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基于TCGA数据库分析泛凋亡相关基因构建肺腺癌预后模型的预测价值及其对肿瘤免疫微环境的影响
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作者 李雨桃 冯一鹏 +4 位作者 章义键 王朵朵 董高超 蒋峰 刘雅恬 《肿瘤学杂志》 CAS 2023年第12期994-1004,共11页
[目的]探讨泛凋亡(PANoptosis)对肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)患者预后及免疫微环境的预测价值。[方法]从TCGA数据库下载LUAD样本与正常样本的基因表达谱及临床数据,从已发表的文献中获取PANoptosis相关基因并分析其在肿瘤组和对... [目的]探讨泛凋亡(PANoptosis)对肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)患者预后及免疫微环境的预测价值。[方法]从TCGA数据库下载LUAD样本与正常样本的基因表达谱及临床数据,从已发表的文献中获取PANoptosis相关基因并分析其在肿瘤组和对照组间的差异表达基因。通过单变量Cox分析和LASSO-Cox回归分析构建生存预后模型,将患者按风险评分划为高、低风险组。通过Kaplan-Meier生存曲线和受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under the curve,AUC)评价模型的预测性能,再对模型风险评分进行独立预后分析。GO和KEGG富集分析探索生物功能和潜在的信号通路。采用TIMER数据库ESTIMATE算法综合分析PANoptosis相关基因与免疫微环境相关性。通过qRT-PCR验证PANoptosis预后相关基因在LUAD组织和正常肺组织间的差异表达。[结果]共有15个PANoptosis相关基因在LUAD组和正常组间存在差异性表达,从中筛选出4个PANoptosis预后相关基因(RIPK3、NLRP3、FADD、MLKL)。在LASSO-Cox回归模型中,高风险组的生存率低于低风险组(P<0.001)。单变量和多变量Cox分析显示该评分模型是LUAD的独立预后因素(HR=2.179,95%CI:1.347~3.524,P=0.001),而GO和KEGG分析显示差异表达基因主要富集于与免疫相关的通路。高低风险组之间免疫微环境、免疫细胞差异和免疫检查点基因表达差异显著。此外,qRTPCR实验也证实PANoptosis相关基因FADD(P=0.007)和NLRP3(P<0.001)在LUAD组和正常组之间表达存在差异。[结论]本研究构建的PANoptosis相关基因的生存预后模型可以预测LUAD患者的预后及免疫微环境。 展开更多
关键词 肺腺癌 泛凋亡 生物信息学 预后模型 TCGA数据库
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不停跳冠状动脉搭桥术对冠心病合并慢性阻塞性肺疾病患者的疗效 被引量:4
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作者 冯一鹏 潘珂 +3 位作者 孙浩亮 李京杭 张憬 李芝 《江苏医药》 CAS 2020年第7期745-747,共3页
目的分析不停跳冠状动脉搭桥术治疗合并慢性阻塞性肺疾病(COPD)的冠心病患者的临床效果。方法回顾性分析连续择期行不停跳冠状动脉搭桥术的冠心病患者323例的临床资料。其中,40例患者合并COPD(COPD组),283例未合并COPD(对照组)。比较两... 目的分析不停跳冠状动脉搭桥术治疗合并慢性阻塞性肺疾病(COPD)的冠心病患者的临床效果。方法回顾性分析连续择期行不停跳冠状动脉搭桥术的冠心病患者323例的临床资料。其中,40例患者合并COPD(COPD组),283例未合并COPD(对照组)。比较两组手术相关指标和预后资料。结果与对照组相比,COPD组患者术前有吸烟史、PaCO2升高、心脏射血分数降低、第1秒用力呼气量占预计值的百分比、第1秒用力呼气量与用力肺活量比值和PaO2降低患者的比例均较高(P<0.01)。COPD组较对照组心房颤动及肺部并发症发生率、主动脉内球囊反搏使用率、再次气管插管率和气管切开率升高,气管插管时间和ICU停留时间延长(P<0.05或P<0.01)。两组死亡率无统计学差异(P>0.05)。结论尽管不停跳冠状动脉搭桥术治疗合并COPD的冠心病患者术后易伴发心房颤动及肺部并发症,但并不增加术后30 d内死亡率。 展开更多
关键词 冠心病 慢性阻塞性肺疾病 不停跳冠状动脉搭桥术 体外循环
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