生物洁净室的设计特点

指出应根据生物洁净室的主要控制对象选择合适的过滤器，论述了在工艺布局上和净化空调系统设计中防止交叉污染的具体措施，介绍了值班系统和消毒灭菌系统的设计。

生物疫苗工程的设计特点

本文针对生物疫苗工程具有较强生物活性微粒的这一特性,集中阐述了疫苗工程的设计特点,再针对各特点依次进行分析论述,强调疫苗工程防止交叉污染的重要性和提出了防止交叉污染的具体措施,并强调了房间压力的严格控制、消毒系统设计及活毒废水处理的必要性。

生物洁净室的设计特点

从微粒的去除机理、值班系统设计、消毒灭菌系统设计着手介绍生物洁净室的设计特点，阐明简述各行业生物洁净空的设计要求，强调生物洁净空防止交叉污染的重要性。

工程上如何正确选用玻璃钢

介绍玻璃钢的组成、分类及其特性，分析不同介质对玻璃钢的腐蚀性，阐述工程上选用玻璃钢的注意事项。强调玻璃钢的耐腐蚀性是有限的，并不是万能的。

云南省2022年3株H5N6禽流感病毒的分离鉴定及其血凝素和神经氨酸酶基因特征分析

目的对活禽市场环境中检出的3份H5N6亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)标本进行测序鉴定和基因特征分析,为预防人感染H5N6亚型AIV提供依据。方法通过实时荧光定量PCR确定病毒型别,采用二代测序方法对病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因序列进行测序。使用NCBI中BLAST模块进行比对,用Mega7.0软件构建进化树并进行基因特征分析。结果3份H5亚型阳性标本经测序鉴定为H5N6亚型AIV,属于Clade2.3.4.4支系。病毒的HA蛋白存在6个连续碱性氨基酸(LRERRRKRGL,其中R,K为碱性氨基酸);病毒HA蛋白的受体结合位点238~240位氨基酸是QRG(氨基酸排序以H3-HA为准),受体特征为禽源;NA蛋白第69~73位点氨基酸未出现茎缺失。结论环境中3份H5亚型AIV核酸阳性病毒鉴定为新型H5N6亚型AIV,属于高致病AIV,但具有不容易感染人的受体结合特征。活禽市场中持续存在H5N6病毒,对人类健康和公共卫生存在威胁,需要继续加强监测。

3例境外新冠病毒感染者的病毒全基因组测序分析

目的了解境外新冠病毒全基因组特征和变异情况,及时发现境外流行新冠病毒变异类型,为云南省边境州市制定针对性的防控策略提供科学依据。方法2021年11月,采集与云南省瑞丽市接壤的缅甸3例新冠病毒感染者的鼻咽拭子样本,提取核酸进行病毒全基因组测序,以新冠病毒武汉株Wuhan-Hu-1(NC_045512)为参考序列进行比对分析。结果成功从3份样本中获得长度为29881 bp、29852 bp、29875 bp的新冠病毒全基因组序列,基因组覆盖度为99.90%、99.87%、99.99%,分别检出39个、40个、45个碱基位点突变,涉及28个、26个、28个氨基酸变异,非同义突变占66.1%(82/124),以ORF1ab基因占比最高,达37.8%(31/82)。序列比对显示3个境外感染者的病毒序列与云南同一时间监测的病毒基因组序列高度同源,系统发育树显示3个境外感染者和瑞丽本土疫情病例聚成一簇。结论3个境外新冠病毒感染者的病毒均属Delta变异株(B.1.617.2进化分支),未监测到其他类型变异毒株。瑞丽市本土疫情的持续传播可能与边境人员和缅甸病例直接或者间接接触有关。

奥密克戎BA.2引起的12起云南省边境地区本土疫情首例病例新冠病毒基因特征分析

目的了解云南省边境地区新型冠状病毒肺炎本土疫情特征, 分析感染的新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)基因组变异情况并进行溯源。方法收集2022年2月中旬至4月期间云南省边境地区12起本土疫情首例病例基本信息及标本, 应用全基因组测序技术进行病毒基因序列测定, 通过在线分析平台和软件, 判断病毒型别, 分析病毒突变情况, 结合流调内容, 推测疫情病毒感染来源。结果 12起云南省边境地区本土疫情首例病例职业较多样, 且活动区域均未离开过当地。Pangolin分型结果显示12起疫情SARS-CoV-2基因组均属Omicron (BA.2)变异株, 其中各2起疫情SARS-CoV-2基因组进一步分属BA.2.10和BA.2.3.2进化分支。全基因组核苷酸突变分析表明, 有十起疫情首例病例病毒基因序列存在1个及以上数目的特有核苷酸突变位点, 结合流行病学调查内容, 提示12起疫情可能均存在不同的病毒感染来源。进一步分析氨基酸突变发现, 病例间基因序列除具备进化分支代表性突变位点外, 还具有特有的氨基酸突变位点(如S:E1188D), 其影响同样值得关注。序列系统发育树分析结果与Pangolin分型及突变分析结果相吻合。结论 12起云南本土疫情可能存在各自不同的病毒感染来源, 这提示云南省边境地区疫情极具复杂性和挑战性。加强重点人群范围及核酸筛查频次, 跟踪监测病毒变异规律, 对疫情精准防控具有重要指导意义。

2022年9月云南省镇康县一起新型冠状病毒 感染疫情溯源分析

目的调查2022年9月云南省镇康县新型冠状病毒感染本土疫情的感染来源和病毒变异情况。方法 收集疫情期间采集的9例本土病例和3例境外病例的标本进行新型冠状病毒(SARS-CoV-2)全基因组测序。通过基因组学分析,结合流行病学调查内容,明确病毒基因组变异情况及感染来源。结果来自9例本土病例的病毒株属Omicron变异株BA.5.2和BA.5.2.20进化分支,形成独立的两条传播链,均与境外病例病毒株基因组序列高度同源。结合流行病学调查,提示可能与直接或间接接触境外病毒感染病例有关。BA.5.2和BA.5.20基因型毒株基因组序列共享53个氨基酸错义突变和11个氨基酸缺失突变,各自具备其代表性氨基酸突变位点。在S蛋白上均发现HV69~70del、L452R、T478K、R493Q回复突变、F486V等可能影响病毒传播力和免疫逃逸能力的关键性变异位点。同时研究发现,S:K147T、S:M1237V、ORF1a:M85del等其他特征性突变位点,其功能作用值得进一步研究。结论本次疫情有2个境外病毒感染源,提示云南省边境地区疫情的复杂性和长期性。因此,边境地区仍要提高监测预警敏感性,不断有方向性地追踪病毒变异动态,以期提高SARS-CoV-2感染防控工作的科学性和精准性。

云南省境外输入新冠病毒感染者中呼吸道病原体混合检出情况分析

目的了解云南省境外输入新冠病毒感染者中新型冠状病毒与常见呼吸道病原体的混合检出情况,为新冠疫情中多重感染的治疗和应对提供科学依据。方法随机选取采样日期从2021年4月18日至2022年4月24日的云南省境外输入新冠病毒感染者标本74份,使用呼吸道病原体微流体芯片技术(TaqMan array cards,TAC)对41种常见的呼吸道病原体进行筛查。结果56份检出一种或多种呼吸道病原体,其中流感嗜血杆菌检出率最高,不同病原体间的阳性率差异具有统计学意义(χ^(2)=235.790,P<0.05)。EB病毒(χ^(2)=6.358,P=0.038)和人疱疹病毒6型(χ^(2)=5.044,P=0.049)在不同的疾病严重程度分组中检出率差异有统计学意义。肠道病毒(χ^(2)=7.843,P=0.041)在不同的年龄分组中检出率差异有统计学意义。结论在本研究中,75.68%(56/74)的新冠病毒感染者检测到一种或多种呼吸道病原体,较高的检出率可能归因于年龄组、疾病严重程度、检测方法以及时空差异。

云南省2019年人感染H9N2禽流感病毒血凝素和神经氨酸酶基因序列分析

目的 了解云南省2019年人感染H9N2禽流感病毒(avian influenza virus, AIV)分子特征,为云南省人禽流感防控提供科学依据。方法 通过实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(real-time reverse transcription polymerase chain reaction, real-time RT-PCR)方法对2例流感样病例标本进行流感病毒分型检测,应用Illumina Miseq高通量测序仪进行病毒基因组序列测定,使用Mega7.0软件进行血凝素(hemagglutinin, HA)和神经氨酸酶(neuraminidase, NA)基因序列比对和进化树构建。结果 Real-time RT-PCR检测结果显示2例流感样病例标本为H9N2亚型阳性,通过基因组序列测定,获得2份标本的HA和NA全长。序列系统进化分析表明2株AIV HA和NA均与A/Chicken/Zhejiang/HJ/2007在同一进化分支中,属于G57型。2株AIV HA核苷酸和氨基酸同源性分别为93.92%和95.00%,NA核苷酸和氨基酸同源性分别为93.31%和82.03%,与2015—2020年国内获得的人感染H9N2流行株的HA核苷酸(氨基酸)同源性分别为92.29%~96.94%(93.77%~98.43%)、92.84%~94.92%(94.18%~96.23%),NA核苷酸(氨基酸)同源性分别为91.81%~97.60%(77.82%~94.83%)、94.38%~97.22%(85.47%~94.55%)。2株AIV HA蛋白裂解位点序均为PSRSSR↓GLF,符合低致病性禽流感的特征,HA蛋白受体结合位点分析显示,109、161、163、191、202、203、234位氨基酸与参考株保持一致,而198位氨基酸突变为T。HA蛋白上还发现N166D和168N突变,两株AIV均具有7个潜在糖基化位点。NA基因红细胞结合位点分析发现369、402、403、432处存在氨基酸变异,NA基因均表现为63~65位氨基酸缺失,2株AIV分别存在4个和5个潜在糖基化位点,未发现耐药位点突变。结论 云南省H9N2 AIV的HA和NA基因上受体结合位点、红细胞结合位点和糖基化位点都有不同程度的变异,应加强监测与防控。

云南省一株柯萨奇病毒B组5型分离株的全基因组解析

目的对云南省2022年一例流感样病例的咽拭子分离得到的柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CVB5)病毒株进行全基因组测序,并分析其遗传进化、基因突变和重组特征。方法通过人宫颈癌细胞培养获得病毒分离株,应用全基因组测序技术对分离株进行病毒基因序列测定,采用MEGA、RDP4及SimPlot软件,解析病毒基因组学特征。结果分离株YN-01/CHN/2022与2株广东CVB5流行株核苷酸同源性为96.6%,属GⅠ.C1分支,与国内大多其他CVB5流行株相似度低(≤90.3%),揭示国内CVB5流行株间基因组差异较大。该分离株VP1序列存在2个特有的氨基酸突变(T246A和T275A),但其95位氨基酸未发生改变。基因重组分析显示YN-01/CHN/2022可能为重组株,重组位点发生在P1区VP4(940)和P2区2A(3540)。结论本研究分离株YN-01/CHN/2022属于CVB5 GⅠ.C1基因型,存在特异的核苷酸分歧,也证实了CVB5基因组有重组现象发生。该数据提示增强CVB5分子流行病学研究工作,持续追踪病毒进化规律,不断提高相关疾病防控工作的精准性。

旧式涝池的改造与利用

涝池,即“水塘”。我国西北黄土高塬地区的一种蓄水没施,多开挖在路边村旁,用以拦蓄地面迳流,防止土壤冲刷,涝池中的存水可供畜用、洗涤,富余者还可灌溉农田。涝池起源于何时?笔者无从考究,但肯定地说,相当长时间以来,人们就利用这种设施改造自然,满足需求。特别是在旱塬地区,涝池默默无闻地起着造福于人民的作用。

云南省陇川县本土新冠疫情溯源和病毒基因组变异解析

2021年7月14日,云南省陇川县报告了新型冠状病毒肺炎(COVID-19)本土疫情。为了阐明本次德宏州陇川县本土疫情的感染来源和SARS-CoV-2变异情况,我们收集疫情期间采集的9例陇川疫情本土病例和2例陇川境外病例标本进行新冠病毒全基因组测序。通过一系列比较基因组学分析,发现9例陇川疫情本土病例和2例陇川境外病例病毒株基因组序列高度同源,均属Delta变异株(B.1.617.2进化分支),在系统发育树上单独成簇,为同一传播链。9例陇川疫情本土病例和2例境外病例病毒株基因组序列共享38个SNP突变位点和13个缺失。9例本土病例中的4例病毒株均额外增加了1个共享的SNP突变位点,其中2例本土病例病毒株新产生9个核苷酸缺失。这些病毒株S蛋白均发现L452R、T478K、P681R等可能影响病毒传播和免疫逃逸能力的关键性变异位点。该研究表明本次陇川疫情的暴发与发病前14天内德宏州陆路口岸输入病例以及瑞丽2021年7月14日疫情本土病例并无关联性,提示病毒传染源可能来自境外人员。因此,应持续加强边境从业人员和抵边村寨边民的病毒核酸检测以及本土/输入病例基因组变异规律的深入挖掘和监测。