirus A6,CV-A6)毒株VP1区基因特征。2012~2016年从新疆手足口病病例标本中分离到75株CV-A6,对75株CV-A6采用RT-PCR方法扩增VP1区基因片段并进行核苷酸序列测定,应用MEGA5.05和BioEdit7.1.9软件进行核苷酸序列比对分析,构建系统进化树。75株新疆CV-A6毒株VP1区核苷酸序列同源性为86.9%~100%,与原型株(Gdula)同源性为81.4%~82.5%;71株D3亚型株与D3代表株之间核苷酸序列同源性为93.1%~99.6%;4株D2亚型株与D2代表株之间核苷酸序列同源性为92.6%~96.5%。进化树图分析显示,新疆CV-A6毒株均属于D基因型,其中绝大多数(71/75)处于D3分支,属于D3亚型,2012~2016年具有分布;少数(4/75)处于D2分支,属于D2亚型,只分离于2013~2014年。新疆CV-A6在系统进化树上形成多个不同的小分支,不同年份不同地区的CV-A6毒株分别与国内一些地区的毒株有着较近的亲缘关系,说明新疆CV-A6毒株的传播链和基因型分布与内地CV-A6相同,与内地的CV-A6共进化的。加强手足口病的病原学监测及相关病原的分子特征研究对手足口病的防控至关重要。 展开更多
关键词 手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒A6 新疆维吾尔自治区
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青海省2016-2017年人肠道病毒A组71型基因特征 被引量:4
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作者 范丽霞 王卫军 +5 位作者 巴卓玛 赵生仓 李崇亥 姜双应 严冬梅 冀天娇 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2018年第5期501-504,共4页
目的对青海省2016-2017年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)人肠道病毒A组71型(human enterovirus group A type71,EV—A71)的基因特征进行分析。方法对青海省2016-2017年采集的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链... 目的对青海省2016-2017年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)人肠道病毒A组71型(human enterovirus group A type71,EV—A71)的基因特征进行分析。方法对青海省2016-2017年采集的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription.polymerase chain reaction,RT—PCR)方法进行筛查,对EV—A71阳性标本进行病毒分离,对分离到的病毒提取核酸,用RT—PCR方法对VPl编码区进行扩增及核苷酸序列测定和分析,并与EV.A71各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果青海省2016-2017年共分离到114株EV-A71,均为C4基因亚型中的C4a进化分支。在亲缘性关系树中显示,又进一步分属2个不同的小分支。2016-2017年青海省流行的不同传播链上EV—A71与我国其他省流行的EV-A71基因亲缘关系较为接近。结论青海省2016-2017年流行的EV—A71以C4a为绝对优势基因亚型,未监测到其他基因型病毒。青海省EV—A71不是独立进化的,而是与我国其他地区流行的EV—A71共同进化。 展开更多
关键词 手足口病 人肠道病毒A组71型 C4a基因亚型
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海南省2010年柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析 被引量:3
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作者 张宝敏 陈海云 +7 位作者 檀晓娟 李静 冀天娇 曾祥洁 祝双利 许文波 马焱 王世文 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2014年第3期173-175,共3页
目的 分析2010年引起海南省手足口病流行柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)的分子流行病学特征.方法 从海南省2010年手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)标本中分离到56株CA16毒株,用RT-PCR的方法对VP1编码区扩... 目的 分析2010年引起海南省手足口病流行柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)的分子流行病学特征.方法 从海南省2010年手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)标本中分离到56株CA16毒株,用RT-PCR的方法对VP1编码区扩增及核苷酸序列的测定和整理分析,并与CA16各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树.结果 其中34株属于B基因型中的B1a基因亚型,22株属于B1b基因亚型.B1a基因亚型的毒株主要分布于海口市以及海南省西北部相邻的4个县市,B1b基因亚型的毒株主要分布于海口市以及海南省中部、西南部相邻的4个县市.结论 2010年海南省B1a和B1b基因亚型在人群中共循环,两个基因亚型呈现一定区域性分布的特点,提示在海南省CA16至少存在两条大的传播链.在2008年至2010年,海南省手足口病例中CA16感染的比例明显上升,分别为8.05%、5.35%、35.45%. 展开更多
关键词 柯萨奇病毒感染 手足口病 基因型
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