生防菌解淀粉芽孢杆菌SQ-2全基因组测序及生物信息学分析

【背景】解淀粉芽孢杆菌SQ-2是从市售豆瓣酱中分离得到的一株益生菌,实验表明菌株SQ-2具有较强的抑制植物病原真菌的能力,说明SQ-2具有较好的生物防治能力,有作为生物农药的潜力。【目的】研究菌株SQ-2的遗传信息并揭示其抑菌机制。【方法】在Illumina MiSeq X10平台上对菌株SQ-2进行全基因组测序,使用Trim Galore V.0.4.0清理原始数据,并使用FastQC检查质量;使用SOAPdenovo2进行从头组装,使用antiSMASH鉴定负责次级代谢产物生物合成的基因。【结果】解淀粉芽孢杆菌SQ-2基因组大小为3486537 bp,GC含量为46.63%,共编码4298个基因,共发现11个与次级代谢产物生物合成相关的基因簇,其中6个被确定为抗真菌物质合成簇,分别编码bacillaene、bacilysin、butirosin、fengycin、bacillibactin和surfactin。基因组框架测序数据提交至NCBI获得GenBank登录号为JAHXSB000000000。超高液相色谱/质谱联用分析表明产生了儿茶酚型嗜铁素、多烯类和表面活性肽。【结论】获得了解淀粉芽孢杆菌SQ-2的基因组序列,该菌株对植物致病真菌具有强烈的拮抗活性。全基因组序列研究有助于对已知抗菌肽的利用及寻找新型抗真菌物质。

“互联网+”背景下农产品安全质量追溯系统现状分析

现如今,我国对农产品质量安全的要求越来越严格。建立农产品质量安全追溯体系,对于解决我国食品安全问题具有十分重要的意义。在“互联网+”背景下,我国农产品质量安全追溯体系建设取得了一定的进展,但仍不能满足国内需求,仍需加强。本文通过对“互联网 ”背景下的农产品安全质量追溯系统进行分析,并结合新冠疫情之下农产品安全质量追溯系统运行现状,发现总结出问题主要存在于溯源监管、法律法规、标准体系、追溯能力和可持续发展几个方面,并基于问题给出了适用于疫情之下的对策建议。