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电泳评级法与Nano/Qubit浓度比值法评估二代测序文库片段化时间的一致性评价
1
作者
高洁
刘添齐
鲁涛
《中华病理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期855-858,共4页
目的评价电泳评级法及Nano/Qubit浓度比值法在二代测序建库DNA片段化过程中超声打断时间的一致性。方法收集中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科323例石蜡固定样本。分别通过DNA电泳评级法和Nano/Qubit浓度比值法确定二代...
目的评价电泳评级法及Nano/Qubit浓度比值法在二代测序建库DNA片段化过程中超声打断时间的一致性。方法收集中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科323例石蜡固定样本。分别通过DNA电泳评级法和Nano/Qubit浓度比值法确定二代测序建库DNA片段化过程中的超声打断时间,利用Kappa一致性检验对二者的一致性进行比较。结果Kappa系数表明电泳评级法与Nano/Qubit浓度比值法2种方法评估DNA超声打断时间的一致性良好(Kappa=0.540,P<0.05),但对于低质量标本,缺乏一致性:Nano/Qubit值>7.5(Kappa=0.021,P=0.751)或D级(Kappa=0.040,P=0.146)。结论电泳评级法与Nano/Qubit浓度比值评估二代测序文库DNA片段化时间的一致性良好,可以用Nano/Qubit值大致推算标本的质量,但对于Nano/Qubit值>7.5的标本,应当通过电泳评级法进行评估。
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关键词
中国医学科学院
北京协和医学院
一致性评价
Kappa系数
浓度比值
二代测序
评级法
电泳
原文传递
题名
电泳评级法与Nano/Qubit浓度比值法评估二代测序文库片段化时间的一致性评价
1
作者
高洁
刘添齐
鲁涛
机构
中国医学科学院
出处
《中华病理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期855-858,共4页
文摘
目的评价电泳评级法及Nano/Qubit浓度比值法在二代测序建库DNA片段化过程中超声打断时间的一致性。方法收集中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科323例石蜡固定样本。分别通过DNA电泳评级法和Nano/Qubit浓度比值法确定二代测序建库DNA片段化过程中的超声打断时间,利用Kappa一致性检验对二者的一致性进行比较。结果Kappa系数表明电泳评级法与Nano/Qubit浓度比值法2种方法评估DNA超声打断时间的一致性良好(Kappa=0.540,P<0.05),但对于低质量标本,缺乏一致性:Nano/Qubit值>7.5(Kappa=0.021,P=0.751)或D级(Kappa=0.040,P=0.146)。结论电泳评级法与Nano/Qubit浓度比值评估二代测序文库DNA片段化时间的一致性良好,可以用Nano/Qubit值大致推算标本的质量,但对于Nano/Qubit值>7.5的标本,应当通过电泳评级法进行评估。
关键词
中国医学科学院
北京协和医学院
一致性评价
Kappa系数
浓度比值
二代测序
评级法
电泳
分类号
R361.2 [医药卫生—病理学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
电泳评级法与Nano/Qubit浓度比值法评估二代测序文库片段化时间的一致性评价
高洁
刘添齐
鲁涛
《中华病理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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