对流实时荧光定量PCR系统设计

设计了一种结合实时荧光定量技术和自然对流技术的PCR系统.主要介绍该系统的双通道荧光激发与检测结构及其工作原理,系统中使用光纤作为光路的传输媒介,采用电荷耦合元件(CCD)工业相机采集荧光信号变化,并自行设计电路和软件驱动整套系统正常运行.最后通过对梯度稀释的巨细胞病毒(CMV)的基因模板进行扩增,展示了该系统可用于快速扩增和实时定量检测的潜力.

PSO+:基于粒子群结合其他迭代算法非线性拟合热对流聚合酶连锁反应的荧光数据

热对流聚合酶连锁反应(CCPCR)利用热对流的原理,让试剂在试管内流动,通过试管上下部分的温度差来达到扩增目的。为了实时检测扩增效果,我们在试剂体系中加入了荧光基团,通过荧光的强弱实时反映扩增的情况。实验结果显示荧光变化曲线符合扩增曲线的S型趋势,但是由于热对流的不稳定性而存在一定的抖动情况,不利于扩增循环阈值(CT值)的计算。为了解决这个问题,本文采用动力学方法,利用双S型函数模型来拟合曲线,使荧光曲线平滑,从而能更好地根据曲线来推断核酸初始浓度,达到定量的目的。同时采用PSO+算法求解双S型函数参数,即用粒子群优化(PSO)算法结合Levenberg-Marquardt、Newton-CG等算法进行曲线拟合,有效克服PSO随机性太强和传统算法Levenberg-Marquardt、Newton-CG等容易陷入局部最优解的缺点,数据拟合结果的R2能够达到0.999 8。此研究对以后的实时荧光热对流扩增的定量检测研究有指导性意义。

HIV核酸检测技术应用现状及前景

艾滋病的广泛传播给社会造成了极大负担。目前艾滋病的防治工作主要是控制和切断艾滋病病毒(HIV)的传播,这就要求普及艾滋病的检测,以尽早地发现感染者。相较于其他的HIV检测方法,核酸检测的窗口期短,灵敏度、特异性高,在临床上可用于艾滋病的早期诊断,通过测定HIV血浆病毒载量预测疾病进程,评价抗反转录病毒治疗效果。根据资源特点和患者需求等因素,可将HIV核酸检测的应用场景划分为大型医院、基层医疗机构及家庭检测。本文综述了HIV核酸检测的不同应用场景及对应检测方法,并对HIV核酸检测的应用前景做了展望。