基于灯盏花全基因组SSR位点分析及多态性引物开发

本研究利用MISA工具筛选灯盏花基因组测序获得的462 622条scaffolds,对其SSR位点信息进行分析,Primer 3设计SSR引物,随机选取200对引物对60株灯盏花进行多态性扩增分析。研究结果表明:从灯盏花基因组中搜索到的231 852个SSR位点中,二核苷酸基序是主要的重复类型,占总SSR的47.14%;AT/AT是最多的二核苷酸重复基元,占二核苷酸重复基元的74.60%,AAT/ATT是出现最多的三核苷酸重复基元,占三核苷酸重复基元的15%。PCR扩增发现,200对引物中有30对(15%)表现出稳定的多态性差异。灯盏花基因组中SSR位点出现频率高,类型丰富;大量的SSR为灯盏花的遗传多样性分析和遗传图谱构建提供了丰富的候选分子标记,利于开展灯盏花的遗传育种研究。

灯盏花农艺性状与经济性状相关性分析

为深入了解灯盏花主要农艺性状和经济性状间的相关性,高效地选育新品种,本试验在田间选择了100株灯盏花植株,测定了主要农艺性状与活性成分含量,并进行了相关性分析。研究发现灯盏花单株间叶片数、分支数、干重和活性成分含量均差异巨大,叶片数、分支数、单株干重、活性成分含量均相差10倍以上,灯盏乙素最高含量为3.38%,最低仅有0.11%。相关分析表明,灯盏花单株干重与叶片数和分支数显著正相关,两类成分(灯盏乙素和咖啡酰奎宁酸酯类)含量也为正相关。同时,尽管叶片数、分支数和干重与活性成分含量负相关,但是与经济产量成正相关。通过研究发现,灯盏花单株产量主要由叶片数和分支数决定,灯盏乙素含量与咖啡酰奎宁酸酯类的含量正相关。因此,育种中可以选择多分支、多叶片和高灯盏乙素含量的单株建立群体,培育出高产、高经济产量的专用型新品种。