基于生物信息学的hsa-miR-155-5p通过PTEN调控中央记忆T细胞/辅助T细胞对肝细胞癌免疫微环境的影响研究

目的运用生物信息学方法预测人类miR-155-5p靶基因,进一步探索其在肝细胞癌(HCC)中的功能。方法通过starBase数据库筛选出hsa-miR-155-5p靶基因,DAVID和Reactome数据库进行功能富集分析。蛋白-蛋白相互作用网络分析靶基因之间的相互关系,cytohubba插件获得关键基因。Kaplan-Meier生存分析进一步筛选关键基因,ssGSEA算法分析HCC免疫浸润情况,Spearman相关系数分析关键基因与免疫浸润的相关性。结果共筛选出1493个hsa-miR-155-5p靶基因;靶基因GO富集分析集中于调控转录、蛋白质分解代谢过程、细胞周期的调节;KEGG生物通路主要富集于AMPK信号通路、PI3K-Akt信号通路和FoxO信号通路、以及子宫内膜癌、胰腺癌和肝细胞癌等疾病通路。利用蛋白互作网络共获得30个关键基因,与HCC信号通路基因取交集获得GSK3B、PTEN、PIK3R1、EGFR、CCND1、SMAD2、PIK3CA、RPS6KB1、KRAS、SOS1等10个关键基因。生存分析显示,PTEN高表达的HCC患者的预后优于低表达患者。PTEN表达量与中央记忆T细胞、辅助T细胞的免疫浸润均呈现较强的正相关性。结论hsa-miR-155-5p通过下游靶基因PTEN调控中央记忆T细胞、辅助T细胞,进而影响HCC免疫浸润微环境,或可为HCC发生机制和临床治疗的探索提供帮助。