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红嘴鸥TLR7基因克隆与生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
常华
段纲
+5 位作者
阮谦
罗倩敏
余琬玲
刘清琦
黄翠琴
项勋
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第1期43-52,共10页
【目的】克隆野生鸟类红嘴鸥Toll样受体7(TLR7)基因,并对其编码蛋白进行生物信息学分析,为后期TLR7蛋白的抗病毒活性研究做准备。【方法】采用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)扩增红嘴鸥TLR7基因全序列,...
【目的】克隆野生鸟类红嘴鸥Toll样受体7(TLR7)基因,并对其编码蛋白进行生物信息学分析,为后期TLR7蛋白的抗病毒活性研究做准备。【方法】采用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)扩增红嘴鸥TLR7基因全序列,通过生物信息学软件分析TLR7基因序列、稀有密码子、相似性及其编码蛋白的理化性质、跨膜区域、信号肽、N-糖基化位点、磷酸化位点和亚细胞定位,分别利用SOPMA和SWISS-MODEL软件预测TLR7蛋白的二级结构和三级结构。【结果】试验成功克隆红嘴鸥TLR7基因(GenBank登录号:MZ668652),全长1720 bp,开放阅读框(ORF)大小为1182 bp,存在39个稀有密码子,其中含8个连续稀有密码子,编码393个氨基酸;红嘴鸥TLR7基因与GenBank中原鸡、红腹角雉、鹌鹑、绿头鸭、黑天鹅、山雀、白鹭、帝企鹅、红喉潜鸟和巴布亚企鹅的TLR7基因相似性分别为85.7%、84.9%、85.4%、87.0%、87.8%、86.8%、91.0%、93.1%、93.1%和93.1%。系统进化树结果显示,其与白鹭的亲缘关系最近。TLR7蛋白分子式为C_(2080)H_(3256)N_(556)O_(567)S_(19),分子质量约为63 ku,理论等电点为9.25;该蛋白不存在跨膜结构和信号肽,含有6个N-糖基化位点和33个磷酸化位点,是疏水性蛋白,主要存在于细胞质中;TLR7蛋白二级结构主要以α-螺旋为主,约占48.09%,其次为无规则卷曲(32.06%)、延伸链(13.23%)和β-转角(6.62%),TLR7蛋白的三级结构与二级结构一致,且与模型蛋白人TLR7蛋白相似性为68.78%。【结论】红嘴鸥TLR7基因与白鹭进化关系较近,含有8个连续稀有密码子,体外表达较难,研究为进一步探索红嘴鸥TLR7蛋白抗病毒免疫机制提供重要参考。
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关键词
红嘴鸥
Toll样受体7(TLR7)
克隆
生物信息学分析
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职称材料
经皮穿刺置管引流治疗乳房脓肿40例
被引量:
2
2
作者
刘清琦
刘丹
+1 位作者
付建华
李柱明
《黔南民族医专学报》
2001年第3期144-144,共1页
为提高乳房脓肿的治愈率,我院于1995年1月~1999年12月采用经皮穿刺置管引流治疗乳房脓肿40例,收到较满意的效果,现分析如下.
关键词
乳房脓肿
穿刺术
引流
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职称材料
双管闭式引流治疗自发性气胸16例
3
作者
刘清琦
付建华
刘丹
《山东医药》
CAS
北大核心
2001年第21期32-32,共1页
关键词
自发性气胸
闭式引流
治疗
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职称材料
急性十二指肠溃疡穿孔修补后缝线对溃疡愈合的影响
4
作者
刘清琦
付建华
李柱明
《腹部外科》
2001年第3期179-179,共1页
关键词
急性十二指肠溃疡
穿孔
修补
缝线
溃疡愈合
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职称材料
急性坏死性筋膜炎8例诊治体会
被引量:
1
5
作者
李柱明
刘清琦
《黔南民族医专学报》
2001年第2期82-82,共1页
急性坏死性筋膜炎系较少见的严重外科感染,主要侵犯皮下脂肪和筋膜,造成广泛脂肪液化和筋膜坏死,产生严重全身中毒症状,病死率可达30%~50%.我科自1978~1999年共收治8例该病患者,现报道如下.
关键词
坏死性筋膜炎
厌氧菌
切口引流
诊断
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职称材料
大狼毒根部乙酸乙酯萃取物抑菌活性及急性毒性作用
6
作者
李志玲
项勋
+3 位作者
刘清琦
段纲
常华
杨林富
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2021年第12期73-77,共5页
云南香格里拉亚高草地植物大狼毒根部化学成分丰富,为进一步探究其抑菌活性和急性毒性作用,本试验检验了大狼毒根部95%乙醇提取物萃取相抑制金黄色葡萄球菌和猪霍乱沙门菌的作用,同时采用寇氏法测定其根部乙酸乙酯萃取物的半数致死量(LD...
云南香格里拉亚高草地植物大狼毒根部化学成分丰富,为进一步探究其抑菌活性和急性毒性作用,本试验检验了大狼毒根部95%乙醇提取物萃取相抑制金黄色葡萄球菌和猪霍乱沙门菌的作用,同时采用寇氏法测定其根部乙酸乙酯萃取物的半数致死量(LD_(50)),连续观察14 d小鼠中毒反应,剖检死亡小鼠,大体观察脏器病理变化。结果显示,大狼毒根部乙酸乙酯萃取物具有良好的抑菌效果,对2种细菌的最小抑菌浓度分别为1.25 mg/mL和2.5 mg/mL;其LD_(50)为4229.607 mg/(kg·bw),死亡小鼠胃肠严重鼓气,肝脏浊肿,肝细胞发生空泡变性。由此可见,大戟属大狼毒根部乙酸乙酯萃取物具有明显的抑制金黄色葡萄球菌和猪霍乱沙门菌的作用,但超量口服该药液可导致小鼠毒性反应、肝脏病变甚至死亡。本试验结果为进一步探索大狼毒药理活性和毒性作用提供初步的试验依据。
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关键词
大狼毒
抑菌活性
急性毒性作用
空泡变性
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职称材料
瘤体注药加放疗治疗食管癌的临床研究
7
作者
白林
刘清琦
《河南肿瘤学杂志》
1998年第4期305-306,共2页
关键词
食管癌
瘤体注药
治疗
放射疗法
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职称材料
多发多源性肿瘤1例
8
作者
付建华
刘清琦
《黔南民族医专学报》
2001年第1期51-51,共1页
患男,50岁,于1972年7月偶然发现右乳突处有一肿块,无疼痛、发热.查体:肿块大小约2cm×1cm,质硬,活动度大,无压痛.当时按"淋巴结炎"给予抗感染治疗及红外线理疗,肿块仍缓慢增长.于1974年7月行肿块切除术,病理示:腺样囊性癌...
患男,50岁,于1972年7月偶然发现右乳突处有一肿块,无疼痛、发热.查体:肿块大小约2cm×1cm,质硬,活动度大,无压痛.当时按"淋巴结炎"给予抗感染治疗及红外线理疗,肿块仍缓慢增长.于1974年7月行肿块切除术,病理示:腺样囊性癌(圆柱癌),低度恶性,来源于腮腺.1974年7月,行右腮腺切除加颈扩术,病理示:腺样囊性癌.
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关键词
多发多源性肿瘤
支气管肺泡细胞癌
甲状腺腺瘤
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职称材料
磁刺激运动诱发电位在神经系统疾病中的应用
9
作者
李松
刘清琦
周培勇
《菏泽医学专科学校学报》
2000年第2期86-88,共3页
关键词
诱发电位
神经系统疾病/论断
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职称材料
题名
红嘴鸥TLR7基因克隆与生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
常华
段纲
阮谦
罗倩敏
余琬玲
刘清琦
黄翠琴
项勋
机构
云南农业大学
龙岩学院福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第1期43-52,共10页
基金
云南省基础研究面上项目(202001AT070119)
云南省农业基础研究联合专项面上项目(2018FG001-043)
+2 种基金
云南农业大学兽医公共卫生省创新团队(202105AE160014)
云南省乡村振兴科技专项——云南省石林县奶山羊产业科技特派团(202104BI090017)
“福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室”开放基金课题项目(2018KF01)。
文摘
【目的】克隆野生鸟类红嘴鸥Toll样受体7(TLR7)基因,并对其编码蛋白进行生物信息学分析,为后期TLR7蛋白的抗病毒活性研究做准备。【方法】采用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)扩增红嘴鸥TLR7基因全序列,通过生物信息学软件分析TLR7基因序列、稀有密码子、相似性及其编码蛋白的理化性质、跨膜区域、信号肽、N-糖基化位点、磷酸化位点和亚细胞定位,分别利用SOPMA和SWISS-MODEL软件预测TLR7蛋白的二级结构和三级结构。【结果】试验成功克隆红嘴鸥TLR7基因(GenBank登录号:MZ668652),全长1720 bp,开放阅读框(ORF)大小为1182 bp,存在39个稀有密码子,其中含8个连续稀有密码子,编码393个氨基酸;红嘴鸥TLR7基因与GenBank中原鸡、红腹角雉、鹌鹑、绿头鸭、黑天鹅、山雀、白鹭、帝企鹅、红喉潜鸟和巴布亚企鹅的TLR7基因相似性分别为85.7%、84.9%、85.4%、87.0%、87.8%、86.8%、91.0%、93.1%、93.1%和93.1%。系统进化树结果显示,其与白鹭的亲缘关系最近。TLR7蛋白分子式为C_(2080)H_(3256)N_(556)O_(567)S_(19),分子质量约为63 ku,理论等电点为9.25;该蛋白不存在跨膜结构和信号肽,含有6个N-糖基化位点和33个磷酸化位点,是疏水性蛋白,主要存在于细胞质中;TLR7蛋白二级结构主要以α-螺旋为主,约占48.09%,其次为无规则卷曲(32.06%)、延伸链(13.23%)和β-转角(6.62%),TLR7蛋白的三级结构与二级结构一致,且与模型蛋白人TLR7蛋白相似性为68.78%。【结论】红嘴鸥TLR7基因与白鹭进化关系较近,含有8个连续稀有密码子,体外表达较难,研究为进一步探索红嘴鸥TLR7蛋白抗病毒免疫机制提供重要参考。
关键词
红嘴鸥
Toll样受体7(TLR7)
克隆
生物信息学分析
Keywords
Larus ridibundus
Toll-like receptor 7(TLR7)
cloning
bioinformatics analysis
分类号
S858.99 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
经皮穿刺置管引流治疗乳房脓肿40例
被引量:
2
2
作者
刘清琦
刘丹
付建华
李柱明
机构
山东省曹县人民医院外科
出处
《黔南民族医专学报》
2001年第3期144-144,共1页
文摘
为提高乳房脓肿的治愈率,我院于1995年1月~1999年12月采用经皮穿刺置管引流治疗乳房脓肿40例,收到较满意的效果,现分析如下.
关键词
乳房脓肿
穿刺术
引流
分类号
R655.8 [医药卫生—外科学]
下载PDF
职称材料
题名
双管闭式引流治疗自发性气胸16例
3
作者
刘清琦
付建华
刘丹
机构
曹县人民医院
出处
《山东医药》
CAS
北大核心
2001年第21期32-32,共1页
关键词
自发性气胸
闭式引流
治疗
分类号
R561.4 [医药卫生—呼吸系统]
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职称材料
题名
急性十二指肠溃疡穿孔修补后缝线对溃疡愈合的影响
4
作者
刘清琦
付建华
李柱明
机构
山东省曹县人民医院
出处
《腹部外科》
2001年第3期179-179,共1页
关键词
急性十二指肠溃疡
穿孔
修补
缝线
溃疡愈合
分类号
R656.62 [医药卫生—外科学]
下载PDF
职称材料
题名
急性坏死性筋膜炎8例诊治体会
被引量:
1
5
作者
李柱明
刘清琦
机构
山东省曹县人民医院外科
出处
《黔南民族医专学报》
2001年第2期82-82,共1页
文摘
急性坏死性筋膜炎系较少见的严重外科感染,主要侵犯皮下脂肪和筋膜,造成广泛脂肪液化和筋膜坏死,产生严重全身中毒症状,病死率可达30%~50%.我科自1978~1999年共收治8例该病患者,现报道如下.
关键词
坏死性筋膜炎
厌氧菌
切口引流
诊断
分类号
R686.3 [医药卫生—骨科学]
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职称材料
题名
大狼毒根部乙酸乙酯萃取物抑菌活性及急性毒性作用
6
作者
李志玲
项勋
刘清琦
段纲
常华
杨林富
机构
云南农业大学动物医学院
出处
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2021年第12期73-77,共5页
基金
国家重点研发计划专项(2017YFD0501405)
云南农业大学学生科技创新创业行动基金项目(2019ZKY059)。
文摘
云南香格里拉亚高草地植物大狼毒根部化学成分丰富,为进一步探究其抑菌活性和急性毒性作用,本试验检验了大狼毒根部95%乙醇提取物萃取相抑制金黄色葡萄球菌和猪霍乱沙门菌的作用,同时采用寇氏法测定其根部乙酸乙酯萃取物的半数致死量(LD_(50)),连续观察14 d小鼠中毒反应,剖检死亡小鼠,大体观察脏器病理变化。结果显示,大狼毒根部乙酸乙酯萃取物具有良好的抑菌效果,对2种细菌的最小抑菌浓度分别为1.25 mg/mL和2.5 mg/mL;其LD_(50)为4229.607 mg/(kg·bw),死亡小鼠胃肠严重鼓气,肝脏浊肿,肝细胞发生空泡变性。由此可见,大戟属大狼毒根部乙酸乙酯萃取物具有明显的抑制金黄色葡萄球菌和猪霍乱沙门菌的作用,但超量口服该药液可导致小鼠毒性反应、肝脏病变甚至死亡。本试验结果为进一步探索大狼毒药理活性和毒性作用提供初步的试验依据。
关键词
大狼毒
抑菌活性
急性毒性作用
空泡变性
Keywords
Euphorbia jolkinii Boiss.
antibacterial activity
acute toxicity
vacuolar degeneration
分类号
S853.72 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
瘤体注药加放疗治疗食管癌的临床研究
7
作者
白林
刘清琦
机构
山东省曹县人民医院
出处
《河南肿瘤学杂志》
1998年第4期305-306,共2页
关键词
食管癌
瘤体注药
治疗
放射疗法
分类号
R735.105 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
多发多源性肿瘤1例
8
作者
付建华
刘清琦
机构
山东省曹县人民医院
出处
《黔南民族医专学报》
2001年第1期51-51,共1页
文摘
患男,50岁,于1972年7月偶然发现右乳突处有一肿块,无疼痛、发热.查体:肿块大小约2cm×1cm,质硬,活动度大,无压痛.当时按"淋巴结炎"给予抗感染治疗及红外线理疗,肿块仍缓慢增长.于1974年7月行肿块切除术,病理示:腺样囊性癌(圆柱癌),低度恶性,来源于腮腺.1974年7月,行右腮腺切除加颈扩术,病理示:腺样囊性癌.
关键词
多发多源性肿瘤
支气管肺泡细胞癌
甲状腺腺瘤
分类号
R734.1 [医药卫生—肿瘤]
R736.1 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
磁刺激运动诱发电位在神经系统疾病中的应用
9
作者
李松
刘清琦
周培勇
机构
曹县人民医院
出处
《菏泽医学专科学校学报》
2000年第2期86-88,共3页
关键词
诱发电位
神经系统疾病/论断
分类号
R741.041 [医药卫生—神经病学与精神病学]
R741.044 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
红嘴鸥TLR7基因克隆与生物信息学分析
常华
段纲
阮谦
罗倩敏
余琬玲
刘清琦
黄翠琴
项勋
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022
2
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职称材料
2
经皮穿刺置管引流治疗乳房脓肿40例
刘清琦
刘丹
付建华
李柱明
《黔南民族医专学报》
2001
2
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职称材料
3
双管闭式引流治疗自发性气胸16例
刘清琦
付建华
刘丹
《山东医药》
CAS
北大核心
2001
0
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职称材料
4
急性十二指肠溃疡穿孔修补后缝线对溃疡愈合的影响
刘清琦
付建华
李柱明
《腹部外科》
2001
0
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职称材料
5
急性坏死性筋膜炎8例诊治体会
李柱明
刘清琦
《黔南民族医专学报》
2001
1
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职称材料
6
大狼毒根部乙酸乙酯萃取物抑菌活性及急性毒性作用
李志玲
项勋
刘清琦
段纲
常华
杨林富
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2021
0
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职称材料
7
瘤体注药加放疗治疗食管癌的临床研究
白林
刘清琦
《河南肿瘤学杂志》
1998
0
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职称材料
8
多发多源性肿瘤1例
付建华
刘清琦
《黔南民族医专学报》
2001
0
下载PDF
职称材料
9
磁刺激运动诱发电位在神经系统疾病中的应用
李松
刘清琦
周培勇
《菏泽医学专科学校学报》
2000
0
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职称材料
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