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基于融合相似性和三部图的circRNA与疾病关联预测
1
作者
王波
刘庭斌
+2 位作者
张剑飞
杜晓昕
王鑫炜
《浙江大学学报(工学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期2467-2475,共9页
传统的生物医学实验方法验证circRNA与疾病之间的关系存在耗时、耗力且成本过高的问题,为此提出基于三部图融合相似性的circRNA与疾病关联预测研究的模型(FSTPGCDA). FSTPGCDA引入circRNA-disease关联信息、circRNA-gene关联信息、circ...
传统的生物医学实验方法验证circRNA与疾病之间的关系存在耗时、耗力且成本过高的问题,为此提出基于三部图融合相似性的circRNA与疾病关联预测研究的模型(FSTPGCDA). FSTPGCDA引入circRNA-disease关联信息、circRNA-gene关联信息、circRNA序列信息和疾病语义信息.进行拉普拉斯特征映射和Jaccard指标的融合相似性计算得到相似性矩阵,将不同相似性算法得到的相似性矩阵加权融合得到融合相似性矩阵.利用circRNA-disease关联矩阵和circRNA-gene关联矩阵构建gene-circRNA-disease三部图.通过融合相似性方法为三部图分配初始资源,使用贪心算法进行资源分配.实例验证表明,FSTPGCDA的预测性能和鲁棒性较好.
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关键词
circRNA与疾病关联
多源信息融合
相似性融合
三部图
实例验证
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职称材料
脐橙果实套袋技术初探
被引量:
13
2
作者
赖晓桦
刘庭斌
+1 位作者
李家棠
严翔
《中国南方果树》
北大核心
2001年第3期10-11,共2页
关键词
脐橙
果实套袋
外观品质
可溶性固形物
果实着色
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职称材料
提高脐橙外观质量的几点意见
被引量:
2
3
作者
李家棠
刘庭斌
《江西园艺》
2001年第2期9-10,共2页
关键词
脐橙
外观品质
果实套袋
合理用药
疏果
施肥
采后处理
下载PDF
职称材料
脐橙果实套袋试验
4
作者
李家棠
刘庭斌
《浙江柑橘》
2003年第3期18-20,共3页
近几年随着果农对脐橙外观质量的重视,对脐橙套袋的积极性相应提高,市场上也就相继出现了脐橙专用纸袋.为了进一步弄清果实套袋的利弊及相关的操作技术,并筛选出相对理想的纸袋种类向果农推荐,于2002年选用市场上销售的纸袋进行田间试验...
近几年随着果农对脐橙外观质量的重视,对脐橙套袋的积极性相应提高,市场上也就相继出现了脐橙专用纸袋.为了进一步弄清果实套袋的利弊及相关的操作技术,并筛选出相对理想的纸袋种类向果农推荐,于2002年选用市场上销售的纸袋进行田间试验,现将试验情况小结如下.
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关键词
脐橙
果实套袋
试验
纸袋破损率
可溶性固形物
着色效果
下载PDF
职称材料
谈脐橙套袋
5
作者
李家棠
刘庭斌
《江西园艺》
2002年第3期12-13,共2页
关键词
脐橙
果实套袋
果实外观品质
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职称材料
题名
基于融合相似性和三部图的circRNA与疾病关联预测
1
作者
王波
刘庭斌
张剑飞
杜晓昕
王鑫炜
机构
齐齐哈尔大学计算机与控制工程学院
出处
《浙江大学学报(工学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期2467-2475,共9页
基金
黑龙江省教育厅基本科研业务费面上项目(145209125)。
文摘
传统的生物医学实验方法验证circRNA与疾病之间的关系存在耗时、耗力且成本过高的问题,为此提出基于三部图融合相似性的circRNA与疾病关联预测研究的模型(FSTPGCDA). FSTPGCDA引入circRNA-disease关联信息、circRNA-gene关联信息、circRNA序列信息和疾病语义信息.进行拉普拉斯特征映射和Jaccard指标的融合相似性计算得到相似性矩阵,将不同相似性算法得到的相似性矩阵加权融合得到融合相似性矩阵.利用circRNA-disease关联矩阵和circRNA-gene关联矩阵构建gene-circRNA-disease三部图.通过融合相似性方法为三部图分配初始资源,使用贪心算法进行资源分配.实例验证表明,FSTPGCDA的预测性能和鲁棒性较好.
关键词
circRNA与疾病关联
多源信息融合
相似性融合
三部图
实例验证
Keywords
circRNA and disease association
multi-source information fusion
similarity fusion
tripartite graph
case validation
分类号
TP393 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
脐橙果实套袋技术初探
被引量:
13
2
作者
赖晓桦
刘庭斌
李家棠
严翔
机构
江西省赣州市柑桔研究所
出处
《中国南方果树》
北大核心
2001年第3期10-11,共2页
关键词
脐橙
果实套袋
外观品质
可溶性固形物
果实着色
分类号
S666 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
提高脐橙外观质量的几点意见
被引量:
2
3
作者
李家棠
刘庭斌
机构
江西省赣州市柑桔研究所
出处
《江西园艺》
2001年第2期9-10,共2页
关键词
脐橙
外观品质
果实套袋
合理用药
疏果
施肥
采后处理
分类号
S666 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
脐橙果实套袋试验
4
作者
李家棠
刘庭斌
机构
江西省赣州市柑橘科研所
出处
《浙江柑橘》
2003年第3期18-20,共3页
文摘
近几年随着果农对脐橙外观质量的重视,对脐橙套袋的积极性相应提高,市场上也就相继出现了脐橙专用纸袋.为了进一步弄清果实套袋的利弊及相关的操作技术,并筛选出相对理想的纸袋种类向果农推荐,于2002年选用市场上销售的纸袋进行田间试验,现将试验情况小结如下.
关键词
脐橙
果实套袋
试验
纸袋破损率
可溶性固形物
着色效果
分类号
S666 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
谈脐橙套袋
5
作者
李家棠
刘庭斌
机构
江西省赣州市柑桔科研所
出处
《江西园艺》
2002年第3期12-13,共2页
关键词
脐橙
果实套袋
果实外观品质
分类号
S666 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于融合相似性和三部图的circRNA与疾病关联预测
王波
刘庭斌
张剑飞
杜晓昕
王鑫炜
《浙江大学学报(工学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
脐橙果实套袋技术初探
赖晓桦
刘庭斌
李家棠
严翔
《中国南方果树》
北大核心
2001
13
下载PDF
职称材料
3
提高脐橙外观质量的几点意见
李家棠
刘庭斌
《江西园艺》
2001
2
下载PDF
职称材料
4
脐橙果实套袋试验
李家棠
刘庭斌
《浙江柑橘》
2003
0
下载PDF
职称材料
5
谈脐橙套袋
李家棠
刘庭斌
《江西园艺》
2002
0
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职称材料
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