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全基因组关联分析在玉米籽粒性状研究中的应用及其候选基因预测
1
作者
陈昕怡
刘晨艳
+4 位作者
华明珠
徐欣
冯汶祥
汪保华
方辉
《农学学报》
2024年第4期26-36,共11页
本研究旨在探索调控玉米籽粒发育的自然变异,以期为玉米产量性状的遗传改良提供科学依据。以150份遗传变异丰富的玉米自交系为材料进行研究。通过结合34342个SNP标记和3种模型,对5个籽粒相关性状进行全基因组关联分析。研究结果揭示了1...
本研究旨在探索调控玉米籽粒发育的自然变异,以期为玉米产量性状的遗传改良提供科学依据。以150份遗传变异丰富的玉米自交系为材料进行研究。通过结合34342个SNP标记和3种模型,对5个籽粒相关性状进行全基因组关联分析。研究结果揭示了18个独立位点与目标性状显著关联,每个位点能够解释12.24%~15.41%的表型变异。同时,研究发现4对与籽粒长度相关的SNP之间存在显著的上位性互作,这些互作共能解释5.32%的表型变异。为了深入理解这些关联位点背后的分子机制,结合B73自交系籽粒发育的动态转录组数据和基因的功能注释,预测了19个候选基因,这些候选基因可以分为4类:6个酶、3个核糖体蛋白、1个转录因子和9个其他蛋白。这些候选基因的发现为解析玉米籽粒发育的分子机制以及改良籽粒大小和作物产量提供新的基因资源。通过本研究,我们不仅揭示了调控玉米籽粒发育的自然变异,还为玉米产量性状的遗传改良提供了新的基因资源。这些成果有望为玉米育种工作带来新的突破,提高玉米产量,从而更好地满足人类对粮食的需求。
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关键词
玉米
籽粒大小
产量
全基因组关联分析
候选基因预测
下载PDF
职称材料
旱柳F1群体速生性和冠型的群体评价
2
作者
江钰娜
冯汶祥
+5 位作者
高俊峰
吴瑜玮
冯志聪
黄婧柯
张健
刘国元
《安徽农业科学》
CAS
2020年第20期123-126,156,共5页
林木是重要的工业原料,也是最稳定且最经济的纤维原料。开展柳树速生性和冠型的研究是解决我国木材原料短缺的有效手段。对195个5年树龄的杂种F 1代进行树高、胸径、枝角等表型的测定,通过相关分析等发现高生长和径生长有极显著相关性,...
林木是重要的工业原料,也是最稳定且最经济的纤维原料。开展柳树速生性和冠型的研究是解决我国木材原料短缺的有效手段。对195个5年树龄的杂种F 1代进行树高、胸径、枝角等表型的测定,通过相关分析等发现高生长和径生长有极显著相关性,枝角与高生长存在较显著负相关。进一步通过主成分分析,筛选出18个窄冠速生的新品系,其中包括4个雄性株系。该研究为研究柳树速生性和冠型的遗传机制以及进行柳树新品种的选育奠定了基础。
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关键词
旱柳
速生
冠型
F
1群体
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职称材料
题名
全基因组关联分析在玉米籽粒性状研究中的应用及其候选基因预测
1
作者
陈昕怡
刘晨艳
华明珠
徐欣
冯汶祥
汪保华
方辉
机构
南通大学生命科学学院
出处
《农学学报》
2024年第4期26-36,共11页
基金
国家自然科学基金项目“玉米籽粒油份基因ZmCtBP1的分子遗传机制研究”(32101730)
南通大学大学生创新训练计划项目“玉米籽粒发育基因ZmPPR6的克隆及功能分析”(2022098)。
文摘
本研究旨在探索调控玉米籽粒发育的自然变异,以期为玉米产量性状的遗传改良提供科学依据。以150份遗传变异丰富的玉米自交系为材料进行研究。通过结合34342个SNP标记和3种模型,对5个籽粒相关性状进行全基因组关联分析。研究结果揭示了18个独立位点与目标性状显著关联,每个位点能够解释12.24%~15.41%的表型变异。同时,研究发现4对与籽粒长度相关的SNP之间存在显著的上位性互作,这些互作共能解释5.32%的表型变异。为了深入理解这些关联位点背后的分子机制,结合B73自交系籽粒发育的动态转录组数据和基因的功能注释,预测了19个候选基因,这些候选基因可以分为4类:6个酶、3个核糖体蛋白、1个转录因子和9个其他蛋白。这些候选基因的发现为解析玉米籽粒发育的分子机制以及改良籽粒大小和作物产量提供新的基因资源。通过本研究,我们不仅揭示了调控玉米籽粒发育的自然变异,还为玉米产量性状的遗传改良提供了新的基因资源。这些成果有望为玉米育种工作带来新的突破,提高玉米产量,从而更好地满足人类对粮食的需求。
关键词
玉米
籽粒大小
产量
全基因组关联分析
候选基因预测
Keywords
maize
kernel size
yield
genome-wide association analysis
candidate genes prediction
分类号
S513 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
旱柳F1群体速生性和冠型的群体评价
2
作者
江钰娜
冯汶祥
高俊峰
吴瑜玮
冯志聪
黄婧柯
张健
刘国元
机构
南通大学生命科学学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
2020年第20期123-126,156,共5页
基金
江苏省林业科技创新与推广项目(LYKJ〔2018〕36)
国家自然科学基金项目“基于异速生长理论的旱柳根系耐盐基因网络枢纽发掘”(31971681)
南通大学引进人才科研启动项目“雄性窄冠速生柳新品系选育与繁殖应用”(18R08)。
文摘
林木是重要的工业原料,也是最稳定且最经济的纤维原料。开展柳树速生性和冠型的研究是解决我国木材原料短缺的有效手段。对195个5年树龄的杂种F 1代进行树高、胸径、枝角等表型的测定,通过相关分析等发现高生长和径生长有极显著相关性,枝角与高生长存在较显著负相关。进一步通过主成分分析,筛选出18个窄冠速生的新品系,其中包括4个雄性株系。该研究为研究柳树速生性和冠型的遗传机制以及进行柳树新品种的选育奠定了基础。
关键词
旱柳
速生
冠型
F
1群体
Keywords
Salix matsudana
Fast-growth
Crown type
F1 population
分类号
S792.12 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
全基因组关联分析在玉米籽粒性状研究中的应用及其候选基因预测
陈昕怡
刘晨艳
华明珠
徐欣
冯汶祥
汪保华
方辉
《农学学报》
2024
0
下载PDF
职称材料
2
旱柳F1群体速生性和冠型的群体评价
江钰娜
冯汶祥
高俊峰
吴瑜玮
冯志聪
黄婧柯
张健
刘国元
《安徽农业科学》
CAS
2020
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
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