月月竹竹秆变色后全长转录组分析

为探究月月竹竹秆受到光照由绿色变为紫色的分子机制,本研究采集月月竹同一竹节紫色部分(Z)、渐变部分(M)和绿色部分(L)的竹青,提取RNA,利用PacBio Sequel三代全长转录组测序技术,结合生物信息学方法对不同颜色的竹青进行全长转录组分析。结果表明,经过三代测序和数据质量控制,共获得非冗余转录本66961条,长度为500~3000 bp,平均长度1389.22 bp,序列总长度为93.02 Mbp,N50为1830 bp,G+C碱基含量为49.56%。利用NR、Swiss-Prot、COG、GO、KEGG和Pfam数据库对所有转录本进行功能注释,共有56938条转录本被成功注释,占全部转录本的85.03%;49115条转录本被GO注释,其中催化活性、细胞器、代谢过程分别是GO数据库分子功能、细胞组分和生物过程中含转录本最多的项目;28231个转录本被KEGG数据库注释,其中与碳水化合物代谢和基因翻译相关的转录本最多。结合GO注释和KEGG注释,66961条转录本中有381条转录本与光信号的感受、传递以及光调控相关,包括红光和远红光的受体蛋白PHYA、PHYB及信号通路蛋白PIF3、ELF3,蓝光的受体蛋白CRY、ZTL及信号通路蛋白COP1、SPA1、ELF3、GI、HY5等。类黄酮(包括花青素)代谢、叶绿素合成、类胡萝卜素合成等与植物色素合成相关通路分别含有转录本187条、44条和72条。全长转录本共获得2079个转录因子,其中包括18个由35个转录本编码的与花青素合成相关的R2R3MYB转录因子。CNCI、CPC、Pfam、PLEK等数据库同时注释到的长链非编码RNA(LncRNA)6359个,数量高于孝顺竹等其他竹种。本研究获得了高质量的月月竹竹青全长转录组数据,与竹秆变色相关的红光和蓝光受体及光信号传递蛋白,与花青素、叶绿素和类胡萝卜素合成相关的转录因子及长链非编码RNA(LncRNA),为进一步深入分析月月竹竹秆变色机制提供基础。

CAT、POD和APX 3种酶活力SI单位的换算

目前CAT、POD和APX等氧化还原反应酶类的酶活单位在中文期刊中存在着极大的差别,并且在很多期刊中,这3种酶所使用的单位也不是国际单位制(SI)单位,为了进一步推广SI单位的使用,从springer数据库中下载了发表于2013年—2014年含有这3种酶的45篇文章,CAT、POD和APX的活性单位可以分别通过3个公式将原来使用U作为酶活单位的方式换算为以kat作为其活性单位的表示,其中CAT通过H2O2在240 nm下的43.6 L/(mol·cm)摩尔吸收系数转换为SI单位(以kat表示),POD的可以通过470 nm下愈创木酚氧化产物的26.6 L/(mmol·cm)摩尔吸收系数由U表示的单位换算为以kat的SI单位,APX的活性单位可以通过反应物抗坏血酸在290 nm下的2.8 L/(mmol·cm)换算为SI单位。

SOD活性测定普遍使用非SI单位原因探讨

通过对发表于2013—2014年被spinger数据库收录的33篇和2014年被中国知网收录的15篇含有SOD的文章进行分析后发现:这些文章中,尤其外文期刊的文章中,都使用U作为SOD活性的单位,而不是使用SI规定的kat。造成这种现象的原因,一是由于目前使用最广泛的测定SOD活性的化学方法,都是间接表达了SOD的活性,使用U作为SOD的单位更加方便;二是绝大部分研究者仅仅将SOD作为阐述其科学研究内容的一个生理指标,他们在意的是SOD相对活性而不是绝对活性,SOD无论使用何种单位对阐述作者研究的科学问题并无影响,所以研究者更喜欢使用更简洁的方式表示SOD的单位。因此,需要广大科学研究者和编辑共同努力,重新定义SOD单位和推广SI单位。

Cre-loxp系统在构建大库容噬菌体抗体库中的应用

以杂交瘤细胞技术为基础的单克隆抗体技术已经得到了广泛的应用,但此技术所得抗体要经过动物免疫、细胞融合以及克隆,选择周期长、过程复杂。近年来,噬菌体抗体(Phage antibody libraries)技术发展迅速,用该技术可以不经免疫即可得到大量的抗体,实现抗体的快速、大量制备。一个有效的抗体库至少要达到109的库容量,抗体库的库容量越高,抗体的亲和性越高。Cre-loxp体内重组系统可以有效增大抗体库的库容性,保证库多样性,因此为高容量抗体库的发展提供了有利的工具。本文介绍了抗体库、Cre-loxp系统以及其在构建大容量抗体库中的应用。

食用酱油中曲霉的检测方法

为了快速检测酱油中黄曲霉毒素和赭曲霉毒素产生菌的污染,利用现代分子技术并结合曲霉菌的一些菌落与孢子特征差异,建立了曲霉菌快速检测方法。结果表明,使用黑曲霉钙调蛋白基因所设计的黑曲霉特异性引物,能够将黑曲霉与其他曲霉分离,黑曲霉中可以扩增出钙调蛋白基因特异性片段,而在米曲霉和黄曲霉中不能扩增到该基因片段。利用aflR等多个已知基因设计特异性引物,扩增结果表明,米曲霉和黄曲霉的菌株并无特异性条带差异。但是,黄曲霉与米曲霉的菌落特征及孢子特征差异显著。由此建立的以PCR检测结合菌株培养特征区分多种曲霉的方法,可以用于检测酱油中黄曲霉毒素和赭曲霉毒素产生菌的污染。

转Hpa1(10-42)小麦分子鉴定及赤霉病抗性功能评价

【目的】筛选出抗赤霉病转Hpa110-42小麦植株,为抗赤霉病小麦新品种的选育提供材料。【方法】以转Hpa110-42小麦T2植株和受体扬麦158为供试材料,通过PCR、Southern blotting、RT-PCR等分子技术进行外源基因的整合与表达检测,并采用单花滴注法鉴定转基因小麦的赤霉病抗性,同时探讨其抗性生理。【结果】经分子检测证明,外源Hpa110-42以1—3个拷贝整合到小麦基因组中并能够稳定遗传,在转录水平上也能正常表达。赤霉病抗性鉴定表明,株系T2-17、T2-15、T2-68、T2-44和T2-36的平均病小穗率极显著低于扬麦158。除T2-17外,其余株系的平均病小穗率极显著高于苏麦3号,均未达到苏麦3号的抗性水平。T2-17株系平均病小穗率显著低于T2-15、T2-68和T2-44,极显著低于T2-36、T2-11和T2-20株系。抗性生理分析显示,接种赤霉菌孢子后,所有植株的苯丙氨酸解氨酶(PAL)、几丁质酶、β-1,3-葡聚糖酶活性均上升,但转基因高抗植株比扬麦158上升更快,而感病株上升相对缓慢;尽管可溶性蛋白含量呈下降趋势,但转基因植株的高抗植株始终高于其它株。β-1,3-葡聚糖酶活性和可溶性蛋白含量与赤霉病抗性等级值呈极显著负相关。【结论】外源Hpa110-42整合到小麦基因组中,能稳定遗传并正常表达,正向参与了小麦赤霉病抗性调控,获得了抗赤霉病转Hpa110-42小麦植株。

钩梢对金佛山方竹枝条可塑性及其生长动态的影响

【目的】探究钩梢对金佛山方竹分枝结构的影响,明确钩梢作用下金佛山方竹在枝条可塑性方面的策略,为金佛山方竹高效培育提供理论依据。【方法】以顶箐山金佛山方竹为材料,使用不同钩梢强度(未钩梢、1/4钩梢、1/3钩梢和1/2钩梢)处理,通过测量并分析立竹枝条生物量、冠型特征(全高、枝下高、枝盘数、隐芽数)和冠形结构因子(枝分角、枝夹角、枝长和枝径)等指标,评价不同钩梢强度的作用效果,并运用Richards方程对枝条生长数据进行拟合,构建时间-发育预测模型。【结果】(1)钩梢明显降低了金佛山方竹枝条的生物量,并且随着钩梢强度的增加,枝条总生物量降低越明显,其中对一级枝条生物量的影响最显著,对二级枝条生物量影响较弱。(2)钩梢降低了金佛山方竹总株高、枝下高、枝盘数和隐芽数,钩梢强度越强影响效果越明显。(3)对金佛山方竹施加较高强度(1/3和1/2钩梢)钩梢后,立竹下层枝条长度显著增加。(4)金佛山方竹可塑性指数受到钩梢影响最大的性状为枝夹角,枝长。(5)钩梢强度对立竹中下层枝条生长速率影响最大为1/2钩梢处理,但是1/3和1/4钩梢处理可以明显使立竹下层枝条的发育时间提前。【结论】钩梢处理降低了金佛山方竹的全株高度、枝盘数,枝下高以及一级分枝的生物量,但是钩梢处理却增加枝条的最大长度,减少了枝夹角,同时增加了枝条的生长速率,使枝条更快生长。钩梢明显改变了金佛山方竹枝条的可塑性,影响了枝条的动态生长。

高校期刊编辑职业倦怠的生态学解析

编辑队伍建设中,职业倦怠现象是影响编辑身心健康、工作效率的重要因素。从生态学的视角对高校期刊编辑职业倦怠现象进行探析,结合个体因素和外界环境分析编辑职业倦怠产生的深层次原因,利用生态学的理念以及生态链法则、生态平衡理论和生态和谐理论,引导编辑树立动态工作思路理念,创新和谐共生编辑理念,正确认知编辑职业生态稳定机制,建立与社会需求全面协调、相辅互存的编辑工作机制。

再议科技期刊中Taq酶活性及其浓度单位的标注

Taq酶是生物技术领域中经常用到的检测指标,在学术论文中常有涉及。不同期刊对Taq酶单位的标注有差异,有些期刊将其活性单位标注为μmol/min,有些期刊将其活性单位与浓度单位均标注为U。通过查阅文献、有关标准和规定,笔者认为Taq酶活性单位应标准为μmol/min,而其浓度单位宜用μmol/μL·min表示。

科技期刊发展策略研究——基于稿约在新兴媒体中的应用

随着网络时代的发展,科技期刊的信息传播效率成倍提高。稿约是期刊为文稿征集与编辑出版而制定的简要规则,其及时发布有利于期刊征集到符合自身要求的文稿。网络时代新兴媒体中,在期刊各自的互联网门户网站上及时刊登稿约,可以有目的地面向自己的"微受众"定向征集优秀稿源,在节省纸版的同时对于宣传期刊宗旨、指导作者写作投稿起非常重要的作用。交互性较强的微博中稿约的刊登,可以在提供学术动态的同时,深入互动了解读者所需,积极与粉丝互动助推科技期刊良好发展。新兴微信公众号的运用,可以在稿约过程中,恰当地推送节奏发布给相关研究人员精选主题,弥补一般网站无法及时沟通的不足,从而营造出良好的期刊信誉和编辑服务形象。

外施核黄素诱导小麦对白粉病菌的抗性

核黄素是一种植物抗病性激发子,能够激发植物的防御反应使植物对病原菌起到抗性作用。为研究核黄素诱导小麦对白粉菌抗性,利用不同浓度的核黄素(0,5,10,15,25μmol/L)处理小麦幼苗植株,12 h后接种白粉菌,结果表明,核黄素处理的小麦幼苗叶片中H2O2短时间内有显著的积累,小麦发病情况与对照相比显著降低。叶片中诱导产生的H2O2量与核黄素的浓度有关,但不同浓度处理诱导植株产生的抗病性没有差异。在喷施核黄素的小麦上接种小麦白粉病菌同时加入H2O2清除剂CAT,核黄素诱导小麦抗病性消失。试验结果表明核黄素能够诱导小麦增强对抵抗白粉病菌的侵染能力,核黄素诱导小麦对白粉病菌的抗性依赖于H2O2。

语文生活化 生活语文化

目前,随着新的课程标准实施,基础教育改革在各地也已是如火如荼.新的课程标准带着新的教育教学理念,如春风般吹进我们的校园,影响着我们师生的生活.语文教学从此与生活结下不解之缘,充满了迷人的生活气息.我们的语文,生活化了;我们的生活,语文化了.

例谈优化高中数学例题教学的策略

例题教学是教学基础知识和基本技能的核心要素,是中学数学教学中至关重要的一种课型,不仅可以起到夯实基础知识和点拨解题思维的效能,还能指引学生学会思考、学会学习,同时是学好数学的最重要的一环.教师应从当前教学内容出发,从学生的具体学情和教学要求出发,设计行之有效的例题教学策略,使得高中数学例题教学可以满足学生的学习需求,推动高中数学教学水平的不断提升.

多媒体课件制作与使用刍议

对于多媒体技术,不能过于"神化",但也不能视之为可有可无的工具。一方面,要在制作多媒体课件的过程中提高教师的信息技术素养,避免一味地奉行"拿来主义"而导致技术止足不前;另一方面,要与课堂教学内容有效地整合,实现技术与教学合而为一,甚至忘记技术的存在,达到如同"人剑合一"的境界。

浅谈探究式教学法在高中数学中的应用

探究式教学是目前比较流行的一种高中数学教学方法，对于提高学生思维能力和创新能力具有十分重要的意义。探究式教学方法对数学事实进行观察和分析后，提出有意义的数学问题，针对问题进行观察和实验，用归纳、类比和猜想等合情推理的方法探求数学结论，用演绎推理的方法对结论做出证明，最后对探究结果和解决问题的思维过程进行反思和交流。本文基于此对探究式教学的步骤和实践进行了分析和探讨。

高校科技期刊微传播基础和发展分析

网络为期刊的发展提供了宽广的平台,但是由于高校科技期刊的主要目的是服务于科研工作者,是一种'微受众'的传播形式,特别是目前的大数据环境下,数字阅读从书本、文献阅读向知识要素阅读的转变,这就要求高校科技期刊在目前的网络环境下应注重发掘微传播方式,聚合优质资源,突出期刊的特质,构建高校科技期刊的个性化微传播服务系统。高校科技期刊微传播的基础首先要建立自己基于一级域名的网站,要能够突出自身刊物的特色,具有较强的直观性,做到实时更新,并积极地通过微博、微信以及社交网络等平台加强对期刊内容的推送,通过QQ、飞信等即时通讯增加与作者、专家以及读者的交流。

加权被引频次--科技期刊单篇论文短期的一种评价方法

期刊为了培养团结作者群、吸引优质稿源、扩大影响力,有必要对刊出文章的影响效果进行评价,单篇论文的评价指标常采用被引频次。笔者在对《南京林业大学学报:自然科学版》近年所刊出文章进行分析的基础上,提出了一种对被引频次进行加权的方法,对得到的加权被引频次在年份和期数之间进行方差分析,并对使用加权被引频次排序后的前160篇文章中年份和期数的分布进行了检验,发现加权后的被引频次受发表时间的影响无显著差异,进一步的分析发现,由于文章被引用的绝对数量差异的不可控的原因,这种加权方法较适用于对与当前时间相隔一年所刊发文章的评比。

大数据下初步分析我国期刊自引情况

过高的期刊自引会对期刊评价产生一定的误判现象,为了更好地了解我国期刊的自引情况,文章以2013—2015年版中国知网《中国学术期刊影响因子年报(自然科学与工程技术)》(统计年为2012—2014)的数据为基础,对我国63个学科、4 000左右的期刊的自引率采用统计方法进行了分析。结果表明:63个学科期刊平均自引率主要分布在0.05~0.20之间,物理学和文学学科表现出过高的自引率,63个学科期刊平均自引率在3个统计年中表现出相似分布的特点,频数分布呈现正态性,自引率在不同统计年之间具有显著性差异,不同学科期刊平均自引率之间也具有较大差异性,并且不同学科自引率的高低与学科期刊平均被引集中度呈负相关,高自引率的学科表现出学科的封闭性和不交叉性。

基于VBA的稿件采编系统中批量信息的修改

在使用稿件采编系统时,经常要对稿件信息、审稿专家信息等数据库中单个信息进行定向修改和补充,有时还要批量地进行这一操作,但这是一个重复的过程。为了将这一重复过程简单化,同时为了在定向修改信息时不影响其他信息的完整性,利用VBA语言编写了Excel中2个宏程序,一个以上传DOI号为例来对三才采编系统的已发表的稿件信息界面进行修改,另一个宏程序以修改专家信息为例对"专家信息修改界面"进行定向修改。使用上述宏程序在《南京林业大学学报(自然科学版)》的采编系统中上传了4 317篇文章的DOI号,对181位专家的信息进行了修改。实践证明,通过这些操作完善了稿件采编系统的内容信息,提高了编辑工作效率。

“互引指数”在期刊评价体系中的作用

为了探究"互引指数"在期刊定量评价中的作用,以林学中4本期刊为研究对象,以《中国学术期刊影响因子年报》和中国知网引文数据库中的6年数据为基础,从4本期刊影响因子和他引影响因子的年变化表象开始,分析了4本期刊的互引指数以及引用期刊的情况。在2009—2014统计年,4本林业期刊影响因子主要与他引总引比呈现相关性,4本期刊中的A刊和B刊两本期刊虽然在2012和2013统计年具有较高的影响因子和他引影响因子,却具有较低互引指数,根据互引指数的定义以及两本期刊引用期刊的分布情况,这两本期刊高的影响因子和他引影响因子并不能代表这两本期刊的被引期刊分布广度的合理性,只有互引指数可以。互引指数可以补充影响因子和他引影响因子在期刊评价中的不足,能够代表某期刊的被引期刊分布广度的合理性和期刊之间互引情况的严重性,对以影响因子为主的定量评价体系表现出约束作用。