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温室白粉虱触角miRNA转录组分析及调控嗅觉相关基因miRNA的鉴定
被引量:
1
1
作者
杨晓洁
廖世群
+4 位作者
刘映杨
蔡赛波
李宏伟
林连兵
张棋麟
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期51-59,共9页
microRNA (miRNA)是一类真核生物中内源性的非编码小RNA,在基因转录后水平调控靶基因的小分子。温室白粉虱(Trialeurodes vaporariorum)是一种危害多种蔬菜、花卉及农作物等的世界性害虫,可以导致植物细菌性病害的传播和流行,其触角对...
microRNA (miRNA)是一类真核生物中内源性的非编码小RNA,在基因转录后水平调控靶基因的小分子。温室白粉虱(Trialeurodes vaporariorum)是一种危害多种蔬菜、花卉及农作物等的世界性害虫,可以导致植物细菌性病害的传播和流行,其触角对温室白粉虱的取食、行为和生长发育等起到了重要作用。本研究以温室白粉虱成虫触角为材料,通过Illumina高通量测序平台对其miRNA转录组进行测序,结合生物信息学分析,鉴定到83个已知miRNAs和38个新miRNA (novelmirs),并对它们表达水平进行定量分析。此外,对已知miRNA种子序列碱基编辑情况进行了调查。最后,利用生物信息学工具对miRNAs进行靶基因预测和功能注释,获得了miRNA-靶基因关系及调控嗅觉相关基因的miRNAs。本研究为深入探讨温室白粉虱触角miRNA中嗅觉相关基因的调控关系,了解昆虫嗅觉形成的分子机制提供了参考。
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关键词
温室白粉虱
触角miRNA转录组
高通量测序
嗅觉相关基因
原文传递
题名
温室白粉虱触角miRNA转录组分析及调控嗅觉相关基因miRNA的鉴定
被引量:
1
1
作者
杨晓洁
廖世群
刘映杨
蔡赛波
李宏伟
林连兵
张棋麟
机构
昆明理工大学生命科学与技术学院
云南省高校饲用抗生素替代技术工程研究中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期51-59,共9页
基金
国家自然科学基金项目(No.31960286)
昆明理工大学高层次人才平台建设项目(No.KKZ7201926005)共同资助。
文摘
microRNA (miRNA)是一类真核生物中内源性的非编码小RNA,在基因转录后水平调控靶基因的小分子。温室白粉虱(Trialeurodes vaporariorum)是一种危害多种蔬菜、花卉及农作物等的世界性害虫,可以导致植物细菌性病害的传播和流行,其触角对温室白粉虱的取食、行为和生长发育等起到了重要作用。本研究以温室白粉虱成虫触角为材料,通过Illumina高通量测序平台对其miRNA转录组进行测序,结合生物信息学分析,鉴定到83个已知miRNAs和38个新miRNA (novelmirs),并对它们表达水平进行定量分析。此外,对已知miRNA种子序列碱基编辑情况进行了调查。最后,利用生物信息学工具对miRNAs进行靶基因预测和功能注释,获得了miRNA-靶基因关系及调控嗅觉相关基因的miRNAs。本研究为深入探讨温室白粉虱触角miRNA中嗅觉相关基因的调控关系,了解昆虫嗅觉形成的分子机制提供了参考。
关键词
温室白粉虱
触角miRNA转录组
高通量测序
嗅觉相关基因
Keywords
Trialeurodes vaporariorum
Antennal miRNA transcriptomes
High-throughput sequencing
Olfactoryrelated genes
分类号
S433.3 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
温室白粉虱触角miRNA转录组分析及调控嗅觉相关基因miRNA的鉴定
杨晓洁
廖世群
刘映杨
蔡赛波
李宏伟
林连兵
张棋麟
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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