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加权基因共表达网络挖掘并验证调控前列腺癌转移的枢纽基因
被引量:
2
1
作者
张河元
陈南辉
+7 位作者
王晓红
高白云
凌木安
陈果
吴志明
李宇同
钟伟枫
潘斌
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1631-1640,共10页
目的通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘并验证前列腺癌转移的关键枢纽基因。方法对前列腺癌全基因组芯片GSE6919进行主成分分析(PCA),通过R语言分析差异表达基因(DEGs);利用WGCNA构建基因共表达网络并筛选关键基因;在TCGA公共数据...
目的通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘并验证前列腺癌转移的关键枢纽基因。方法对前列腺癌全基因组芯片GSE6919进行主成分分析(PCA),通过R语言分析差异表达基因(DEGs);利用WGCNA构建基因共表达网络并筛选关键基因;在TCGA公共数据中分析基因表达量及其与患者预后的关系;设计和验证针对转移相关的关键基因HNRNPA2B1的小分子干扰片段,通过MTT、流式细胞术、克隆形成、Transwell等实验验证其对前列腺癌细胞系生长、凋亡、克隆形成、迁移和侵袭的影响。结果PCA分析显示癌转移组和原位及癌旁组明显分开聚类,基因表达差异显著。WGCNA分析得到与癌转移组密切相关的模块,与干细胞分化、氨基酸代谢及免疫反应密切相关。进一步筛选得到与前列腺癌发生相关的(BDH1、PAK4、EXTL3)和转移相关的(NKTR、CTBP2、HNRNPA2B1)6个枢纽基因,在TCGA数据库中有表达差异,且与患者的总生存期相关。Western blotting结果显示HNRNPA2B1小分子干扰成功;干扰片段转染PC3及LNCap细胞,MTT实验结果显示沉默HNRNPA2B1可抑制前列腺癌细胞的生长,流式细胞术结果显示沉默HNRNPA2B1可诱导细胞凋亡,克隆形成实验显示沉默HNRNPA2B1可抑制其克隆形成,Transwell实验显示沉默HNRNPA2B1显著抑制前列腺癌细胞的迁移和侵袭(P<0.05)。结论发现前列腺癌发生相关的BDH1、PAK4、EXTL3和转移相关的NKTR、CTBP2、HNRNPA2B16个枢纽基因,为前列腺癌调控机制的研究提供了新思路。
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关键词
前列腺癌
转移
加权基因共表达网络分析
枢纽基因
TCGA
下载PDF
职称材料
腹腔镜前列腺癌根治术后电生理技术早期干预恢复控尿功能的临床疗效观察
被引量:
4
2
作者
魏健文
尹文俊
+3 位作者
陈泽楷
凌木安
陈洁
潘斌
《国际医药卫生导报》
2022年第8期1038-1041,共4页
目的探讨腹腔镜前列腺癌根治术后电生理技术早期干预恢复控尿功能的临床疗效。方法选取2021年7月至12月暨南大学附属第一医院泌尿外科5例前列腺癌患者接受腹腔镜前列腺癌根治术,术后3 d采用电生理技术早期干预,年龄(63.20±6.14)岁...
目的探讨腹腔镜前列腺癌根治术后电生理技术早期干预恢复控尿功能的临床疗效。方法选取2021年7月至12月暨南大学附属第一医院泌尿外科5例前列腺癌患者接受腹腔镜前列腺癌根治术,术后3 d采用电生理技术早期干预,年龄(63.20±6.14)岁。术式均为筋膜间腹腔镜前列腺癌根治术,术中膀胱尿道无张力吻合后,行膀胱颈前壁与耻骨前列腺韧带缝合。术后第3天进行可视化电生理诊断与治疗。治疗后对5例患者进行国际尿失禁咨询委员会尿失禁问卷表简表(ICI-Q-SF)评分、尿失禁生活质量问卷(I-QOL)评分及24 h尿垫使用量。结果所有患者均顺利完成手术,手术时间(5.92±1.35)h,出血(42.00±10.95)ml,盆腔引流管拔除时间(4.20±1.10)d,1例术后出现发热,对症处理后好转。术后2周拔除尿管,5例患者均大力咳嗽时出现少许漏尿,1例患者拔尿管当天使用了1片尿垫,24 h尿垫使用量≤1片,4例未使用尿垫,评估为术后早期恢复控尿功能。治疗周期(7.40±1.52)d,治疗后ICI-Q-SF评分(2.80±1.64)分,I-QOL评分(94.00±3.08)分。结论腹腔镜前列腺癌根治术后电生理技术早期干预恢复控尿功能安全有效,有望在未来对前列腺癌根治术后早期恢复控尿功能治疗中成为标准的辅助疗法。
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关键词
电生理适宜技术
可视化个体化治疗
腹腔镜前列腺癌根治术
早期尿控
下载PDF
职称材料
题名
加权基因共表达网络挖掘并验证调控前列腺癌转移的枢纽基因
被引量:
2
1
作者
张河元
陈南辉
王晓红
高白云
凌木安
陈果
吴志明
李宇同
钟伟枫
潘斌
机构
广东省梅州市人民医院泌尿外科
南方医科大学南方医院泌尿外科
南方医科大学第三附属医院肾内科
暨南大学附属第一医院泌尿外科
广州市第十二人民医院泌尿外科
中山大学肿瘤防治中心泌尿外科
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1631-1640,共10页
基金
国家自然科学基金青年基金(81802567)
广东省自然科学基金(2018A0303070016,2020A1515010015)
领航专科建设专项-暨南大学附属第一医院(711006)。
文摘
目的通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘并验证前列腺癌转移的关键枢纽基因。方法对前列腺癌全基因组芯片GSE6919进行主成分分析(PCA),通过R语言分析差异表达基因(DEGs);利用WGCNA构建基因共表达网络并筛选关键基因;在TCGA公共数据中分析基因表达量及其与患者预后的关系;设计和验证针对转移相关的关键基因HNRNPA2B1的小分子干扰片段,通过MTT、流式细胞术、克隆形成、Transwell等实验验证其对前列腺癌细胞系生长、凋亡、克隆形成、迁移和侵袭的影响。结果PCA分析显示癌转移组和原位及癌旁组明显分开聚类,基因表达差异显著。WGCNA分析得到与癌转移组密切相关的模块,与干细胞分化、氨基酸代谢及免疫反应密切相关。进一步筛选得到与前列腺癌发生相关的(BDH1、PAK4、EXTL3)和转移相关的(NKTR、CTBP2、HNRNPA2B1)6个枢纽基因,在TCGA数据库中有表达差异,且与患者的总生存期相关。Western blotting结果显示HNRNPA2B1小分子干扰成功;干扰片段转染PC3及LNCap细胞,MTT实验结果显示沉默HNRNPA2B1可抑制前列腺癌细胞的生长,流式细胞术结果显示沉默HNRNPA2B1可诱导细胞凋亡,克隆形成实验显示沉默HNRNPA2B1可抑制其克隆形成,Transwell实验显示沉默HNRNPA2B1显著抑制前列腺癌细胞的迁移和侵袭(P<0.05)。结论发现前列腺癌发生相关的BDH1、PAK4、EXTL3和转移相关的NKTR、CTBP2、HNRNPA2B16个枢纽基因,为前列腺癌调控机制的研究提供了新思路。
关键词
前列腺癌
转移
加权基因共表达网络分析
枢纽基因
TCGA
Keywords
prostate cancer
metastasis
weighted gene co-expression network analysis
hub gene
TCGA
分类号
R737.25 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
腹腔镜前列腺癌根治术后电生理技术早期干预恢复控尿功能的临床疗效观察
被引量:
4
2
作者
魏健文
尹文俊
陈泽楷
凌木安
陈洁
潘斌
机构
暨南大学附属第一医院泌尿外科
出处
《国际医药卫生导报》
2022年第8期1038-1041,共4页
基金
国家自然科学基金(81871155)
广州市科技计划项目(202102080043)
+1 种基金
领航专科建设专项-暨南大学附属第一医院(711006)
国家卫健委医药卫生科技发展研究中心重大专项(HDSL202001010)。
文摘
目的探讨腹腔镜前列腺癌根治术后电生理技术早期干预恢复控尿功能的临床疗效。方法选取2021年7月至12月暨南大学附属第一医院泌尿外科5例前列腺癌患者接受腹腔镜前列腺癌根治术,术后3 d采用电生理技术早期干预,年龄(63.20±6.14)岁。术式均为筋膜间腹腔镜前列腺癌根治术,术中膀胱尿道无张力吻合后,行膀胱颈前壁与耻骨前列腺韧带缝合。术后第3天进行可视化电生理诊断与治疗。治疗后对5例患者进行国际尿失禁咨询委员会尿失禁问卷表简表(ICI-Q-SF)评分、尿失禁生活质量问卷(I-QOL)评分及24 h尿垫使用量。结果所有患者均顺利完成手术,手术时间(5.92±1.35)h,出血(42.00±10.95)ml,盆腔引流管拔除时间(4.20±1.10)d,1例术后出现发热,对症处理后好转。术后2周拔除尿管,5例患者均大力咳嗽时出现少许漏尿,1例患者拔尿管当天使用了1片尿垫,24 h尿垫使用量≤1片,4例未使用尿垫,评估为术后早期恢复控尿功能。治疗周期(7.40±1.52)d,治疗后ICI-Q-SF评分(2.80±1.64)分,I-QOL评分(94.00±3.08)分。结论腹腔镜前列腺癌根治术后电生理技术早期干预恢复控尿功能安全有效,有望在未来对前列腺癌根治术后早期恢复控尿功能治疗中成为标准的辅助疗法。
关键词
电生理适宜技术
可视化个体化治疗
腹腔镜前列腺癌根治术
早期尿控
Keywords
Electrophysiological appropriate technology
Visual individualized treatment
Laparoscopic radical resection of prostate cancer
Early urinary control
分类号
R737.25 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
加权基因共表达网络挖掘并验证调控前列腺癌转移的枢纽基因
张河元
陈南辉
王晓红
高白云
凌木安
陈果
吴志明
李宇同
钟伟枫
潘斌
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
下载PDF
职称材料
2
腹腔镜前列腺癌根治术后电生理技术早期干预恢复控尿功能的临床疗效观察
魏健文
尹文俊
陈泽楷
凌木安
陈洁
潘斌
《国际医药卫生导报》
2022
4
下载PDF
职称材料
已选择
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