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新定义的可预测肝癌预后的焦亡相关lncRNA模型
1
作者
黄威
刘启
+5 位作者
陈流华
滕茶香
区喆建
刘韩笑
陈健聪
张昆松
《中华普通外科学文献(电子版)》
CAS
2023年第5期357-365,共9页
目的 通过构建细胞焦亡有关的长链非编码核糖核酸(lncRNA)模型,并在独立的肝细胞癌(HCC)患者队列中对其功能进行验证,从而进一步明确HCC中焦亡相关lncRNA的表达及其与预后的相关性。方法 使用癌症基因组图谱(TCGA)队列评估每个焦亡相关l...
目的 通过构建细胞焦亡有关的长链非编码核糖核酸(lncRNA)模型,并在独立的肝细胞癌(HCC)患者队列中对其功能进行验证,从而进一步明确HCC中焦亡相关lncRNA的表达及其与预后的相关性。方法 使用癌症基因组图谱(TCGA)队列评估每个焦亡相关lncRNA对生存的预后价值,以构建多基因特征。通过应用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归法,构建4种lncRNA模型,并将TCGA队列中的所有HCC患者分为低危组或高危组。结果 低危组HCC患者的生存可能性显著高于高危组。风险评分是预测HCC患者预后的独立因素。治疗药物(吉西他滨、多柔比星、丝裂霉素C和索拉非尼)敏感性和免疫细胞(肥大静息细胞、单核细胞、NK静息细胞、CD8+T细胞和M0巨噬细胞)表达量在两组患者之间差异有统计学意义(P<0.05)。基因本体论(GO)和京都基因与基因组大全(KEGG)的分析显示了两组间的差异性富集途径。差异性基因富集分析显示,针对Wnt/β-catenin信号通路有助于制定HCC患者的治疗策略。结论 本研究发现了与焦亡有关的lncRNA新模型,可作为HCC患者的独立预后指标,为制定可靠、精确的癌症治疗方案提供了全新的观点。
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关键词
肝细胞癌
预后
焦亡
长链非编码核糖核酸
癌症基因组图谱
原文传递
题名
新定义的可预测肝癌预后的焦亡相关lncRNA模型
1
作者
黄威
刘启
陈流华
滕茶香
区喆建
刘韩笑
陈健聪
张昆松
机构
中山大学附属第一医院肝胆胰外科中心
中山大学肿瘤防治中心
出处
《中华普通外科学文献(电子版)》
CAS
2023年第5期357-365,共9页
文摘
目的 通过构建细胞焦亡有关的长链非编码核糖核酸(lncRNA)模型,并在独立的肝细胞癌(HCC)患者队列中对其功能进行验证,从而进一步明确HCC中焦亡相关lncRNA的表达及其与预后的相关性。方法 使用癌症基因组图谱(TCGA)队列评估每个焦亡相关lncRNA对生存的预后价值,以构建多基因特征。通过应用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归法,构建4种lncRNA模型,并将TCGA队列中的所有HCC患者分为低危组或高危组。结果 低危组HCC患者的生存可能性显著高于高危组。风险评分是预测HCC患者预后的独立因素。治疗药物(吉西他滨、多柔比星、丝裂霉素C和索拉非尼)敏感性和免疫细胞(肥大静息细胞、单核细胞、NK静息细胞、CD8+T细胞和M0巨噬细胞)表达量在两组患者之间差异有统计学意义(P<0.05)。基因本体论(GO)和京都基因与基因组大全(KEGG)的分析显示了两组间的差异性富集途径。差异性基因富集分析显示,针对Wnt/β-catenin信号通路有助于制定HCC患者的治疗策略。结论 本研究发现了与焦亡有关的lncRNA新模型,可作为HCC患者的独立预后指标,为制定可靠、精确的癌症治疗方案提供了全新的观点。
关键词
肝细胞癌
预后
焦亡
长链非编码核糖核酸
癌症基因组图谱
Keywords
Hepatocellular carcinoma
Prognosis
Pyroptosis
lncRNA
TCGA
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
新定义的可预测肝癌预后的焦亡相关lncRNA模型
黄威
刘启
陈流华
滕茶香
区喆建
刘韩笑
陈健聪
张昆松
《中华普通外科学文献(电子版)》
CAS
2023
0
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