不同月龄苏淮育肥猪纤维表观消化率、肠道长度与微生物差异分析

[目的]本试验旨在探究不同月龄苏淮育肥猪耐粗饲特征(以纤维表观消化率为评定表型)、肠道发育及肠道微生物的差异,并分析肠道发育及微生物与纤维表观消化率的相关性。[方法]试验选取82头出生条件相近的苏淮猪,在相同饲养环境下饲养,分别在7、8月龄时进行屠宰。采集结肠后端内容物样品并测定不同月龄结肠后段各营养成分的表观消化率;测定肠道长度、周长,分析不同月龄苏淮育肥猪肠道营养成分表观消化率和肠道发育差异,并进行消化率与肠道长度、周长的相关性分析。同时,分别在7、8月龄猪中选取高纤维消化率组和低纤维消化率组各5头进行盲肠、结肠内容物常见纤维分解菌的丰度分析。[结果]8月龄苏淮猪的粗纤维、中性洗涤纤维、酸性洗涤纤维、粗蛋白和粗脂肪的表观消化率均显著高于7月龄(P<0.05),但8月龄苏淮猪大肠、小肠及整个肠道长度、盲肠、结肠周长与7月龄间无显著差异。盲肠周长与粗纤维、酸性洗涤纤维和粗脂肪的表观消化率呈显著正相关(P<0.05)。7月龄和8月龄苏淮猪的盲肠、结肠白化瘤胃球菌和柔嫩梭菌的丰度在高、低纤维消化率组间均无显著差异。7月龄苏淮猪的结肠柔嫩梭菌丰度在高、低纤维消化组均显著高于盲肠(P<0.05)。8月龄苏淮猪结肠柔嫩梭菌丰度在低纤维消化率组显著低于7月龄(P<0.05)。[结论]不同月龄苏淮猪耐粗饲特征不同,随月龄的增加,苏淮猪的消化性能逐渐完善,8月龄苏淮猪各营养成分表观消化率显著高于7月龄,且其纤维消化率与盲肠周长呈显著正相关,但肠道内容物中白化瘤胃球菌和柔嫩梭菌可能不是影响其纤维消化的关键微生物。

基于全基因组Fst和nSL分析鉴别苏淮猪中性洗涤纤维表观消化率相关候选基因位点

旨在鉴定苏淮猪(含25%淮猪和75%大白猪血统的国家级新品种)在培育过程中受选择的与纤维表观消化率性状相关的基因片段,为解析苏淮猪耐粗饲遗传机制奠定基础。本研究首先检测分析了331头160日龄苏淮猪个体的中性洗涤纤维(neutral detergent fiber,NDF)表观消化率,计算群体NDF表观消化率估计育种值(estimated breeding value,EBV),选择其中EBV极高和极低各10%的个体(N=66)进行猪80K芯片基因分型。借助群体分化指数(fixation index,Fst)和按长度划分隔离点数(number of segregating sites by length,nSL)法分析苏淮猪群体内的选择信号分布情况,寻找选择信号区域内与纤维消化相关的重要基因。最后,选择两种分析中受选择的共有SNPs位点在苏淮猪全群分型,开展与NDF表观消化率的关联性分析,进一步确定影响苏淮猪NDF表观消化率的SNPs位点。结果显示,通过对高、低NDF表观消化率苏淮猪群体芯片分型数据质控,共有51367个有效SNPs位点用于后续分析。通过Fst和nSL选择信号分析,共鉴定到146个受选择信号区域和361个受选择的基因,其中多个基因被报道与肠道健康和肠道发育等功能相关,包括MTHFD1L、PHLPP1、TRPM6、MCC、NEDD9、UVRAG和KLF5等基因。选择两种分析中受选择且共有的8个SNPs位点,通过SNP与苏淮猪全群NDF表观消化率的关联性分析,发现rs81363074、rs327393763和rs81404927位点与苏淮猪群体NDF表观消化率存在显著关联(P<0.05),rs81347101和rs318870857位点与苏淮猪群体NDF表观消化率存在极显著关联(P<0.01)。其中,rs81363074位点位于MCC基因第二内含子上。通过高、低NDF表观消化率苏淮猪群体Fst和nSL选择信号分析,筛选到146个受选择信号区域,鉴定到影响苏淮猪NDF表观消化率的受选择候选基因MTHFD1L、PHLPP1、TRPM6、MCC、NEDD9、UVRAG和KLF5,筛选到了5个与NDF表观消化率显著关联的SNPs位点。本研究结果为解析苏淮猪耐粗饲性状的遗传机制奠定了重要基础。

日粮纤维水平对梅山猪生长性能、纤维表观消化率及肠道微生物区系的影响

试验旨在研究日粮纤维水平对梅山猪生长性能、纤维表观消化率及肠道微生物区系的影响。选用54头体重(31.24±0.59)kg的健康梅山育肥阉公猪,随机分为基础日粮组、7%麸皮替代组(麸皮替代7%基础日粮)、14%麸皮替代组(麸皮替代14%基础日粮),每组6个重复(即每栏),每栏3头猪。预试期7 d,正试期28 d。结果表明:14%麸皮替代组梅山猪终末体重、平均日采食量以及粗蛋白质、粗脂肪、粗纤维、中性洗涤纤维和酸性洗涤纤维的表观全肠道消化率低于对照组(P<0.050),而7%麸皮替代组与基础日粮组无显著差异;随麸皮替代水平的升高,梅山猪粪便微生物丰度下降(Chao和Ace,线性P<0.05;Sobs,线性P<0.10),并且14%麸皮替代组的Unclassified_c__Clostridia、UCG-008、UCG-009、Fibrobacter、Cellul osilyticum、Lachnospiraceae_XPB1014_group、Papillibacter、Bacteroides、dgA-11_gut_group、norank_f__norank_o__Bradymonadales、norank_f__norank_o__WCHB1-41、norank_f__p-251-o5、norank_f__norank_o__norank_c__norank_p__WPS-2、norank_f__p-2534-18B5_gut_group和Akkermansia的相对丰度低于基础日粮组(P<0.050)。综上所述,用7%麸皮替代基础日粮时,梅山猪对粗蛋白质、能量的表观消化率显著降低,但其生长性能、各类纤维消化表观率以及肠道微生物区系未受到显著影响。因此,在梅山育肥猪饲养中用7%麸皮替代基础日粮是可行的。