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千穗谷MTP基因家族生信分析及镉胁迫下的表达特征
1
作者
刘霄霏
甘锦鑫
+5 位作者
周涛
张伏中
刘宁芳
卢蕊
胡龙兴
徐倩
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期467-478,共12页
MTP(Metal tolerance protein)又称CDF(Cation diffusion facilitator),是与金属离子转运相关的一类蛋白。为了研究千穗谷(Amaranthus hypochondriacus L.)MTP基因家族的序列特征和进化关系,预测其不同成员的功能和调控机制,我们以最新...
MTP(Metal tolerance protein)又称CDF(Cation diffusion facilitator),是与金属离子转运相关的一类蛋白。为了研究千穗谷(Amaranthus hypochondriacus L.)MTP基因家族的序列特征和进化关系,预测其不同成员的功能和调控机制,我们以最新的千穗谷基因组为参考,鉴定出9个MTP家族成员,分为Zn-CDF(3个)、Zn/Fe-CDF(4个)、Mn-CDF(4个)3个亚族。所有家族成员均具有MTP转运蛋白的典型结构域Cation_efflux,部分成员还包含1个ZT_dimer结构域。染色体定位显示,9个MTP基因分布在7条染色体上。Cd胁迫下,AhMTP7和AhMTP9在根和叶中的表达均被抑制,AhMTP6在叶中被抑制,在根中却被诱导;其余6个MTP基因均受Cd诱导表达,AhMTP2、AhMTP3仅在叶中被诱导,AhMTP5仅在根中被诱导。顺式作用元件分析结果显示,AhMTP启动子中存在多个逆境响应、生长发育和激素信号的顺式作用元件。miRNA预测分析结果表明,15个miRNA靶向7个AhMTP成员。
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关键词
千穗谷
MTP
基因表达
金属胁迫
基因家族
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职称材料
外源硒对镉胁迫下黑麦草生长和生理的影响
被引量:
15
2
作者
刘霄霏
李惠英
+4 位作者
陈良
徐倩
胡龙兴
王慧彬
马向明
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期72-79,共8页
为明确外源硒对重金属镉胁迫下黑麦草(Lolium multiflorum)的影响,本研究以一年生黑麦草品种“杰威”(Lolium multiflorum‘Jiewei’)为试验材料,分析了施加0.05、0.1和1.0 mg·L-1硒对镉胁迫(60 mg·L-1)下黑麦草株高、根长、...
为明确外源硒对重金属镉胁迫下黑麦草(Lolium multiflorum)的影响,本研究以一年生黑麦草品种“杰威”(Lolium multiflorum‘Jiewei’)为试验材料,分析了施加0.05、0.1和1.0 mg·L-1硒对镉胁迫(60 mg·L-1)下黑麦草株高、根长、电导率(Electrolyte leakage,EL)、丙二醛(Malondialdehyde,MDA)含量、抗氧化酶活性及其基因表达的影响。结果表明:60 mg·L-1镉胁迫下黑麦草株高和根长显著(P<0.05)降低,EL和MDA含量显著升高,同时超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase,SOD)活性显著升高而过氧化物酶(Peroxidase,POD)活性显著降低,谷胱甘肽还原酶(Glutathione reductase,GR)、谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPX)、锰超氧化物歧化酶(Manganese superoxide dismutase,MnSOD)基因表达量显著下调,而过氧化物体抗坏血酸过氧化物酶(Peroxisomal ascorbate peroxidase,pAPX)和过氧化氢酶(Catalase,CAT)基因表达量则显著上升;施加外源硒后,镉胁迫得到缓解,在硒浓度为0.1 mg·L-1时,株高和根长缓解效果最明显,EL和MDA降低,SOD活性下降以及POD活性上升,抗氧化酶基因表达量也恢复至对照水平,表明施加适宜浓度外源硒可调节抗氧化能力,从而维持细胞膜稳定性和有效缓解镉胁迫对黑麦草的毒害现象,其中硒浓度为0.1 mg·L-1时效果最好。
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关键词
硒
镉胁迫
黑麦草
生长和生理
抗氧化酶
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职称材料
16份尾穗苋种质萌发期耐镉性综合评价
被引量:
5
3
作者
聂婷宇
朱依晗
+4 位作者
刘霄霏
向佐湘
刘宁芳
徐倩
胡龙兴
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2022年第5期66-72,共7页
以16份不同来源的尾穗苋基因型为材料,对0μmol/L(无菌水,CK)和80μmol/L镉胁迫下种子的发芽势、发芽率、发芽指数、活力指数、胚根长和胚芽长等指标进行分析,并采用隶属函数和聚类分析综合评价不同尾穗苋萌发期耐镉性。结果表明,镉胁...
以16份不同来源的尾穗苋基因型为材料,对0μmol/L(无菌水,CK)和80μmol/L镉胁迫下种子的发芽势、发芽率、发芽指数、活力指数、胚根长和胚芽长等指标进行分析,并采用隶属函数和聚类分析综合评价不同尾穗苋萌发期耐镉性。结果表明,镉胁迫对不同基因型尾穗苋种子萌发期各指标的影响不同。除Acd28外,镉胁迫对尾穗苋种子发芽势和发芽率无显著影响;除Acd132和Acd150外,镉胁迫对尾穗苋种子发芽指数无显著影响;镉胁迫显著降低了活力指数、根长以及大多数基因型的芽长。隶属函数值和聚类分析表明,16份尾穗苋可分为耐镉型、中间型和敏感型三类,分别占31.25%、56.25%和12.50%,其中Acd131、Acd134、Acd38、Acd138和Acd147萌发期耐镉能力较强,Acd28、Acd55耐镉能力较弱。
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关键词
尾穗苋
镉胁迫
萌发期
综合评价
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职称材料
题名
千穗谷MTP基因家族生信分析及镉胁迫下的表达特征
1
作者
刘霄霏
甘锦鑫
周涛
张伏中
刘宁芳
卢蕊
胡龙兴
徐倩
机构
湖南农业大学农学院草业科学系
湖南省环境保护科学研究院
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期467-478,共12页
基金
湖南省研究生创新项目(CX20200674)
湖南省教育厅项目(21A0126)
长沙市自然科学基金项目(kq2202228)。
文摘
MTP(Metal tolerance protein)又称CDF(Cation diffusion facilitator),是与金属离子转运相关的一类蛋白。为了研究千穗谷(Amaranthus hypochondriacus L.)MTP基因家族的序列特征和进化关系,预测其不同成员的功能和调控机制,我们以最新的千穗谷基因组为参考,鉴定出9个MTP家族成员,分为Zn-CDF(3个)、Zn/Fe-CDF(4个)、Mn-CDF(4个)3个亚族。所有家族成员均具有MTP转运蛋白的典型结构域Cation_efflux,部分成员还包含1个ZT_dimer结构域。染色体定位显示,9个MTP基因分布在7条染色体上。Cd胁迫下,AhMTP7和AhMTP9在根和叶中的表达均被抑制,AhMTP6在叶中被抑制,在根中却被诱导;其余6个MTP基因均受Cd诱导表达,AhMTP2、AhMTP3仅在叶中被诱导,AhMTP5仅在根中被诱导。顺式作用元件分析结果显示,AhMTP启动子中存在多个逆境响应、生长发育和激素信号的顺式作用元件。miRNA预测分析结果表明,15个miRNA靶向7个AhMTP成员。
关键词
千穗谷
MTP
基因表达
金属胁迫
基因家族
Keywords
Amaranthus hypochondriacus
MTP
Gene expression
Metal stress
Gene families
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
外源硒对镉胁迫下黑麦草生长和生理的影响
被引量:
15
2
作者
刘霄霏
李惠英
陈良
徐倩
胡龙兴
王慧彬
马向明
机构
湖南农业大学农学院草业科学系
中国科学院武汉植物园
东营市科技创新服务中心
出处
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期72-79,共8页
基金
长沙市重点研发计划(kq1801019)
湖南省自然科学基金(2018JJ3223)共同资助
文摘
为明确外源硒对重金属镉胁迫下黑麦草(Lolium multiflorum)的影响,本研究以一年生黑麦草品种“杰威”(Lolium multiflorum‘Jiewei’)为试验材料,分析了施加0.05、0.1和1.0 mg·L-1硒对镉胁迫(60 mg·L-1)下黑麦草株高、根长、电导率(Electrolyte leakage,EL)、丙二醛(Malondialdehyde,MDA)含量、抗氧化酶活性及其基因表达的影响。结果表明:60 mg·L-1镉胁迫下黑麦草株高和根长显著(P<0.05)降低,EL和MDA含量显著升高,同时超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase,SOD)活性显著升高而过氧化物酶(Peroxidase,POD)活性显著降低,谷胱甘肽还原酶(Glutathione reductase,GR)、谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPX)、锰超氧化物歧化酶(Manganese superoxide dismutase,MnSOD)基因表达量显著下调,而过氧化物体抗坏血酸过氧化物酶(Peroxisomal ascorbate peroxidase,pAPX)和过氧化氢酶(Catalase,CAT)基因表达量则显著上升;施加外源硒后,镉胁迫得到缓解,在硒浓度为0.1 mg·L-1时,株高和根长缓解效果最明显,EL和MDA降低,SOD活性下降以及POD活性上升,抗氧化酶基因表达量也恢复至对照水平,表明施加适宜浓度外源硒可调节抗氧化能力,从而维持细胞膜稳定性和有效缓解镉胁迫对黑麦草的毒害现象,其中硒浓度为0.1 mg·L-1时效果最好。
关键词
硒
镉胁迫
黑麦草
生长和生理
抗氧化酶
Keywords
Selenium
Cadmium stresses
Ryegrass
Growth and physiology
Antioxidant enzyme
分类号
S543.6 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
16份尾穗苋种质萌发期耐镉性综合评价
被引量:
5
3
作者
聂婷宇
朱依晗
刘霄霏
向佐湘
刘宁芳
徐倩
胡龙兴
机构
湖南农业大学农学院草业科学系
出处
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2022年第5期66-72,共7页
基金
湖南省教育厅项目(20C0934,21A0126)
湖南省研究生创新项目(CX20200674)
湖南省生态环境厅项目资助。
文摘
以16份不同来源的尾穗苋基因型为材料,对0μmol/L(无菌水,CK)和80μmol/L镉胁迫下种子的发芽势、发芽率、发芽指数、活力指数、胚根长和胚芽长等指标进行分析,并采用隶属函数和聚类分析综合评价不同尾穗苋萌发期耐镉性。结果表明,镉胁迫对不同基因型尾穗苋种子萌发期各指标的影响不同。除Acd28外,镉胁迫对尾穗苋种子发芽势和发芽率无显著影响;除Acd132和Acd150外,镉胁迫对尾穗苋种子发芽指数无显著影响;镉胁迫显著降低了活力指数、根长以及大多数基因型的芽长。隶属函数值和聚类分析表明,16份尾穗苋可分为耐镉型、中间型和敏感型三类,分别占31.25%、56.25%和12.50%,其中Acd131、Acd134、Acd38、Acd138和Acd147萌发期耐镉能力较强,Acd28、Acd55耐镉能力较弱。
关键词
尾穗苋
镉胁迫
萌发期
综合评价
Keywords
Amaranthus caudatus
Cadmium stress
Germination stage
Comprehensive evaluation
分类号
S54 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
千穗谷MTP基因家族生信分析及镉胁迫下的表达特征
刘霄霏
甘锦鑫
周涛
张伏中
刘宁芳
卢蕊
胡龙兴
徐倩
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
外源硒对镉胁迫下黑麦草生长和生理的影响
刘霄霏
李惠英
陈良
徐倩
胡龙兴
王慧彬
马向明
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
15
下载PDF
职称材料
3
16份尾穗苋种质萌发期耐镉性综合评价
聂婷宇
朱依晗
刘霄霏
向佐湘
刘宁芳
徐倩
胡龙兴
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2022
5
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职称材料
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