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题名细菌三维基因组学研究
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作者
田六
王旭婷
华康剑
马彬广
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机构
农业生物信息湖北省重点实验室农业微生物国家重点实验室华中农业大学信息学院
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出处
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2019年第17期1780-1790,共11页
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基金
国家自然科学基金(31570844)
中央高校基本科研业务费专项(2662016PY094)资助
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文摘
作为原核生物,细菌染色体结构的空间组织形式引起了日益广泛的研究兴趣.近年来发展起来的染色体构象捕获和超分辨率显微镜技术,为细菌三维基因组的研究提供了强大的工具.基于染色体构象捕获测序数据,研究人员开发了通用的数据处理流程和染色体三维结构重构软件.目前,已有5个重要的细菌模式物种进行了初步的三维基因组研究,获得了细菌染色体空间组织特征的一些知识,揭示了拟核相关蛋白在细菌三维基因组结构中的重要性,并发现了细菌染色体三维结构与基因转录和细胞周期等过程之间的关联,加深了人们对于细菌三维基因组的认知.本文对近年来细菌三维基因组方面的研究进展进行简要的综述,并指出该领域未来值得关注的一些研究方向.
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关键词
微生物
染色体结构
超分辨率显微术
Hi-C
系统生物学
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Keywords
microorganisms
chromosome structure
super-resolution microscopy
Hi-C
systems biology
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分类号
Q933
[生物学—微生物学]
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