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盐胁迫下棉花基因组基于毛细管电泳的MSAP分析
被引量:
9
1
作者
钱晓伟
袁有禄
+5 位作者
荣平
朱新宇
刘亚泰
江鹏
刘
尚
汪保华
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期298-306,共9页
以棉花杂交种中棉所29为材料,用甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplification polymorphism,MSAP)分析法结合毛细管电泳检测技术进行甲基化鉴定,以初步探讨棉花耐盐的分子机理.应用24个引物组合,中棉所29在0.4%盐水胁迫...
以棉花杂交种中棉所29为材料,用甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplification polymorphism,MSAP)分析法结合毛细管电泳检测技术进行甲基化鉴定,以初步探讨棉花耐盐的分子机理.应用24个引物组合,中棉所29在0.4%盐水胁迫及清水对照下,平均每引物组合检测甲基化位点数分别为69.2和56.7,差异达显著水平.盐胁迫下的DNA甲基化水平与清水对照下相比,52.6%位点表现出甲基化水平提高,即发生了超甲基化;19.7%位点甲基化水平降低,即表现为次甲基化;二者差异达极显著水平.研究结果表明,中棉所29盐胁迫后发生了广泛的DNA甲基化变化,包括超甲基化和次甲基化,以及其它甲基化类型的转变;发生超甲基化位点极显著地多于发生次甲基化位点.盐胁迫下的中棉所29与对照相比,DNA总体甲基化水平显著提高,暗示中棉所29有提高基因组甲基化水平以应对盐胁迫的潜在机制,棉花基因组整体甲基化水平的提高可能与棉花对盐胁迫的耐受性起重要作用.本研究中,甲基化序列的初步克隆及比对分析表明,盐胁迫前后多个ATP合成相关基因甲基化程度维持在同一水平,其表达不受甲基化影响,这也可能是中棉所29耐盐性较强,在一定时间盐处理后能维持正常生长的原因之一.
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关键词
棉花
甲基化敏感扩增多态性
盐胁迫
毛细管电泳
下载PDF
职称材料
玉米遗传多样性分析及耐盐种质筛选
被引量:
5
2
作者
冯艳
周蓉
+7 位作者
付蓉
董瑞涛
赵富胤
孟巾果
刘亚泰
张咪
汪保华
李平
《江苏农业科学》
北大核心
2015年第7期59-61,共3页
对24份玉米材料的萌芽期、苗期进行耐盐性鉴定,考察被试材料的发芽率、苗情、出苗天数、株高、鲜(干)质量、含水量、种子活力等指标。结果表明,盐胁迫下苗情与种子活力无相关性,与其他指标均达显著水平。以苗情分级与各指标方差分析...
对24份玉米材料的萌芽期、苗期进行耐盐性鉴定,考察被试材料的发芽率、苗情、出苗天数、株高、鲜(干)质量、含水量、种子活力等指标。结果表明,盐胁迫下苗情与种子活力无相关性,与其他指标均达显著水平。以苗情分级与各指标方差分析结果进行综合评定,鉴定出了24份材料的耐盐性。运用聚类分析法,将24份材料的耐盐表型性状进行聚类,结果表明聚类结果与综合评价的耐盐性相一致,其中高耐的占25.0%,盐敏感的占29.2%。运用40对SSR引物对24份材料进行遗传多样性分析,24份材料的相似系数在0.71~0.91之间,共分成3大类,平均距离较近,表明这24份材料的遗传距离狭窄。结合遗传多样性结果与耐盐聚类结果,为优秀亲本的选择和优势组合的预测及耐盐资源的合理利用提供了基础资料。
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关键词
玉米
耐盐
聚类分析
遗传多样性
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职称材料
题名
盐胁迫下棉花基因组基于毛细管电泳的MSAP分析
被引量:
9
1
作者
钱晓伟
袁有禄
荣平
朱新宇
刘亚泰
江鹏
刘
尚
汪保华
机构
南通大学生命科学学院
棉花生物学国家重点实验室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期298-306,共9页
基金
国家自然科学基金(No.31000729)
棉花生物学国家重点实验室开放课题(No.CB2013A12)
+2 种基金
江苏省基础研究计划(自然科学基金
No.BK20131204)
南通市科技平台建设计划(No.CP12012002)~~
文摘
以棉花杂交种中棉所29为材料,用甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplification polymorphism,MSAP)分析法结合毛细管电泳检测技术进行甲基化鉴定,以初步探讨棉花耐盐的分子机理.应用24个引物组合,中棉所29在0.4%盐水胁迫及清水对照下,平均每引物组合检测甲基化位点数分别为69.2和56.7,差异达显著水平.盐胁迫下的DNA甲基化水平与清水对照下相比,52.6%位点表现出甲基化水平提高,即发生了超甲基化;19.7%位点甲基化水平降低,即表现为次甲基化;二者差异达极显著水平.研究结果表明,中棉所29盐胁迫后发生了广泛的DNA甲基化变化,包括超甲基化和次甲基化,以及其它甲基化类型的转变;发生超甲基化位点极显著地多于发生次甲基化位点.盐胁迫下的中棉所29与对照相比,DNA总体甲基化水平显著提高,暗示中棉所29有提高基因组甲基化水平以应对盐胁迫的潜在机制,棉花基因组整体甲基化水平的提高可能与棉花对盐胁迫的耐受性起重要作用.本研究中,甲基化序列的初步克隆及比对分析表明,盐胁迫前后多个ATP合成相关基因甲基化程度维持在同一水平,其表达不受甲基化影响,这也可能是中棉所29耐盐性较强,在一定时间盐处理后能维持正常生长的原因之一.
关键词
棉花
甲基化敏感扩增多态性
盐胁迫
毛细管电泳
Keywords
cotton
methylation-sensitive amplification polymorphism
salt stress
capillaryelectrophoresis
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
玉米遗传多样性分析及耐盐种质筛选
被引量:
5
2
作者
冯艳
周蓉
付蓉
董瑞涛
赵富胤
孟巾果
刘亚泰
张咪
汪保华
李平
机构
南通大学生命科学学院农业部南方平原地区玉米科学观测站
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2015年第7期59-61,共3页
基金
农业部南方平原玉米科学观测实验站开放课题(编号:NT201405)
江苏省南通市农村科技创新及产业化项目(编号:HL2013026)
+2 种基金
江苏省南通市科技平台建设计划(编号:CP12012002)
南通大学研究生科技创新计划(编号:YKC13054)
2013年国家级大学生创新训练计划(编号:201310304022Z)
文摘
对24份玉米材料的萌芽期、苗期进行耐盐性鉴定,考察被试材料的发芽率、苗情、出苗天数、株高、鲜(干)质量、含水量、种子活力等指标。结果表明,盐胁迫下苗情与种子活力无相关性,与其他指标均达显著水平。以苗情分级与各指标方差分析结果进行综合评定,鉴定出了24份材料的耐盐性。运用聚类分析法,将24份材料的耐盐表型性状进行聚类,结果表明聚类结果与综合评价的耐盐性相一致,其中高耐的占25.0%,盐敏感的占29.2%。运用40对SSR引物对24份材料进行遗传多样性分析,24份材料的相似系数在0.71~0.91之间,共分成3大类,平均距离较近,表明这24份材料的遗传距离狭窄。结合遗传多样性结果与耐盐聚类结果,为优秀亲本的选择和优势组合的预测及耐盐资源的合理利用提供了基础资料。
关键词
玉米
耐盐
聚类分析
遗传多样性
分类号
S513.03 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
盐胁迫下棉花基因组基于毛细管电泳的MSAP分析
钱晓伟
袁有禄
荣平
朱新宇
刘亚泰
江鹏
刘
尚
汪保华
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
9
下载PDF
职称材料
2
玉米遗传多样性分析及耐盐种质筛选
冯艳
周蓉
付蓉
董瑞涛
赵富胤
孟巾果
刘亚泰
张咪
汪保华
李平
《江苏农业科学》
北大核心
2015
5
下载PDF
职称材料
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