活化转录因子4参与甲基化修饰与巨噬细胞炎症反应的关联研究

目的探究活化转录因子4(activating transcription factor 4,ATF4)参与甲基化修饰与脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)诱导巨噬细胞炎症反应的潜在关联。方法对比分析应用LPS(LPS组)和PBS(对照组)处理小鼠单核巨噬细胞白血病细胞系(即RAW264.7细胞系)8 h后染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)和RNA高通量测序(RNA-seq)转录组分析表达谱的变化。采用京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)、基因本体(Gene Ontology,GO)分析,寻找与甲基化修饰相关通路,以及ATF4调控的甲基化修饰核心基因。应用MethPrimer平台在线预测ATF4参与巨噬细胞炎症反应甲基化修饰的关键靶基因的胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(CpG)岛的分布情况。应用蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,获取ATF4与这些关键蛋白质之间的调控关系。结果LPS组ATF4蛋白质和mRNA的相对表达量均分别显著高于对照组(t=7.507、4.771,P值均<0.001)。对LPS组开展ATF4的ChIP-seq和RNA-seq分析实验,并经KEGG和GO通路富集分析发现,ATF4参与巨噬细胞炎症反应的甲基化修饰相关基因为40个,其功能分别聚焦于组蛋白甲基化、组蛋白去甲基化、蛋白质甲基化、mRNA甲基化通路。进一步结合文献检索结果,根据上述40个基因是否存在CRE位点调控,筛选并获得ATF4调控甲基化修饰相关的7个潜在靶基因,即Brca 1、Btg 1、Carm 1、Ezh 2、Kdm 3 a、Kdm 4 b和Prmt 6。应用MethPrimer平台在线预测7个基因翻译起始位点的CpG岛,发现Prmt 6、Ezh 2、Carm 1分别有1个CpG岛,Kdm 3 a、Brca 1、Kdm 4 b分别有2个CpG岛,Btg 1有3个CpG岛;提示ATF4潜在靶基因受甲基化修饰影响。PPI网络分析结果显示,Brca 1、Btg 1、Carm 1、Ezh 2、Kdm 3 a、Kdm 4 b、Prmt 6之间分别存在交互作用。进一步通过Sangerbox 3.0在线分析网站的GO分析发现,Brca 1、Btg 1、Carm 1、Ezh 2、Kdm 3 a、Kdm 4 b、Prmt 6的功能主要聚焦于组蛋白甲基化、组蛋白修饰、染色质的共价修饰等。结论ATF4可能是巨噬细胞炎症反应过程中参与甲基化修饰的新型调节因子。

“天地图”辅助中学地理教学探讨

文章通过介绍“天地图”的项目和辅助地理教学的研究现状,以教学环节作为划分,从导入、课堂活动和整节课教学三个不同层次,并用实际案例探讨“天地图”辅助中学地理教学方法及应用,进而发现利用“天地图”辅助教学对改变中学地理教学方式和创新地理教学模式有理论和实践意义.

肾替代治疗用于儿童危重症合并液体超载的时机与方法

液体超载(FO)与危重症预后相关。儿童危重症FO发生率约为1/3,FO≥20%是预后不良的危险因素。肾替代治疗(RRT)或连续性肾替代治疗(CRRT)通过超滤达到液体平衡,是改善严重FO的重要辅助措施。RRT或CRRT用于危重患儿的辅助治疗需考虑基础疾病、FO程度及合并症等,对净超滤的强度进行个体化设置。