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脱水过程中无核白葡萄转录组测序及膜脂降解代谢中关键基因的筛选
1
作者
马紫荆
马金花
+2 位作者
常晨光
加依娜·牙森
黄文书
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2024年第2期81-90,共10页
该研究以吐鲁番地区无核白葡萄为试验材料,在25℃常温和30℃热风干燥后,取失水25%、50%时褐变和未褐变的样品。利用转录组测序技术筛选出膜脂降解代谢相关的关键基因,并利用实时荧光定量PCR技术对其进行验证,研究结果显示,转录组测序共...
该研究以吐鲁番地区无核白葡萄为试验材料,在25℃常温和30℃热风干燥后,取失水25%、50%时褐变和未褐变的样品。利用转录组测序技术筛选出膜脂降解代谢相关的关键基因,并利用实时荧光定量PCR技术对其进行验证,研究结果显示,转录组测序共获得了11.63亿的clean data,当无核白失水50%时未褐变与褐变的相比,在快速脱水组筛选出718个差异表达基因,慢速脱水组2259个。将上述基因进行GO功能富集和KEGG富集分析后,筛选出43个膜脂代谢相关的差异基因,归类于5种代谢途径。从已获得的差异基因中最终筛选出乙醛脱氢酶7B4(Aldehyde Dehydrogenase7B4,ALDH7B4)、双半乳糖甘油二酯合成酶1(Digalactose Diglycerol Synthetase1,DGD1)、脂氧合酶(Lipoxygenase,LOX)、磷脂磷酸水解酶2(Lipid Phosphate Phosphatase2,LPP2)、二酰基甘油激酶5(Diacylglycerol Kinase5,DGK5)、非特异性磷脂酶C4(Non-specific Phospholipase C4,NPC4)、磷脂酶Dα1(Phospholipase Dα1,PLDα1)7个膜脂代谢相关的关键基因,经qRT-PCR验证,基因表达趋势与转录组测序结果基本一致。结果表明,膜脂降解代谢相关基因表达量变化对无核白脱水褐变有一定影响。
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关键词
无核白
转录组测序
膜脂代谢
实时荧光定量
差异表达基因
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职称材料
题名
脱水过程中无核白葡萄转录组测序及膜脂降解代谢中关键基因的筛选
1
作者
马紫荆
马金花
常晨光
加依娜·牙森
黄文书
机构
新疆农业大学食品科学与药学学院
出处
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2024年第2期81-90,共10页
基金
国家自然科学基金地区科学基金项目(32060546)。
文摘
该研究以吐鲁番地区无核白葡萄为试验材料,在25℃常温和30℃热风干燥后,取失水25%、50%时褐变和未褐变的样品。利用转录组测序技术筛选出膜脂降解代谢相关的关键基因,并利用实时荧光定量PCR技术对其进行验证,研究结果显示,转录组测序共获得了11.63亿的clean data,当无核白失水50%时未褐变与褐变的相比,在快速脱水组筛选出718个差异表达基因,慢速脱水组2259个。将上述基因进行GO功能富集和KEGG富集分析后,筛选出43个膜脂代谢相关的差异基因,归类于5种代谢途径。从已获得的差异基因中最终筛选出乙醛脱氢酶7B4(Aldehyde Dehydrogenase7B4,ALDH7B4)、双半乳糖甘油二酯合成酶1(Digalactose Diglycerol Synthetase1,DGD1)、脂氧合酶(Lipoxygenase,LOX)、磷脂磷酸水解酶2(Lipid Phosphate Phosphatase2,LPP2)、二酰基甘油激酶5(Diacylglycerol Kinase5,DGK5)、非特异性磷脂酶C4(Non-specific Phospholipase C4,NPC4)、磷脂酶Dα1(Phospholipase Dα1,PLDα1)7个膜脂代谢相关的关键基因,经qRT-PCR验证,基因表达趋势与转录组测序结果基本一致。结果表明,膜脂降解代谢相关基因表达量变化对无核白脱水褐变有一定影响。
关键词
无核白
转录组测序
膜脂代谢
实时荧光定量
差异表达基因
Keywords
thompson seedless grapes
transcriptome sequencing
membrane lipid metabolism
real-time fluorescence quantification
differentially expressed gene
分类号
TS255.3 [轻工技术与工程—农产品加工及贮藏工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
脱水过程中无核白葡萄转录组测序及膜脂降解代谢中关键基因的筛选
马紫荆
马金花
常晨光
加依娜·牙森
黄文书
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2024
0
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