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四川省德阳市埃柯病毒6型的基因特征分析
被引量:
1
1
作者
何杨
伍剑
+4 位作者
代泽伟
杨成林
刘泉
刘灵韵
童文彬
《预防医学情报杂志》
CAS
2015年第12期993-996,共4页
目的了解四川省德阳市埃柯病毒6型(echovirus 6,E6)的基因特征。方法对2013年德阳市手足口病咽拭子标本的病毒分离阳性株进行核苷酸测序,获取的E6毒株序列与世界各地的E6参考株序列构建进化树并分析基因特征。结果4株E6分离株中,3株VP1...
目的了解四川省德阳市埃柯病毒6型(echovirus 6,E6)的基因特征。方法对2013年德阳市手足口病咽拭子标本的病毒分离阳性株进行核苷酸测序,获取的E6毒株序列与世界各地的E6参考株序列构建进化树并分析基因特征。结果4株E6分离株中,3株VP1区核苷酸序列一致,与另1株仅有1个核苷酸差异。同E6原型株(D'Amori)比较,核苷酸一致性≥77.0%。进化树分析显示,德阳市E6分离株为C2基因亚型,与部分山东分离株聚集在同一进化分支上。结论德阳市E6为C2基因亚型。其中3份标本来自同一地区的不同月份,提示E6在此地持续传播。
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关键词
埃柯病毒6型
核苷酸测序
基因特征
原文传递
题名
四川省德阳市埃柯病毒6型的基因特征分析
被引量:
1
1
作者
何杨
伍剑
代泽伟
杨成林
刘泉
刘灵韵
童文彬
机构
德阳市疾病预防控制中心
四川省疾病预防控制中心
出处
《预防医学情报杂志》
CAS
2015年第12期993-996,共4页
文摘
目的了解四川省德阳市埃柯病毒6型(echovirus 6,E6)的基因特征。方法对2013年德阳市手足口病咽拭子标本的病毒分离阳性株进行核苷酸测序,获取的E6毒株序列与世界各地的E6参考株序列构建进化树并分析基因特征。结果4株E6分离株中,3株VP1区核苷酸序列一致,与另1株仅有1个核苷酸差异。同E6原型株(D'Amori)比较,核苷酸一致性≥77.0%。进化树分析显示,德阳市E6分离株为C2基因亚型,与部分山东分离株聚集在同一进化分支上。结论德阳市E6为C2基因亚型。其中3份标本来自同一地区的不同月份,提示E6在此地持续传播。
关键词
埃柯病毒6型
核苷酸测序
基因特征
Keywords
echovirus 6
nucleotide sequencing
genetic characterization
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
四川省德阳市埃柯病毒6型的基因特征分析
何杨
伍剑
代泽伟
杨成林
刘泉
刘灵韵
童文彬
《预防医学情报杂志》
CAS
2015
1
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