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古树基因组数据库开发与应用
1
作者
张辉
冯一健
+7 位作者
韦上校
李华
彭海旭
吴邵元
马晓燕
李玮瑜
王森
郑轶
《北京农学院学报》
2024年第3期109-115,共7页
【目的】建立古树基因组数据库存储古树名木及相关物种的基因组遗传信息数据,实现基因组数据的浏览、查询、在线分析。【方法】依据《古树名木普查技术规范》的相关规定,树龄在100年以上的树木为古树。参照记录在册的古树品种,从相关数...
【目的】建立古树基因组数据库存储古树名木及相关物种的基因组遗传信息数据,实现基因组数据的浏览、查询、在线分析。【方法】依据《古树名木普查技术规范》的相关规定,树龄在100年以上的树木为古树。参照记录在册的古树品种,从相关数据库收集国内外已公开发表的同种古树基因组等遗传信息,同时对收集的古树基因组进行整理与校正、基因功能注释,遗传数据进行整理与分析,将其标准化的数据上传到开发的古树基因组数据库。【结果】开发了古树基因组数据库并完成上线,实现了对古树基因组等遗传数据存储、查询、浏览。目前共收录了等89种古树名木及相关物种的基因组及比较基因组数据,为研究古树在复杂环境胁迫下长寿的分子机制提供数据支持。开发了在线数据挖掘工具,实现了遗传信息基于BLAST的序列比对、序列批量提取、GO和KEGG的富集分析、共线性分析等功能,为研究古树优良基因提供数据分析平台。【结论】古树及相关物种基因组遗传信息的整理归纳,古树基因组数据库的开发应用为古树科研用户提供了极大的便利,为有效地保护古树资源提供新的见解。
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关键词
古树
基因组
数据库
数据挖掘
下载PDF
职称材料
《瓶》——一部应予重视的爱情诗集——纪念郭沫若诞辰九十周年
被引量:
4
2
作者
冯一健
《山西师大学报(社会科学版)》
1982年第4期23-26,共4页
郭沫若蜚声中国新文坛,首先因为他是我国新诗歌运动的奠基人。提起郭诗,现在的青年人大约都知道《女神》,也许还知道《星空》,但是,知道《瓶》的就很少了。这跟解放后我们的大多数中国现代文学史教材不提《瓶》的情况可能有点关系吧。不...
郭沫若蜚声中国新文坛,首先因为他是我国新诗歌运动的奠基人。提起郭诗,现在的青年人大约都知道《女神》,也许还知道《星空》,但是,知道《瓶》的就很少了。这跟解放后我们的大多数中国现代文学史教材不提《瓶》的情况可能有点关系吧。不过,党的十一届三中全会后新出的几种中国现代文学史教材里,对于《瓶》已经有百来字的评介了,这就好。鲁迅先生曾指出,认识陶渊明,单知道他的吖采菊东篱下,悠然见南山”
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关键词
奠基人
郭沫若
梅花
中国现代文学史
爱情诗
十一届三中全会
青年人
陶渊明
新诗歌
心情
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职称材料
题名
古树基因组数据库开发与应用
1
作者
张辉
冯一健
韦上校
李华
彭海旭
吴邵元
马晓燕
李玮瑜
王森
郑轶
机构
北京农学院
北京农学院生物信息中心
北京农学院
出处
《北京农学院学报》
2024年第3期109-115,共7页
基金
2023年北京农学院揭榜挂帅项目
北京农学院青年教师科研创新能力提升计划(QJKC2022044)。
文摘
【目的】建立古树基因组数据库存储古树名木及相关物种的基因组遗传信息数据,实现基因组数据的浏览、查询、在线分析。【方法】依据《古树名木普查技术规范》的相关规定,树龄在100年以上的树木为古树。参照记录在册的古树品种,从相关数据库收集国内外已公开发表的同种古树基因组等遗传信息,同时对收集的古树基因组进行整理与校正、基因功能注释,遗传数据进行整理与分析,将其标准化的数据上传到开发的古树基因组数据库。【结果】开发了古树基因组数据库并完成上线,实现了对古树基因组等遗传数据存储、查询、浏览。目前共收录了等89种古树名木及相关物种的基因组及比较基因组数据,为研究古树在复杂环境胁迫下长寿的分子机制提供数据支持。开发了在线数据挖掘工具,实现了遗传信息基于BLAST的序列比对、序列批量提取、GO和KEGG的富集分析、共线性分析等功能,为研究古树优良基因提供数据分析平台。【结论】古树及相关物种基因组遗传信息的整理归纳,古树基因组数据库的开发应用为古树科研用户提供了极大的便利,为有效地保护古树资源提供新的见解。
关键词
古树
基因组
数据库
数据挖掘
Keywords
ancient trees
genome
database
data mining
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
《瓶》——一部应予重视的爱情诗集——纪念郭沫若诞辰九十周年
被引量:
4
2
作者
冯一健
出处
《山西师大学报(社会科学版)》
1982年第4期23-26,共4页
文摘
郭沫若蜚声中国新文坛,首先因为他是我国新诗歌运动的奠基人。提起郭诗,现在的青年人大约都知道《女神》,也许还知道《星空》,但是,知道《瓶》的就很少了。这跟解放后我们的大多数中国现代文学史教材不提《瓶》的情况可能有点关系吧。不过,党的十一届三中全会后新出的几种中国现代文学史教材里,对于《瓶》已经有百来字的评介了,这就好。鲁迅先生曾指出,认识陶渊明,单知道他的吖采菊东篱下,悠然见南山”
关键词
奠基人
郭沫若
梅花
中国现代文学史
爱情诗
十一届三中全会
青年人
陶渊明
新诗歌
心情
分类号
G65 [文化科学—教育学]
C55 [社会学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
古树基因组数据库开发与应用
张辉
冯一健
韦上校
李华
彭海旭
吴邵元
马晓燕
李玮瑜
王森
郑轶
《北京农学院学报》
2024
0
下载PDF
职称材料
2
《瓶》——一部应予重视的爱情诗集——纪念郭沫若诞辰九十周年
冯一健
《山西师大学报(社会科学版)》
1982
4
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