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参与胡杨异形叶发生的发育相关基因表达模式及作用
被引量:
5
1
作者
秦少伟
李才林
+5 位作者
郭忠忠
包亮红
姜仁军
张娜
刘占文
赵利峰
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期4785-4792,共8页
为了阐明胡杨异形叶发生的分子机制,本研究以胡杨披针形叶和宽卵形叶为材料,通过RNA-seq分析了上述两种叶形的基因表达谱,发现在胡杨异形中发生的4个时期中,共有3 991个基因在两种叶形中差异表达,利用权重基因共表达网络分析(WGCNA)发...
为了阐明胡杨异形叶发生的分子机制,本研究以胡杨披针形叶和宽卵形叶为材料,通过RNA-seq分析了上述两种叶形的基因表达谱,发现在胡杨异形中发生的4个时期中,共有3 991个基因在两种叶形中差异表达,利用权重基因共表达网络分析(WGCNA)发现一个含有583个基因的模块与叶形指数高度相关(r=0.93,p=0.004)。然后我们用Gene Ontology对这些基因的功能进行了注释和富集,发现其中有40个基因与发育密切相关。这40个基因的表达模式和功能分析表明,这些基因可以通过参与极性建成、细胞增殖、细胞生长、信号传导和代谢等生物学过程在胡杨异形叶发生中起重要作用。因此,我们的研究有助于进一步完善叶形发育的调控机制。
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关键词
胡杨
异形叶
发育相关基因
表达模式
作用
原文传递
题名
参与胡杨异形叶发生的发育相关基因表达模式及作用
被引量:
5
1
作者
秦少伟
李才林
郭忠忠
包亮红
姜仁军
张娜
刘占文
赵利峰
机构
塔里木大学生命科学学院
兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期4785-4792,共8页
基金
国家自然科学基金(No.31660298
No.31260275)
塔里木大学校长基金博士项目(TDZKBS201501)共同资助
文摘
为了阐明胡杨异形叶发生的分子机制,本研究以胡杨披针形叶和宽卵形叶为材料,通过RNA-seq分析了上述两种叶形的基因表达谱,发现在胡杨异形中发生的4个时期中,共有3 991个基因在两种叶形中差异表达,利用权重基因共表达网络分析(WGCNA)发现一个含有583个基因的模块与叶形指数高度相关(r=0.93,p=0.004)。然后我们用Gene Ontology对这些基因的功能进行了注释和富集,发现其中有40个基因与发育密切相关。这40个基因的表达模式和功能分析表明,这些基因可以通过参与极性建成、细胞增殖、细胞生长、信号传导和代谢等生物学过程在胡杨异形叶发生中起重要作用。因此,我们的研究有助于进一步完善叶形发育的调控机制。
关键词
胡杨
异形叶
发育相关基因
表达模式
作用
Keywords
Populus euphratica Oliv., Heteromorphic leaf, Gene related to development, Expression pattem, Function
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S792.11 [农业科学—林木遗传育种]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
参与胡杨异形叶发生的发育相关基因表达模式及作用
秦少伟
李才林
郭忠忠
包亮红
姜仁军
张娜
刘占文
赵利峰
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017
5
原文传递
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参考文献
引证文献
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