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子宫内膜癌组织中stratifin表达与临床病理特征和预后的关系
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作者 左世凯 王武亮 +4 位作者 王利君 王璐 郭依琳 凡志祥 刘琳洁 《实用肿瘤杂志》 CAS 2024年第4期362-367,共6页
目的探索子宫内膜癌组织中stratifin(SFN)蛋白表达及其与临床病理特征和预后的关系。方法癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中比较554例子宫内膜癌组织和23例正常子宫内膜组织中SFN的表达水平。收集2017年1月至2019... 目的探索子宫内膜癌组织中stratifin(SFN)蛋白表达及其与临床病理特征和预后的关系。方法癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中比较554例子宫内膜癌组织和23例正常子宫内膜组织中SFN的表达水平。收集2017年1月至2019年12月就诊于郑州大学第二附属医院的患者的子宫内膜癌组织96例和正常子宫内膜组织60例。免疫组织化学方法检测其SFN表达水平,并分析SFN表达水平与患者临床病理特征及预后的关系。结果TCGA数据库分析和免疫组织化学方法检测均显示,子宫内膜癌组织中SFN表达水平高于正常子宫内膜组织(均P<0.05);子宫内膜癌患者SFN表达水平在手术病理学分期方面比较,差异具有统计学意义(均P<0.01);SFN低表达患者术后无瘤生存期和总生存期均低于SFN高表达患者(均P<0.05)。Cox比例风险模型多因素分析显示,组织学分级与手术病理学分期是影响患者DFS的危险因素(均P<0.05);组织学分级与SFN表达水平是影响患者OS的危险因素(均P<0.05)。结论子宫内膜癌组织中SFN表达水平高于正常子宫内膜组织。子宫内膜癌组织中SFN低表达的患者预后较差。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 STRATIFIN 免疫组织化学 病理特征 临床预后
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基于WGCNA鉴定子宫颈鳞状细胞癌CD8^(+)T细胞浸润相关的生物标志物
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作者 凡志祥 李坤 +2 位作者 张彦彦 左世凯 黄冬梅 《中国现代医药杂志》 2022年第7期49-56,共8页
目的应用生物信息学的方法构建促进子宫颈鳞状细胞癌(CSCC)中CD8+T细胞浸润的相关基因共表达网络,并鉴定出相应的预后生物标志物。方法应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和PPI网络探索TCGA数据库中CSCC的基因表达数据,并筛选出与CD8+T... 目的应用生物信息学的方法构建促进子宫颈鳞状细胞癌(CSCC)中CD8+T细胞浸润的相关基因共表达网络,并鉴定出相应的预后生物标志物。方法应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和PPI网络探索TCGA数据库中CSCC的基因表达数据,并筛选出与CD8+T细胞浸润相关hub基因,系统分析hub基因的免疫特征及预后价值。结果通过WGCNA和PPI网络分析鉴定出10个hub基因(CCL5、CCR5、CD2、CD3D、CD3E、CD8A、CXCR3、IFNG、PDCD1、PRF1)。在TISIDB数据库中查询10个基因与免疫细胞之间的相关性,发现这些基因的表达与免疫细胞,尤其是CD8^(+)T细胞显著正相关。通过Kaplan-Meier分析、单因素和多因素Cox回归分析验证后选择CD3E作为CSCC预后生物标志物。基因集富集分析(GSEA)显示CD3E在细胞黏附分子、趋化因子信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用和T细胞受体信号通路显著富集。结论通过生物信息学验证,CD3E被确定为CSCC免疫治疗的潜在生物标记物和免疫治疗靶点。 展开更多
关键词 子宫颈鳞状细胞癌 CD8~+T细胞 CD3E WGCNA
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DLGAP5作为肾透明细胞癌的诊断标志物及其与CD8^(+)T细胞的相关性
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作者 李坤 韩娜 +3 位作者 凡志祥 陈泓润 靳爽 张中冕 《医学信息》 2023年第7期1-8,共8页
目的探讨Discs大同源物关联蛋白5(DLGAP5)表达在肾透明细胞癌(KIRC)中的作用。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)分析KIRC中DLGAP5的表达情况与临床参数之间的相关性。应用比例风险(Cox)回归模型和Kaplan-Meier(K-M)分析评估了DLGAP5在KIRC... 目的探讨Discs大同源物关联蛋白5(DLGAP5)表达在肾透明细胞癌(KIRC)中的作用。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)分析KIRC中DLGAP5的表达情况与临床参数之间的相关性。应用比例风险(Cox)回归模型和Kaplan-Meier(K-M)分析评估了DLGAP5在KIRC患者中的预后价值。CIBERSORT分析DLGAP5和CD8^(+)T细胞之间的相关性,基因集富集分析(GSEA)方法筛选和DLGAP5表达相关的生物学途径。结果与正常肾脏组织比较,KIRC中DLGAP5的表达呈显著上调。其高表达情况与肿瘤组织的分化程度、病理分期、复发和死亡均显著相关。K-M分析结果表明,DLGAP5高表达与KIRC患者的不良总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)相关,且DLGAP5是OS和PFS的独立预后因子。免疫微环境分析表明,DLGAP5的表达量与多种肿瘤免疫细胞相关,尤其是CD8^(+)T细胞。DLGAP5表达在“细胞周期”“泛素介导的蛋白水解”“蛋白酶体通路”和“T细胞受体信号通路”上显著富集。药敏分析结果显示,高危组患者对阿昔替尼、舒尼替尼更敏感。结论DLGAP5是KIRC的一种潜在生物标志物,与KIRC的诊断与预后显著相关,这将为临床的诊断与治疗提供新的研究方向。 展开更多
关键词 DLGAP5 CD8^(+)T细胞 KIRC TCGA数据库 预后
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