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高通量测序分析凡纳滨对虾育苗期水体菌群结构特征
被引量:
23
1
作者
薛明
何瑶瑶
+5 位作者
邱孟德
梁华芳
陈第省
王立群
刘杨锋
温崇庆
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期785-794,共10页
为了解凡纳滨对虾育苗期正常苗池水体菌群结构和多样性变化,实验采用Illumina MiSeq高通量测序水体细菌16S rDNA V4区,比较幼体在无节V期(N5)、溞状Ⅱ期(Z2)、糠虾Ⅰ期(M1)与仔虾Ⅰ期(P1)时的水体菌群特征。结果显示,水体菌群Shannon多...
为了解凡纳滨对虾育苗期正常苗池水体菌群结构和多样性变化,实验采用Illumina MiSeq高通量测序水体细菌16S rDNA V4区,比较幼体在无节V期(N5)、溞状Ⅱ期(Z2)、糠虾Ⅰ期(M1)与仔虾Ⅰ期(P1)时的水体菌群特征。结果显示,水体菌群Shannon多样性指数随幼体发育先降后升,而Pielou均匀度指数除在N5时稍高外,在其余阶段都很接近。育苗期间,变形菌门为水体绝对优势菌群(50.0%~88.0%),尤其红杆菌科从N5到P1阶段分别占24.2%、61.6%、43.3%和51.8%;拟杆菌门在各期丰度均>9.7%,其中腐螺旋菌科以5.3%~16.9%优势分布于后3个阶段;放线菌门在后3个期都为优势类群,并以微杆菌科为主,丰度分别达5.6%、37.6%和10.8%;而疣微菌门只在P1时表现为优势(5.3%)。苗池水体核心菌属主要由洛克氏菌、海命菌、栖东海菌、亚硫酸杆菌和2个分类未定属构成。可见水体菌群呈高度多样而动态变化,且N5菌群明显区别于后3个阶段。育苗期间水体主要环境因子总体波动较小,对优势操作分类单元(OTU)丰度分布无显著影响。研究表明,凡纳滨对虾健康苗池水体菌群随幼体发育和饵料投喂而明显更替,其中核心菌群的潜在功能对维持水体生态系统稳定起重要作用,可为对虾育苗益生菌与健康苗池指示菌的筛选提供依据。
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关键词
凡纳滨对虾
水体菌群
育苗期
细菌多样性
高通量测序
下载PDF
职称材料
不同感染复数下海洋蛭弧菌DA5对溶藻弧菌的控制效率
被引量:
4
2
作者
陆友云
温崇庆
+6 位作者
李志桦
刘杨锋
邹乐诗
梁栩云
陈国权
黄子靖
薛明
《广东海洋大学学报》
CAS
2018年第2期30-36,共7页
【目的】研究宿主菌密度和感染复数对海洋蛭弧菌捕食弧菌效率的影响。【方法】以溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)zouA(下称"zouA")为宿主,通过海水共培养实验研究海洋蛭弧菌菌株DA5(下称"DA5")在初始宿主密度10~3~1...
【目的】研究宿主菌密度和感染复数对海洋蛭弧菌捕食弧菌效率的影响。【方法】以溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)zouA(下称"zouA")为宿主,通过海水共培养实验研究海洋蛭弧菌菌株DA5(下称"DA5")在初始宿主密度10~3~10~8 cfu/mL下24 h的生长,评估低感染复数和高感染复数下DA5对zouA 10 d的生物控制效果。【结果】DA5捕食所需最低zouA密度约为5×10~5 cfu/mL;在zouA密度≥10~6 cfu/mL时,DA5方对其发挥控制效应,且感染复数越高捕食效率越高,即使感染复数低至0.001,一定时间后DA5亦可有效控制zouA数量。而当初始zouA密度低至10~4 cfu/mL时,DA5需在感染复数≥100条件下方可显著控制zouA。【结论】宿主密度与感染复数均影响海洋蛭弧菌DA5对溶藻弧菌的控制效果。
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关键词
海洋蛭弧菌
溶藻弧菌
宿主密度
感染复数
生物控制
下载PDF
职称材料
题名
高通量测序分析凡纳滨对虾育苗期水体菌群结构特征
被引量:
23
1
作者
薛明
何瑶瑶
邱孟德
梁华芳
陈第省
王立群
刘杨锋
温崇庆
机构
广东海洋大学水产学院
出处
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期785-794,共10页
基金
国家自然科学基金(31372536
31502189)
广东省科技计划项目(2015A020209160)~~
文摘
为了解凡纳滨对虾育苗期正常苗池水体菌群结构和多样性变化,实验采用Illumina MiSeq高通量测序水体细菌16S rDNA V4区,比较幼体在无节V期(N5)、溞状Ⅱ期(Z2)、糠虾Ⅰ期(M1)与仔虾Ⅰ期(P1)时的水体菌群特征。结果显示,水体菌群Shannon多样性指数随幼体发育先降后升,而Pielou均匀度指数除在N5时稍高外,在其余阶段都很接近。育苗期间,变形菌门为水体绝对优势菌群(50.0%~88.0%),尤其红杆菌科从N5到P1阶段分别占24.2%、61.6%、43.3%和51.8%;拟杆菌门在各期丰度均>9.7%,其中腐螺旋菌科以5.3%~16.9%优势分布于后3个阶段;放线菌门在后3个期都为优势类群,并以微杆菌科为主,丰度分别达5.6%、37.6%和10.8%;而疣微菌门只在P1时表现为优势(5.3%)。苗池水体核心菌属主要由洛克氏菌、海命菌、栖东海菌、亚硫酸杆菌和2个分类未定属构成。可见水体菌群呈高度多样而动态变化,且N5菌群明显区别于后3个阶段。育苗期间水体主要环境因子总体波动较小,对优势操作分类单元(OTU)丰度分布无显著影响。研究表明,凡纳滨对虾健康苗池水体菌群随幼体发育和饵料投喂而明显更替,其中核心菌群的潜在功能对维持水体生态系统稳定起重要作用,可为对虾育苗益生菌与健康苗池指示菌的筛选提供依据。
关键词
凡纳滨对虾
水体菌群
育苗期
细菌多样性
高通量测序
Keywords
Litopenaeus vannamei
aquatic microbiota
hatchery phase
bacterial diversity
high-throughputsequencing
分类号
S968.2 [农业科学—水产养殖]
下载PDF
职称材料
题名
不同感染复数下海洋蛭弧菌DA5对溶藻弧菌的控制效率
被引量:
4
2
作者
陆友云
温崇庆
李志桦
刘杨锋
邹乐诗
梁栩云
陈国权
黄子靖
薛明
机构
广东海洋大学水产学院
出处
《广东海洋大学学报》
CAS
2018年第2期30-36,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31372536)
广东省科技计划项目(2015A020209160)
文摘
【目的】研究宿主菌密度和感染复数对海洋蛭弧菌捕食弧菌效率的影响。【方法】以溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)zouA(下称"zouA")为宿主,通过海水共培养实验研究海洋蛭弧菌菌株DA5(下称"DA5")在初始宿主密度10~3~10~8 cfu/mL下24 h的生长,评估低感染复数和高感染复数下DA5对zouA 10 d的生物控制效果。【结果】DA5捕食所需最低zouA密度约为5×10~5 cfu/mL;在zouA密度≥10~6 cfu/mL时,DA5方对其发挥控制效应,且感染复数越高捕食效率越高,即使感染复数低至0.001,一定时间后DA5亦可有效控制zouA数量。而当初始zouA密度低至10~4 cfu/mL时,DA5需在感染复数≥100条件下方可显著控制zouA。【结论】宿主密度与感染复数均影响海洋蛭弧菌DA5对溶藻弧菌的控制效果。
关键词
海洋蛭弧菌
溶藻弧菌
宿主密度
感染复数
生物控制
Keywords
marine Bdellovibrio-and-like organisms
Vibrio alginolyticus
prey density
multiplicity of infection
biocontrol
分类号
S917.1 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高通量测序分析凡纳滨对虾育苗期水体菌群结构特征
薛明
何瑶瑶
邱孟德
梁华芳
陈第省
王立群
刘杨锋
温崇庆
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
23
下载PDF
职称材料
2
不同感染复数下海洋蛭弧菌DA5对溶藻弧菌的控制效率
陆友云
温崇庆
李志桦
刘杨锋
邹乐诗
梁栩云
陈国权
黄子靖
薛明
《广东海洋大学学报》
CAS
2018
4
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职称材料
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