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基于网络药理学及分子对接技术分析“半边莲-白花蛇舌草”药对治疗银屑病的作用机制
被引量:
10
1
作者
沈乐乐
席建元
+3 位作者
孙立新
王子加
刘均瑜
李静
《天然产物研究与开发》
CAS
CSCD
2021年第12期2136-2145,共10页
基于网络药理学及分子对接技术探讨“半边莲-白花蛇舌草”药对治疗银屑病的有效活性成分及作用机制。运用TCMSP数据库筛选“半边莲-白花蛇舌草”药对的活性成分及靶标,并通过GeneCards数据库获取银屑病疾病靶点,获取交集靶标,利用Cytosc...
基于网络药理学及分子对接技术探讨“半边莲-白花蛇舌草”药对治疗银屑病的有效活性成分及作用机制。运用TCMSP数据库筛选“半边莲-白花蛇舌草”药对的活性成分及靶标,并通过GeneCards数据库获取银屑病疾病靶点,获取交集靶标,利用Cytoscape 3.6.1软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络图,利用STRING数据库构建PPI蛋白互作网络,并筛选出核心靶蛋白,对交集靶标进行GO生物过程及KEGG通路富集分析,最后利用SYBYL-X 2.1.1进行“半边莲-白花蛇舌草”药对与核心靶蛋白的模拟分子对接验证。从“半边莲-白花蛇舌草”中筛选获得24个活性成分,其中槲皮素、木犀草素、山奈酚、刺槐素、β-谷甾醇、环三烯酚为药对的关键活性成分,其作用主要涉及AKT1、JUN、MAPK1、RELA、HSP90AA1、IL6、ESR1、MAPK8、EGFR、MAPK14核心靶蛋白,GO与KEGG通路富集分析提示药对干预银屑病的生物学过程复杂多样,并且在PI3K-Akt信号通路、VEGF相关通路、Th1和Th2细胞、B细胞受体、HIF-1α等信号通路上基因富集性较高。在60个对接结果中,半数提示有较优的对接活性,槲皮素与核心靶蛋白结合情况最佳,HSP90AA1是半边莲-白花蛇舌草中关键化学成分结合活性最优的靶蛋白。“半边莲-白花蛇舌草”药对干预银屑病的机制具有多靶点、多途径的特点,与血管生成、炎性反应、免疫介导等途径关系密切,初步揭示了其作用的关键靶点及涉及的生物学过程和信号通路,为今后临床用药组方治疗银屑病以及实验研究提供理论依据。
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关键词
半边莲-白花蛇舌草
银屑病
作用机制
网络药理学
分子对接
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职称材料
象皮生肌膏对糖尿病足溃疡大鼠创面组织内上皮-间质转化过程的影响
被引量:
12
2
作者
孙之中
刘朝红
+6 位作者
陈其华
易倩
羊羡
赵姣
林雅思
何欢
刘均瑜
《陕西中医》
CAS
2022年第12期1664-1668,共5页
目的:观察象皮生肌膏对糖尿病足溃疡大鼠创面组织内转化生长因子-β1(TGF-β1)、胰岛素样生长因子-1(IGF-1)、纤维结合蛋白(FN)表达的影响,以及在愈合过程中上皮-间质转化(EMT)过程。方法:选择SPF级雄性SD大鼠40只,建立溃疡大鼠模型,其...
目的:观察象皮生肌膏对糖尿病足溃疡大鼠创面组织内转化生长因子-β1(TGF-β1)、胰岛素样生长因子-1(IGF-1)、纤维结合蛋白(FN)表达的影响,以及在愈合过程中上皮-间质转化(EMT)过程。方法:选择SPF级雄性SD大鼠40只,建立溃疡大鼠模型,其中10只作为空白组,其余30只大鼠建立糖尿病大鼠模型,造模成功后分为模型组、对照组、实验组。比较各组大鼠第7、14天创面愈合情况;实时荧光定量聚合酶链式反应法(RT-qPCR)检测各组第7、14天TGF-β1、IGF-1、FN的mRNA表达情况;Western blotting检测各组第7、14天EMT相关蛋白E-钙黏蛋白(E-cadherin)、纤连蛋白(Fibronectin)蛋白表达情况;酶联免疫反应法测定组织中血管内皮生长因子(VEGF)含量。结果:干预第7天,空白组、实验组的创面愈合率均高于模型组;与模型组相比,空白组、实验组E-cadherin表达降低,Fibronectin表达升高,而TGF-β1、IGF-1、FN的mRNA表达均高;与对照组相比,实验组E-cadherin蛋白表达降低,Fibronectin蛋白表达升高;与模型组相比,空白组、对照组、实验组的VEGF含量均高,差异有统计学意义(均P<0.05)。干预第14天,模型组的创面愈合率低于其他组;与模型组相比,空白组、实验组E-cadherin蛋白表达较低,Fibronectin蛋白表达较高,空白组、对照组、实验组FN mRNA表达均高,空白组、实验组TGF-β1的mRNA表达均高。与模型组相比,空白组、对照组、实验组的VEGF含量均高,差异有统计学意义(均P<0.05)。干预第14天,模型组、对照组、实验组的IGF-1的mRNA表达比较,差异无统计学意义(均P>0.05)。结论:象皮生肌膏能促进EMT过程,加快愈合速度,其途径可能是通过促进TGF-β1表达,介导IGF-1,调控FN实现。
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关键词
糖尿病足溃疡
象皮生肌膏
转化生长因子-β1
胰岛素样生长因子-1
纤维结合蛋白
上皮-间质转化
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职称材料
基于生物信息学方法探讨银屑病关键差异基因的免疫浸润机制及相关中药预测分析
被引量:
3
3
作者
沈乐乐
沈浮
+4 位作者
孙立新
王子加
刘均瑜
李静
席建元
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1663-1674,共12页
目的探讨银屑病关键差异基因的免疫浸润机制及分析预测相关作用中药。方法利用基因芯片数据库(Gene Expression Omnibus,GEO),对银屑病基因探针芯片数据进行富集分析和免疫浸润分析。运用R语言及相关安装包程序对银屑病差异基因进行基...
目的探讨银屑病关键差异基因的免疫浸润机制及分析预测相关作用中药。方法利用基因芯片数据库(Gene Expression Omnibus,GEO),对银屑病基因探针芯片数据进行富集分析和免疫浸润分析。运用R语言及相关安装包程序对银屑病差异基因进行基因本体论(GO)及基因通路富集分析(KEGG);通过CIBERSORT反卷法对22类免疫细胞在银屑病的含量及比例进行分析;利用COREMINE数据库对明显富集的免疫相关的生物学过程及核心靶基因进行中药预测。结果银屑病相关的蛋白网络互作关键靶基因涉及KIF2C、BUB1、BUB1B等14个靶基因,涉及中性粒细胞活化、淋巴细胞迁移、白细胞趋化性等多种免疫相关途径,与自身免疫、炎症、心肌代谢通路密切相关。CIBERSORT反卷积法对银屑病的免疫相关性分析中,调节性T细胞、活化的树突状细胞与活化的CD4^(+)记忆性T细胞呈正相关,而活化的树突状细胞与静息肥大细胞、巨噬细胞M2呈负相关。在总体样本中,与正常皮肤组织组相比,银屑病皮损组织中中性粒细胞、活化的树突状细胞、静息的CD4^(+)记忆T细胞明显增高,而静息肥大细胞则明显减少,而在配对样本中记忆B细胞在银屑病组织中呈现上升趋势,而调节性T细胞呈下降趋势。免疫相关性分析中,调节性T细胞、活化的树突状细胞与活化的CD4^(+)记忆性T细胞呈正相关,而活化的树突状细胞与静息肥大细胞、巨噬细胞M2呈负相关。通过COREMINE预测发现,半枝莲、白花蛇舌草、人参、黄芪、防己与银屑病相关免疫浸润的关系最密切,且多归为肺经,功效多与清热补虚相关。结论中性粒细胞、树突状细胞、CD4^(+)记忆T细胞、调节性T细胞与银屑病关系密切,银屑病相关的差异基因涉及多种免疫相关生物学过程及通路,筛选出半枝莲、白花蛇舌草、人参、黄芪、防己等中药可能为其潜在的分子药物来源。
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关键词
银屑病
免疫浸润
生物信息学
中药预测
半枝莲
白花蛇舌草
人参
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职称材料
题名
基于网络药理学及分子对接技术分析“半边莲-白花蛇舌草”药对治疗银屑病的作用机制
被引量:
10
1
作者
沈乐乐
席建元
孙立新
王子加
刘均瑜
李静
机构
宁夏医科大学
湖南中医药大学第一附属医院
湖南中医药大学
出处
《天然产物研究与开发》
CAS
CSCD
2021年第12期2136-2145,共10页
基金
湖南省教育厅重点项目(19A363)。
文摘
基于网络药理学及分子对接技术探讨“半边莲-白花蛇舌草”药对治疗银屑病的有效活性成分及作用机制。运用TCMSP数据库筛选“半边莲-白花蛇舌草”药对的活性成分及靶标,并通过GeneCards数据库获取银屑病疾病靶点,获取交集靶标,利用Cytoscape 3.6.1软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络图,利用STRING数据库构建PPI蛋白互作网络,并筛选出核心靶蛋白,对交集靶标进行GO生物过程及KEGG通路富集分析,最后利用SYBYL-X 2.1.1进行“半边莲-白花蛇舌草”药对与核心靶蛋白的模拟分子对接验证。从“半边莲-白花蛇舌草”中筛选获得24个活性成分,其中槲皮素、木犀草素、山奈酚、刺槐素、β-谷甾醇、环三烯酚为药对的关键活性成分,其作用主要涉及AKT1、JUN、MAPK1、RELA、HSP90AA1、IL6、ESR1、MAPK8、EGFR、MAPK14核心靶蛋白,GO与KEGG通路富集分析提示药对干预银屑病的生物学过程复杂多样,并且在PI3K-Akt信号通路、VEGF相关通路、Th1和Th2细胞、B细胞受体、HIF-1α等信号通路上基因富集性较高。在60个对接结果中,半数提示有较优的对接活性,槲皮素与核心靶蛋白结合情况最佳,HSP90AA1是半边莲-白花蛇舌草中关键化学成分结合活性最优的靶蛋白。“半边莲-白花蛇舌草”药对干预银屑病的机制具有多靶点、多途径的特点,与血管生成、炎性反应、免疫介导等途径关系密切,初步揭示了其作用的关键靶点及涉及的生物学过程和信号通路,为今后临床用药组方治疗银屑病以及实验研究提供理论依据。
关键词
半边莲-白花蛇舌草
银屑病
作用机制
网络药理学
分子对接
Keywords
Lobeliae Chinensis Herba-Hedyotis Herba
psoriasis
mechanism
network pharmacology
molecular docking
分类号
R275.9 [医药卫生—中西医结合]
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职称材料
题名
象皮生肌膏对糖尿病足溃疡大鼠创面组织内上皮-间质转化过程的影响
被引量:
12
2
作者
孙之中
刘朝红
陈其华
易倩
羊羡
赵姣
林雅思
何欢
刘均瑜
机构
湖南中医药大学第一附属医院
湖南中医药大学
出处
《陕西中医》
CAS
2022年第12期1664-1668,共5页
基金
湖南省临床医疗技术创新引导项目(2020SK51407)。
文摘
目的:观察象皮生肌膏对糖尿病足溃疡大鼠创面组织内转化生长因子-β1(TGF-β1)、胰岛素样生长因子-1(IGF-1)、纤维结合蛋白(FN)表达的影响,以及在愈合过程中上皮-间质转化(EMT)过程。方法:选择SPF级雄性SD大鼠40只,建立溃疡大鼠模型,其中10只作为空白组,其余30只大鼠建立糖尿病大鼠模型,造模成功后分为模型组、对照组、实验组。比较各组大鼠第7、14天创面愈合情况;实时荧光定量聚合酶链式反应法(RT-qPCR)检测各组第7、14天TGF-β1、IGF-1、FN的mRNA表达情况;Western blotting检测各组第7、14天EMT相关蛋白E-钙黏蛋白(E-cadherin)、纤连蛋白(Fibronectin)蛋白表达情况;酶联免疫反应法测定组织中血管内皮生长因子(VEGF)含量。结果:干预第7天,空白组、实验组的创面愈合率均高于模型组;与模型组相比,空白组、实验组E-cadherin表达降低,Fibronectin表达升高,而TGF-β1、IGF-1、FN的mRNA表达均高;与对照组相比,实验组E-cadherin蛋白表达降低,Fibronectin蛋白表达升高;与模型组相比,空白组、对照组、实验组的VEGF含量均高,差异有统计学意义(均P<0.05)。干预第14天,模型组的创面愈合率低于其他组;与模型组相比,空白组、实验组E-cadherin蛋白表达较低,Fibronectin蛋白表达较高,空白组、对照组、实验组FN mRNA表达均高,空白组、实验组TGF-β1的mRNA表达均高。与模型组相比,空白组、对照组、实验组的VEGF含量均高,差异有统计学意义(均P<0.05)。干预第14天,模型组、对照组、实验组的IGF-1的mRNA表达比较,差异无统计学意义(均P>0.05)。结论:象皮生肌膏能促进EMT过程,加快愈合速度,其途径可能是通过促进TGF-β1表达,介导IGF-1,调控FN实现。
关键词
糖尿病足溃疡
象皮生肌膏
转化生长因子-β1
胰岛素样生长因子-1
纤维结合蛋白
上皮-间质转化
Keywords
Diabetic foot ulcer
Xiangpi Shengji ointment
Transforming growth factorβ1
Insulin-like growth factor-1
Fibronectin
Epithelial-mesenchymal transition
分类号
R587.1 [医药卫生—内分泌]
下载PDF
职称材料
题名
基于生物信息学方法探讨银屑病关键差异基因的免疫浸润机制及相关中药预测分析
被引量:
3
3
作者
沈乐乐
沈浮
孙立新
王子加
刘均瑜
李静
席建元
机构
宁夏医科大学
湖南中医药大学
湖南中医药大学第一附属医院
出处
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1663-1674,共12页
基金
湖南省教育厅重点项目资助(19A363)
湖南省科技创新计划项目(70809452017)。
文摘
目的探讨银屑病关键差异基因的免疫浸润机制及分析预测相关作用中药。方法利用基因芯片数据库(Gene Expression Omnibus,GEO),对银屑病基因探针芯片数据进行富集分析和免疫浸润分析。运用R语言及相关安装包程序对银屑病差异基因进行基因本体论(GO)及基因通路富集分析(KEGG);通过CIBERSORT反卷法对22类免疫细胞在银屑病的含量及比例进行分析;利用COREMINE数据库对明显富集的免疫相关的生物学过程及核心靶基因进行中药预测。结果银屑病相关的蛋白网络互作关键靶基因涉及KIF2C、BUB1、BUB1B等14个靶基因,涉及中性粒细胞活化、淋巴细胞迁移、白细胞趋化性等多种免疫相关途径,与自身免疫、炎症、心肌代谢通路密切相关。CIBERSORT反卷积法对银屑病的免疫相关性分析中,调节性T细胞、活化的树突状细胞与活化的CD4^(+)记忆性T细胞呈正相关,而活化的树突状细胞与静息肥大细胞、巨噬细胞M2呈负相关。在总体样本中,与正常皮肤组织组相比,银屑病皮损组织中中性粒细胞、活化的树突状细胞、静息的CD4^(+)记忆T细胞明显增高,而静息肥大细胞则明显减少,而在配对样本中记忆B细胞在银屑病组织中呈现上升趋势,而调节性T细胞呈下降趋势。免疫相关性分析中,调节性T细胞、活化的树突状细胞与活化的CD4^(+)记忆性T细胞呈正相关,而活化的树突状细胞与静息肥大细胞、巨噬细胞M2呈负相关。通过COREMINE预测发现,半枝莲、白花蛇舌草、人参、黄芪、防己与银屑病相关免疫浸润的关系最密切,且多归为肺经,功效多与清热补虚相关。结论中性粒细胞、树突状细胞、CD4^(+)记忆T细胞、调节性T细胞与银屑病关系密切,银屑病相关的差异基因涉及多种免疫相关生物学过程及通路,筛选出半枝莲、白花蛇舌草、人参、黄芪、防己等中药可能为其潜在的分子药物来源。
关键词
银屑病
免疫浸润
生物信息学
中药预测
半枝莲
白花蛇舌草
人参
Keywords
Psoriasis
immune infiltration
bioinformatics
prediction of traditional Chinese medicine
Scutellaria barbata
Hedyotis diffusa
ginseng
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学及分子对接技术分析“半边莲-白花蛇舌草”药对治疗银屑病的作用机制
沈乐乐
席建元
孙立新
王子加
刘均瑜
李静
《天然产物研究与开发》
CAS
CSCD
2021
10
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职称材料
2
象皮生肌膏对糖尿病足溃疡大鼠创面组织内上皮-间质转化过程的影响
孙之中
刘朝红
陈其华
易倩
羊羡
赵姣
林雅思
何欢
刘均瑜
《陕西中医》
CAS
2022
12
下载PDF
职称材料
3
基于生物信息学方法探讨银屑病关键差异基因的免疫浸润机制及相关中药预测分析
沈乐乐
沈浮
孙立新
王子加
刘均瑜
李静
席建元
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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