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香榧转录组测序及生物信息学基础分析 被引量:6
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作者 易官美 包燕春 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 2016年第1期19-24,共6页
香榧具有重要的经济价值,但其基因组信息相对匮乏,限制了其分子生物学和基因功能的研究。本文以不同组织的香榧作为研究对象,采用新一代高通量测序技术平台Illumina Hi Seq?2000对香榧转录组进行测序和数据分析,共得到37,349,086个read... 香榧具有重要的经济价值,但其基因组信息相对匮乏,限制了其分子生物学和基因功能的研究。本文以不同组织的香榧作为研究对象,采用新一代高通量测序技术平台Illumina Hi Seq?2000对香榧转录组进行测序和数据分析,共得到37,349,086个reads片段,总碱基数为4.35 G。利用组装软件,对获得的高质量序列进行组装,共得到104,636个Unigene,平均长度为784 nt,N50为1,702。将Unigene序列与公共数据库进行比对,28,766个Unigenes获得了注释。其中26,856个Unigene在NR蛋白数据库中获得注释,24,003个Unigenes在NT数据库中获得注释,21,401个Unigene在Swiss-Prot蛋白数据库中获得注释,16,137个Unigene在COG数据库中获得注释,11,410个Unigene在GO数据库中获得注释。根据KEGG注释信息,18,564个Unigene被划分到256个代谢途径中。SSR位点搜索发现,在4,217个Unigene中含有4,706个SSR位点。分析所获得的转录组数据,将为香榧功能基因的克隆,基因的表达,指纹图谱构建和分子标记辅助选育奠定基础。 展开更多
关键词 香榧 转录组 高通量测序 SSR
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家居插花
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作者 郑全超 林艺 +1 位作者 包燕春 邱迎君 《现代园艺》 2016年第3期64-66,共3页
随着人们生活水平的提高,插花艺术逐渐走进千家万户。插花不仅能提高人们的气质与修养,还能获得心灵与视觉的双重享受。本文对家居插花常见形式进行了分析,并以典型家居插花作品为范例,对家居插花常用的花材进行了介绍,为插花爱好者提... 随着人们生活水平的提高,插花艺术逐渐走进千家万户。插花不仅能提高人们的气质与修养,还能获得心灵与视觉的双重享受。本文对家居插花常见形式进行了分析,并以典型家居插花作品为范例,对家居插花常用的花材进行了介绍,为插花爱好者提供参考。 展开更多
关键词 家居 插花 花材
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