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大白猪及巴马香猪GHRH基因的SNPs筛选及其与体尺的相关性分析
被引量:
3
1
作者
李常红
孙安琪
+1 位作者
刘号义
程云云
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期346-351,共6页
为了解影响猪生长和体尺的重要候选基因(GHRH基因)多态性与猪体尺的相关性,选取大白猪为大型猪的代表,巴马香猪为小型猪的代表,利用测序法筛查了两猪种间GHRH基因上存在的SNPs,统计了各个SNP在2个猪种的基因型频率及等位基因频率,然后...
为了解影响猪生长和体尺的重要候选基因(GHRH基因)多态性与猪体尺的相关性,选取大白猪为大型猪的代表,巴马香猪为小型猪的代表,利用测序法筛查了两猪种间GHRH基因上存在的SNPs,统计了各个SNP在2个猪种的基因型频率及等位基因频率,然后基于基因型频率对每个SNP与猪体型的相关性进行分析,并将筛选到的与猪体型相关的SNPs进行连锁不平衡及单倍型分析。结果表明:共有7个SNPs存在于两猪种间,分别为g.1874A>C、g.2276A>G、g.4165C>-、g.4238T>C、g.8079I>-(GTGCTGGCGTGAG缺失)、g.8114A>G及g.8178A>G,且这些SNPs均与猪体尺性状显著相关,其中g.2276A>G和g.4165C>-存在连锁效应,并且大白猪形成的优势单倍型为AC,而巴马香猪为G-型,单倍型频率在两猪种间存在极显著差异(P<0.001);位于基因内含子4的3个位点(g.8079I>-、g.8114A>G及g.8178A>G)在大白猪中形成的单倍型为-GA,而巴马香猪为IAG,单倍型频率在两猪种间存在极显著差异(P<0.001)。这说明猪GHRH基因上存在的SNPs与猪体尺相关,可作为猪种遗传性状及育种的筛选标记,将为提高养猪经济效益及猪育种提供理论依据。
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关键词
GHRH基因
猪
体尺
单核苷酸多态性
连锁不平衡
原文传递
题名
大白猪及巴马香猪GHRH基因的SNPs筛选及其与体尺的相关性分析
被引量:
3
1
作者
李常红
孙安琪
刘号义
程云云
机构
白城师范学院生命科学学院
华南农业大学动物科学学院
出处
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期346-351,共6页
基金
白城师范学院博士科研启动基金项目
国家自然科学基金项目(31672514,31772699)
+1 种基金
吉林省科技发展计划项目(20170101024JC))
吉林省教育厅项目(JJKH20190017KJ)
文摘
为了解影响猪生长和体尺的重要候选基因(GHRH基因)多态性与猪体尺的相关性,选取大白猪为大型猪的代表,巴马香猪为小型猪的代表,利用测序法筛查了两猪种间GHRH基因上存在的SNPs,统计了各个SNP在2个猪种的基因型频率及等位基因频率,然后基于基因型频率对每个SNP与猪体型的相关性进行分析,并将筛选到的与猪体型相关的SNPs进行连锁不平衡及单倍型分析。结果表明:共有7个SNPs存在于两猪种间,分别为g.1874A>C、g.2276A>G、g.4165C>-、g.4238T>C、g.8079I>-(GTGCTGGCGTGAG缺失)、g.8114A>G及g.8178A>G,且这些SNPs均与猪体尺性状显著相关,其中g.2276A>G和g.4165C>-存在连锁效应,并且大白猪形成的优势单倍型为AC,而巴马香猪为G-型,单倍型频率在两猪种间存在极显著差异(P<0.001);位于基因内含子4的3个位点(g.8079I>-、g.8114A>G及g.8178A>G)在大白猪中形成的单倍型为-GA,而巴马香猪为IAG,单倍型频率在两猪种间存在极显著差异(P<0.001)。这说明猪GHRH基因上存在的SNPs与猪体尺相关,可作为猪种遗传性状及育种的筛选标记,将为提高养猪经济效益及猪育种提供理论依据。
关键词
GHRH基因
猪
体尺
单核苷酸多态性
连锁不平衡
Keywords
GHRH gene
pig body size
SNP
linkage disequilibrium
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大白猪及巴马香猪GHRH基因的SNPs筛选及其与体尺的相关性分析
李常红
孙安琪
刘号义
程云云
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
原文传递
已选择
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引用分析
参考文献
引证文献
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