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hsa-miR-340-5p靶基因预测及生物信息学分析
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作者 刘清华 陶秀丽 +3 位作者 尹崇高 李洪利 刘雨清 张宝刚 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2023年第8期1880-1884,共5页
目的 通过对hsa-miR-340-5p的靶基因进行预测和生物信息学分析,探讨其靶基因所发挥的生物学功能及参与的信号传导通路。方法 应用RNAcentral和miRBase数据库在线对比分析miR-340-5p序列在不同物种之间的保守性。运用在线数据库DIANA-mic... 目的 通过对hsa-miR-340-5p的靶基因进行预测和生物信息学分析,探讨其靶基因所发挥的生物学功能及参与的信号传导通路。方法 应用RNAcentral和miRBase数据库在线对比分析miR-340-5p序列在不同物种之间的保守性。运用在线数据库DIANA-microT、Target Scan、miRWalk和miRDB分别预测hsa-miR-340-5p的靶基因,随后使用Venny2.1绘制韦恩图得到交集靶基因的集合,并对其交集靶基因的集合进行基因本体论(GO)功能注释分析、京都基因与基因组百科全书信号通路(KEGG Pathway)富集分析、蛋白互作(PPI)网络构建及关键(hub)基因筛选。结果 通过对比序列分析发现,miR-340-5p的成熟碱基序列在8个不同的物种中高度保守。采用4个miRNA靶基因在线数据库预测后,发现与hsa-miR-340-5p存在结合位点的交集靶基因集合共有92个,占其预测靶基因总和的1.9%。GO功能注释分析发现,hsa-miR-340-5p交集靶基因集合主要富集在核质、黏着斑、细胞间连接等细胞组分,同时,还参与了RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录和蛋白质结合等多种生物学过程和分子功能。KEGG Pathway富集分析发现,hsa-miR-340-5p所结合的交集靶基因集合主要富集在癌症中的蛋白多糖、癌症通路、人类嗜T细胞病毒Ⅰ型(HTLV-I)感染等7个信号通路中。基于hsa-miR-340-5p交集靶基因集合的PPI网络构建,筛选出了度(degree)值前10位的hub基因,分别是:母体抗生物皮肤生长因子同源物(SMAD)2、无翅型MMTV整合位点家族成员(WNT)3、激活素A的1C型受体(ACVR1C)、F-框蛋白(FBXO)30、重组人缺陷于清选蛋白neddylation蛋白1域含1(DCUN1D1)、PH结构域相互作用蛋白(PHIP)、CUB和Sushi多结构域(CSMD)3、分拣连接蛋白(SNX)9、人免疫缺陷病毒Ⅰ增强子结合蛋白(HIVEP)2、RWD结构域蛋白(RWDD)2A。结论 hsa-miR-340-5p调控的靶基因参与了癌症、炎症等疾病的多种生物学过程。 展开更多
关键词 hsa-miR-340-5p 靶基因 生物信息学
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高糖血症、高胰岛素血症对血管内皮细胞的影响 被引量:20
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作者 刘雨清 张伟栋 +1 位作者 吴洪娟 段文卓 《中国糖尿病杂志》 CAS CSCD 2000年第6期351-351,共1页
关键词 高糖血症 高胰岛素血症 血管内皮细胞 糖尿病 并发症
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肿瘤坏死因子在人膜增生性肾小球肾炎中的表达 被引量:9
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作者 刘雨清 张伟栋 +3 位作者 郭爱华 吴洪娟 吕世军 刘海涛 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 2002年第6期20-21,23,共3页
目的 :探讨肿瘤坏死因子 (TNF -α)在人膜增生性肾小球肾炎发病中的作用。方法 :采用病理组织学及免疫组织化学SABC法对 2 0例人膜增生性肾小球肾炎进行染色观察。结果 :TNF -α蛋白在肾组织内表达增加 ,阳性反应见于肾小管上皮细胞和... 目的 :探讨肿瘤坏死因子 (TNF -α)在人膜增生性肾小球肾炎发病中的作用。方法 :采用病理组织学及免疫组织化学SABC法对 2 0例人膜增生性肾小球肾炎进行染色观察。结果 :TNF -α蛋白在肾组织内表达增加 ,阳性反应见于肾小管上皮细胞和肾小球内 ,以肾近曲小管上皮细胞阳性最明显 ,与正常组相比有显著性差异 (P <0 .0 1) ,肾小球内呈程度不等的弱阳性 ,但与正常组相比无显著性差异 (P >0 .0 5 ) ,远曲小管阳性反应不明显。结论 :TNF 展开更多
关键词 膜增生性肾小球肾炎 TNF-Α 免疫组织化学 病理组织学 肾脏纤维化
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一种新的帕金森病动物模型 被引量:8
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作者 刘雨清 张伟栋 李媛媛 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2007年第2期159-160,共2页
关键词 动物模型 帕金森病 神经疾病 发病机制 多发病 世界性 常见病 进行性
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高糖、高脂血症时血管内皮细胞的变化 被引量:4
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作者 刘雨清 张伟栋 +2 位作者 段文卓 吴洪娟 管英俊 《解剖科学进展》 CAS 2001年第2期126-128,共3页
目的 :观察高糖血症及高脂血症时大鼠胸主动脉内皮细胞的形态学变化 ,探讨其变化发生的机理。方法 :复制高糖、高脂血症动物模型 ,光镜及电镜下观察胸主动脉内皮细胞的变化特点。结果 :①高糖血症 :光镜下见胸主动脉内皮细胞肿胀、肥胖 ... 目的 :观察高糖血症及高脂血症时大鼠胸主动脉内皮细胞的形态学变化 ,探讨其变化发生的机理。方法 :复制高糖、高脂血症动物模型 ,光镜及电镜下观察胸主动脉内皮细胞的变化特点。结果 :①高糖血症 :光镜下见胸主动脉内皮细胞肿胀、肥胖 ,个别内皮细胞突向腔面。电镜下内皮细胞表面有破损 ,并见血浆蛋白附着物 ;细胞浆内有明显的糖原颗粒 ,细胞核周池增宽。②高脂血症 :光镜下见内皮细胞肿胀、肥胀 ,个别是细胞向腔面呈出芽状生长。电镜下内皮细胞表面有指状突起 ,胞浆内见较大的吞饮泡 ,平滑肌细胞有向内膜下迁移的倾向。结论 :高糖及高脂血症时血管内皮细胞发生了一定的变化 。 展开更多
关键词 高糖血症 高脂血症 血管内皮细胞 糖尿病 血管并发症
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乳腺癌中COX-2表达及其抑制剂塞来昔布对乳腺癌细胞系增生和凋亡的影响 被引量:3
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作者 刘雨清 李媛媛 李文通 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期643-646,661,共5页
目的为进一步观察COX-2对乳腺癌的作用,我们检测了乳腺癌组织、乳腺癌细胞株MCF-7和B37中COX-2的表达,并观察选择性COX-2抑制剂塞来昔布对乳腺癌细胞株生长和凋亡的影响。方法应用免疫组织化学染色的方法检测132例乳腺癌组织标本中COX-... 目的为进一步观察COX-2对乳腺癌的作用,我们检测了乳腺癌组织、乳腺癌细胞株MCF-7和B37中COX-2的表达,并观察选择性COX-2抑制剂塞来昔布对乳腺癌细胞株生长和凋亡的影响。方法应用免疫组织化学染色的方法检测132例乳腺癌组织标本中COX-2蛋白的表达;应用免疫细胞化学染色、原位杂交、逆转录多聚酶联反应(RT-PCR)的方法,分别检测COX-2蛋白和mRNA在乳腺癌细胞株MCF-7、B37中的表达;采用MTT法、AO/EB双荧光染色法和流式细胞术,研究塞来昔布对乳腺癌细胞增殖和凋亡的影响。结果52.3%(69/132)的乳腺癌组织标本表达COX-2蛋白;在乳腺癌细胞株MCF-7和B37中均有COX-2的表达,25μmol/L塞来昔布作用72h后,COX-2表达明显减少;25、50、100μmol/L的塞来昔布与MCF-7细胞作用72h,生长抑制率分别为36.3%、57.7%、74.5%。100μmol/L塞来昔布作用72h后,MCF-7细胞凋亡率为38.5%。结论乳腺癌组织和乳腺癌细胞株MCF-7、B37中存在COX-2的表达;塞来昔布可抑制乳腺癌细胞增殖,并促进细胞凋亡,塞来昔布可能作为新的药物治疗乳腺癌。 展开更多
关键词 乳腺癌 环氧合酶-2 塞来昔布
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氟化物致突变及致癌性的研究进展 被引量:4
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作者 刘雨清 张乃鑫 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期395-396,共2页
关键词 氟化物 致突变性 致癌性 肿瘤
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实验性肝癌糖原和癌基因N-ras表达的研究 被引量:1
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作者 刘雨清 郑杰 +2 位作者 杨木兰 刘冰 武忠弼 《中国组织化学与细胞化学杂志》 CAS CSCD 1997年第3期99-103,共5页
通过应用原位杂交和组织化学技术,对二乙基亚硝胺诱发的大鼠肝细胞肝癌中糖原和癌基因N-ras表达的研究,发现从诱癌早期到晚期,肝细胞内的糖原由储积而逐渐丧失。N-ras在诱癌的第1~2周即出现阳性表达,随诱癌过程的延长... 通过应用原位杂交和组织化学技术,对二乙基亚硝胺诱发的大鼠肝细胞肝癌中糖原和癌基因N-ras表达的研究,发现从诱癌早期到晚期,肝细胞内的糖原由储积而逐渐丧失。N-ras在诱癌的第1~2周即出现阳性表达,随诱癌过程的延长,阳性表达的细胞数和范围逐渐增加,至诱癌晚期甚至在癌结节内均转为阴性。对肝组织连续切片中糖原和N-ras表达的对比观察发现,糖原PAS反应与N-ras反应同步,糖原PAS反应具有与N-ras一致的异质性,其阳性与阴性病变分布与N-ras表达重叠。提示N-ras基因表达可能在肝癌的启动过程中发挥重要作用,并且可能涉及对糖原基因的调控。 展开更多
关键词 肝癌 癌基因 糖原 组织化学 原位杂交
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氟化物的诱变性 被引量:10
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作者 刘雨清 《国外医学(医学地理分册)》 北大核心 1996年第2期58-60,共3页
氟是人体所必需的元素,但过高或过低都将对人体产生有害影响。它是一种全身毒物质,除累及牙齿、骨以外,对多种组织及器官均有损害作用。它可以抑制细胞生长、抑制DNA和RNA合成,抑制多种酶的活性,并对细胞膜产生影响。近年来... 氟是人体所必需的元素,但过高或过低都将对人体产生有害影响。它是一种全身毒物质,除累及牙齿、骨以外,对多种组织及器官均有损害作用。它可以抑制细胞生长、抑制DNA和RNA合成,抑制多种酶的活性,并对细胞膜产生影响。近年来,随着氟研究的不断深入,引起人们更多重视的是氟是否具有致突变和致癌作用,此方面研究较多,但结果不一,仅就所能查阅到的文献做一简要评述。 展开更多
关键词 氟中毒 突变性 诱变性
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慢性肝炎的新分类 被引量:1
10
作者 刘雨清 纪小龙 《世界华人消化杂志》 CAS 1996年第1期33-33,共1页
任何疾病的分类和相应的术语都是随着人类对疾病的认识不断深入而不断更新的。由于慢性肝炎是我国的常见慢性病,大量的医疗文件和研究文章都存在着对慢性肝炎的分类和术语上的混乱,为了及时了解国外动态,有必要将目前的新认识予以介绍。... 任何疾病的分类和相应的术语都是随着人类对疾病的认识不断深入而不断更新的。由于慢性肝炎是我国的常见慢性病,大量的医疗文件和研究文章都存在着对慢性肝炎的分类和术语上的混乱,为了及时了解国外动态,有必要将目前的新认识予以介绍。 1 传统的类型 慢性肝炎是在第2次世界大战期间和之后被认识的,多数患者是欧洲东部、两部和南部前线的士兵,经过10多年研究后,第1个国际工作组在该地区汇集,并于1968年主要依据两种临床形态学表现提出了慢性肝炎的分类方法,称为慢性活动性肝炎(CAH)和慢性持续性肝炎(CPH),后来,又加上了第三种慢性小叶性肝炎(CLH)。 展开更多
关键词 肝炎 疾病分类 病毒
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眼脉络膜出血误诊为黑色素瘤的原因分析(附3例报告) 被引量:1
11
作者 刘雨清 黄文波 +2 位作者 张新潍 吴洪娟 孙永红 《潍坊医学院学报》 2002年第3期231-232,共2页
关键词 眼脉络膜 出血 误诊 黑色素瘤 病因
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肿瘤坏死因子α在系膜增生性肾小球肾炎中的表达及其在发病中的作用 被引量:1
12
作者 刘雨清 张伟栋 +3 位作者 吴洪娟 郭爱华 吕世军 刘海涛 《潍坊医学院学报》 2001年第4期308-309,W006,共3页
目的 探讨肿瘤坏死因子 (TNF α)在人系膜增生性肾小球肾炎中的表达及其在发病中的作用。方法 采用HE ,PAS ,PASM及免疫组织化学方法对 13例系膜增生性肾小球肾炎进行染色观察。结果 TNF α阳性反应见于肾近曲小管上皮细胞和肾小球... 目的 探讨肿瘤坏死因子 (TNF α)在人系膜增生性肾小球肾炎中的表达及其在发病中的作用。方法 采用HE ,PAS ,PASM及免疫组织化学方法对 13例系膜增生性肾小球肾炎进行染色观察。结果 TNF α阳性反应见于肾近曲小管上皮细胞和肾小球内 ,且阳性反应强度与HE ,PAS等显示的病变程度一致。结论 TNF 展开更多
关键词 系膜增生性肾小球炎 肿瘤坏死因子 免疫组织化学
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转化生长因子在人膜增生性肾小球肾炎中蛋白和mRNA基因表达
13
作者 刘雨清 张伟栋 +3 位作者 吴洪娟 郭爱华 姜红心 吕世军 《解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期408-410,共3页
关键词 转化生长因子 人膜增生性肾小球肾炎 蛋白 MRNA基因 表达
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转化生长因子-β蛋白及mRNA基因在人类系膜增生性肾小球肾炎中的表达
14
作者 刘雨清 张伟栋 +3 位作者 吴洪娟 郭爱华 姜红心 吕世军 《中国组织化学与细胞化学杂志》 CAS CSCD 2002年第1期51-54,共4页
目的 探讨转化生长因子 β(TGF- β)蛋白及 m RNA基因在系膜增生性肾小球肾炎中的表达及其在发病中的作用。方法 采用常规病理、免疫组织化学及原位杂交方法对人系膜增生性肾小球肾炎组织进行染色 ,并经医学图像分析系统进行分析。结... 目的 探讨转化生长因子 β(TGF- β)蛋白及 m RNA基因在系膜增生性肾小球肾炎中的表达及其在发病中的作用。方法 采用常规病理、免疫组织化学及原位杂交方法对人系膜增生性肾小球肾炎组织进行染色 ,并经医学图像分析系统进行分析。结果 在正常对照组 ,TGF- β蛋白及 TGF- β1m RNA于肾小管上皮细胞呈极微弱表达 ,肾小球内 TGF- β蛋白及m RNA未见阳性表达。在系膜增生性肾小球肾炎组织中 ,TGF- β蛋白在肾近曲小管上皮细胞胞浆内呈强阳性表达 ,肾小球球囊壁及系膜区呈阳性表达 ,肾小球与肾小管阳性表达与正常对照组相比均具有显著性差异 (P<0 .0 1)。TGF- β1m RNA阳性表达位于肾近曲小管上皮细胞胞浆内和肾小球系膜区 ,肾小球和肾小管上皮细胞 TGF- β1m RNA阳性表达与正常对照组相比差异也有显著性 (P<0 .0 1)。结论 系膜增生性肾小球肾炎时 TGF- β蛋白及 TGF- β1m RNA在肾小球与肾小管表达均显著增高 ,进一步显示 TGF- β在肾小球系膜细胞增生及肾小管间质纤维化中所起的重要作用。 展开更多
关键词 转化生长因子-Β 基因表达 系膜增生性肾小球肾炎 免疫组织化学 原位杂交
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男性乳腺导管内乳头状瘤癌变1例
15
作者 刘雨清 张伟栋 吴洪娟 《诊断病理学杂志》 CSCD 2001年第6期324-324,共1页
关键词 男性 乳腺导管内乳头状瘤 癌变 病理 诊断 治疗
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转化生长因子蛋白和mRNA在人膜性肾小球肾炎中的表达
16
作者 刘雨清 张伟栋 +3 位作者 吴洪娟 郭爱华 吕世军 姜红心 《中国中西医结合肾病杂志》 2002年第9期510-512,共3页
目的 :探讨转化生长因子 β(TGF - β)蛋白及mRNA基因在膜性肾小球肾炎中的表达及其在发病中的作用。方法 :采用常规病理、免疫组织化学及原位杂交方法对人膜性肾小球肾炎组织进行染色 ,并经医学图像分析系统进行分析。结果 :在正常对照... 目的 :探讨转化生长因子 β(TGF - β)蛋白及mRNA基因在膜性肾小球肾炎中的表达及其在发病中的作用。方法 :采用常规病理、免疫组织化学及原位杂交方法对人膜性肾小球肾炎组织进行染色 ,并经医学图像分析系统进行分析。结果 :在正常对照组 ,TGF - β蛋白及TGF - β1mRNA于肾小管上皮细胞呈极微弱表达 ,肾小球内TGF- β蛋白及mRNA未见阳性表达。在膜性肾小球肾炎组织中 ,TGF - β蛋白在肾小管上皮细胞胞浆内呈强阳性表达 ,肾小球呈阳性表达 ,肾小球与肾小管阳性表达与正常对照组相比 (P <0 .0 1) ,均具有显著性差异。TGF - β1mRNA阳性表达主要位于肾小管上皮细胞胞浆内 ,与正常对照组相比 ,有显著性差异 (P >0 .0 5 ) ;肾小球内弱阳性表达 ,与正常对照组相比 ,无显著性差异 (P >0 .0 5 )。结论 :膜性肾小球肾炎时TGF - β蛋白在肾小球与肾小管表达均显著增高 ,TGF - β1mRNA在肾小管表达增高 ,提高TGF - β在肾小球硬化及肾小管间质纤维化中起重要作用。 展开更多
关键词 膜性肾小球肾炎 转化生长因子-Β 免疫组织化学 原位杂交 图像分析
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肿瘤坏死因子-α在人膜性肾小球肾炎中的定量研究
17
作者 刘雨清 张伟栋 +3 位作者 吴洪娟 姜红心 郭爱华 吕世军 《中国体视学与图像分析》 2001年第4期217-219,共3页
探讨肿瘤坏死因子(TNF-α)在人膜性肾小球肾炎中的定量表达。采用免疫组织化学SABC法检测20例人的膜性肾小球肾炎穿刺标本中TNF-α的表达,并用计算机图像分析系统进行定量分析。发现TNF-α蛋白在肾组织内表达增加,阳性反应见于肾小管上... 探讨肿瘤坏死因子(TNF-α)在人膜性肾小球肾炎中的定量表达。采用免疫组织化学SABC法检测20例人的膜性肾小球肾炎穿刺标本中TNF-α的表达,并用计算机图像分析系统进行定量分析。发现TNF-α蛋白在肾组织内表达增加,阳性反应见于肾小管上皮细胞和肾小球内,以肾近曲小管上皮细胞阳性最明显,肾小球内呈程度不等的弱阳性,间质反应不明显。肾炎组肾小管阳性表达与正常组相比差异有显著性(p<0.01),表明TNF-α在肾小管的损伤和肾间质纤维化中起重要的介质作用。 展开更多
关键词 膜性肾小球肾炎 TNF-Α 免疫组织化学 图像分析
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2型糖尿病时血管内皮细胞的超微结构观察
18
作者 刘雨清 张伟栋 +2 位作者 吴洪娟 周风华 段文卓 《潍坊医学院学报》 2006年第6期454-455,共2页
目的观察2型糖尿病时大鼠胸主动脉内皮细胞的光镜及形态学变化,探讨其病变的发生机制。方法复制高糖、高脂血症动物模型,光镜及电镜下观察胸主动脉内皮细胞的病理变化。结果①高糖血症:光镜下见胸主动脉内皮细胞肿胀、肥胖,呈立方状,三... 目的观察2型糖尿病时大鼠胸主动脉内皮细胞的光镜及形态学变化,探讨其病变的发生机制。方法复制高糖、高脂血症动物模型,光镜及电镜下观察胸主动脉内皮细胞的病理变化。结果①高糖血症:光镜下见胸主动脉内皮细胞肿胀、肥胖,呈立方状,三五成群向腔面突出。内皮下纤维组织轻度增生。电镜下内皮细胞表面有破损及绒毛状突起,并见血浆蛋白附着物;细胞浆内有较正常明显增多的糖原颗粒,细胞浆内吞饮小泡增多。细胞核周池增宽。②高脂血症:光镜下见内皮细胞肿胀、肥胖,个别细胞向腔面呈出芽状生长。电镜下内皮细胞表面有指状突起,胞浆内见较大的吞饮泡,平滑肌细胞有向内膜下迁移的倾向。结论2型糖尿病的高糖及高脂可不同程度地损伤血管内皮细胞,是导致进一步血管病变的重要因素。 展开更多
关键词 大鼠 糖尿病 血管内皮细胞 超微结构 病理变化
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大肠癌AgNOR和肥大细胞的定量分析
19
作者 刘雨清 郭文君 +3 位作者 郭爱华 吴洪娟 张伟栋 黄文波 《潍坊医学院学报》 1999年第1期5-6,共2页
目的探讨AgNOR和肥大细胞与大肠癌诊断及分级的关系。方法对44例大肠癌,12例大肠腺瘤,16例癌旁粘膜做AgNOR计数及肥大细胞计数。结果AgNOR和肥大细胞计数在大肠腺瘤及腺癌间差异有显著性(P<0.01),Ag... 目的探讨AgNOR和肥大细胞与大肠癌诊断及分级的关系。方法对44例大肠癌,12例大肠腺瘤,16例癌旁粘膜做AgNOR计数及肥大细胞计数。结果AgNOR和肥大细胞计数在大肠腺瘤及腺癌间差异有显著性(P<0.01),AgNOR计数随大肠腺癌分化程度的降低而增多,两者呈负相关。肥大细胞计数随大肠癌分化程度的降低而降低,两者呈正相关。结论AgNOR和肥大细胞计数对大肠癌诊断。 展开更多
关键词 大肠癌 AGNOR 肥大细胞 诊断 预后
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核酸原位杂交检测尖锐湿疣的临床价值
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作者 刘雨清 吴洪娟 +2 位作者 张伟栋 黄文波 王建丽 《潍坊医学院学报》 1997年第2期106-107,共2页
目的提高尖锐湿疣的诊断正确率。方法选光镜下初诊尖锐湿疣病例13例,临床怀疑尖锐湿疣而光镜下不典型者8例,进行尖锐湿疣乳头状瘤病毒(HPV)6B/11型核酸原位杂交检测。结果光镜下初诊尖锐湿疣的13例中9例阳性,阳性率... 目的提高尖锐湿疣的诊断正确率。方法选光镜下初诊尖锐湿疣病例13例,临床怀疑尖锐湿疣而光镜下不典型者8例,进行尖锐湿疣乳头状瘤病毒(HPV)6B/11型核酸原位杂交检测。结果光镜下初诊尖锐湿疣的13例中9例阳性,阳性率为69%;光镜下不典型的8例中仅3例为阳性,阳性率为38%。结论仅以临床表现诊断尖锐湿疣正确率低,病理组织学检查结合核酸原位杂交检测是确诊尖锐湿疣有价值的方法。 展开更多
关键词 原位杂交 尖锐湿疣 乳头状瘤病毒
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