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利用发根农杆菌体系检测大豆CRISPR/Cas9系统的靶点
1
作者
熊艳萍
许崇晶
+1 位作者
单金明
赵琳
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期161-170,共10页
作为一种基因编辑的新技术,CRISPR/Cas系统已被广泛应用于各种生物的基因工程中。但CRISPR/Cas9基因编辑系统还存在着一定的脱靶现象,确定基因编辑靶点选择的可行性可提高基因编辑效率。本研究选用大豆GmCO基因为靶标,使用CRISPR/Cas9...
作为一种基因编辑的新技术,CRISPR/Cas系统已被广泛应用于各种生物的基因工程中。但CRISPR/Cas9基因编辑系统还存在着一定的脱靶现象,确定基因编辑靶点选择的可行性可提高基因编辑效率。本研究选用大豆GmCO基因为靶标,使用CRISPR/Cas9基因编辑系统来构建靶点的基因敲除载体,并且利用发根农杆菌K599菌株对大豆子叶进行侵染,再通过植物组织培养的方法促使大豆外植体长出不定根,通过不定根检测发现在靶点2处出现了碱基的缺失,说明成功实现了对大豆目标基因的编辑。此方法操作简单,周期短,实现了对大豆中选择靶点的可行性的快速鉴定,为研究大豆的GmCO基因功能和遗传改良方面提供了新的技术支持。
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关键词
大豆
CRISPR/Cas9系统
发根农杆菌
基因敲除
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职称材料
基于ADRC的船舶航向控制器设计与仿真研究
被引量:
10
2
作者
周风余
单金明
+2 位作者
王伟
陈景帅
阮久宏
《山东大学学报(工学版)》
CAS
北大核心
2009年第1期57-62,76,共7页
船舶航向运动系统具有典型的非线性和不确定性,并受到自动舵执行能力的约束以及风、浪、流等的干扰,使得航向控制器的设计非常困难.针对以上问题给出了带有舵机约束的船舶运动非线性数学模型以及海浪扰动数学模型,对ADRC的原理进行了简...
船舶航向运动系统具有典型的非线性和不确定性,并受到自动舵执行能力的约束以及风、浪、流等的干扰,使得航向控制器的设计非常困难.针对以上问题给出了带有舵机约束的船舶运动非线性数学模型以及海浪扰动数学模型,对ADRC的原理进行了简要介绍,设计出了船舶航向ADRC控制器.仿真结果表明该控制器对于船舶航向运动的非线性、参数不确定性、环境不确定性以及控制对象的模型变化均有较强的鲁棒性,航向切换控制过程快速、平滑,操舵量小,可以实现高精度的航向保持控制.
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关键词
船舶非线性系统模型
航向控制器
ADRC
原文传递
肉桂酸衍生物对铜绿假单胞菌PAO1 Ⅲ型分泌系统的影响
被引量:
1
3
作者
单金明
吴小刚
+4 位作者
袁小琛
方力为
梁翠荣
陈新
YANG Ching-Hong
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第10期2061-2069,共9页
【目的】铜绿假单胞菌是引起医院获得性感染最常见的条件致病菌,而Ⅲ型分泌系统(Type Ⅲ secretion system,TTSS)是其致病的主要因子之一。本文从合成的21个肉桂酸衍生物中筛选影响TTSS效应子(Effector)产生的化合物,并初步研究其作用...
【目的】铜绿假单胞菌是引起医院获得性感染最常见的条件致病菌,而Ⅲ型分泌系统(Type Ⅲ secretion system,TTSS)是其致病的主要因子之一。本文从合成的21个肉桂酸衍生物中筛选影响TTSS效应子(Effector)产生的化合物,并初步研究其作用机制。【方法】将TTSS效应子合成基因exoS的转录报告质粒pAT-exoS转入菌株PAO1中,获得PAO1(pAT-exoS)。待筛选的化合物与PAO1(pAT-exoS)菌株共培养6 h后,检测exoS基因的表达,从中筛选影响exoS基因表达的化合物。【结果】筛选结果表明:21个化合物中,3个化合物抑制exoS基因表达,2个化合物则促进exoS基因表达。此外,化合物TS128、TS143和TS160对菌株生长有明显的抑制作用。Western blot实验进一步证实筛选得到的化合物TS108、TS128和TS165可抑制ExoS的产生;化合物TS139和TS143则促进ExoS的产生。为进一步研究抑制剂的作用机理,过量表达TTSS主要的调控因子exsA基因可部分消除抑制剂TS108和TS165的抑制效果;而rsmZ rsmY双基因突变体PAO6421中添加抑制剂TS108和TS165并不能显著抑制exoS基因的表达,同样,抑制剂TS108和TS165也不影响受Gac/Rsm信号传导系统调控的群体感应信号分子的产生。【结论】抑制剂TS108和TS165的作用机制可能主要是影响esxA基因,从而影响exoS基因表达及蛋白产量。
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关键词
PSEUDOMONAS
AERUGINOSA
ExoS
抑制剂
诱导剂
Ⅲ型分泌系统
原文传递
题名
利用发根农杆菌体系检测大豆CRISPR/Cas9系统的靶点
1
作者
熊艳萍
许崇晶
单金明
赵琳
机构
东北农业大学大豆研究所
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期161-170,共10页
基金
国家自然科学基金面上项目(31771820、32072086)
高产养分高效利用转基因大豆新品种培育(2016ZX08004-005)
黑龙江省自然科学基金重点项目(ZD2020C002)。
文摘
作为一种基因编辑的新技术,CRISPR/Cas系统已被广泛应用于各种生物的基因工程中。但CRISPR/Cas9基因编辑系统还存在着一定的脱靶现象,确定基因编辑靶点选择的可行性可提高基因编辑效率。本研究选用大豆GmCO基因为靶标,使用CRISPR/Cas9基因编辑系统来构建靶点的基因敲除载体,并且利用发根农杆菌K599菌株对大豆子叶进行侵染,再通过植物组织培养的方法促使大豆外植体长出不定根,通过不定根检测发现在靶点2处出现了碱基的缺失,说明成功实现了对大豆目标基因的编辑。此方法操作简单,周期短,实现了对大豆中选择靶点的可行性的快速鉴定,为研究大豆的GmCO基因功能和遗传改良方面提供了新的技术支持。
关键词
大豆
CRISPR/Cas9系统
发根农杆菌
基因敲除
Keywords
soybean
CRISPR/Cas9 system
Agrobacterium rhizogenes
gene knockout
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
基于ADRC的船舶航向控制器设计与仿真研究
被引量:
10
2
作者
周风余
单金明
王伟
陈景帅
阮久宏
机构
山东大学控制科学与工程学院
出处
《山东大学学报(工学版)》
CAS
北大核心
2009年第1期57-62,76,共7页
基金
山东省自然科学基金资助项目(Y2007G36)
山东省信息产业发展专项课题资助项目(2006R01003)
文摘
船舶航向运动系统具有典型的非线性和不确定性,并受到自动舵执行能力的约束以及风、浪、流等的干扰,使得航向控制器的设计非常困难.针对以上问题给出了带有舵机约束的船舶运动非线性数学模型以及海浪扰动数学模型,对ADRC的原理进行了简要介绍,设计出了船舶航向ADRC控制器.仿真结果表明该控制器对于船舶航向运动的非线性、参数不确定性、环境不确定性以及控制对象的模型变化均有较强的鲁棒性,航向切换控制过程快速、平滑,操舵量小,可以实现高精度的航向保持控制.
关键词
船舶非线性系统模型
航向控制器
ADRC
Keywords
ship nonlinear model
course tracking controler
active disturbance rejection controller(ADRC)
分类号
TP273 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
原文传递
题名
肉桂酸衍生物对铜绿假单胞菌PAO1 Ⅲ型分泌系统的影响
被引量:
1
3
作者
单金明
吴小刚
袁小琛
方力为
梁翠荣
陈新
YANG Ching-Hong
机构
常州大学制药与生命科学学院
Department of Biological Sciences
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第10期2061-2069,共9页
基金
国家自然科学基金面上项目(No.21272029)
文摘
【目的】铜绿假单胞菌是引起医院获得性感染最常见的条件致病菌,而Ⅲ型分泌系统(Type Ⅲ secretion system,TTSS)是其致病的主要因子之一。本文从合成的21个肉桂酸衍生物中筛选影响TTSS效应子(Effector)产生的化合物,并初步研究其作用机制。【方法】将TTSS效应子合成基因exoS的转录报告质粒pAT-exoS转入菌株PAO1中,获得PAO1(pAT-exoS)。待筛选的化合物与PAO1(pAT-exoS)菌株共培养6 h后,检测exoS基因的表达,从中筛选影响exoS基因表达的化合物。【结果】筛选结果表明:21个化合物中,3个化合物抑制exoS基因表达,2个化合物则促进exoS基因表达。此外,化合物TS128、TS143和TS160对菌株生长有明显的抑制作用。Western blot实验进一步证实筛选得到的化合物TS108、TS128和TS165可抑制ExoS的产生;化合物TS139和TS143则促进ExoS的产生。为进一步研究抑制剂的作用机理,过量表达TTSS主要的调控因子exsA基因可部分消除抑制剂TS108和TS165的抑制效果;而rsmZ rsmY双基因突变体PAO6421中添加抑制剂TS108和TS165并不能显著抑制exoS基因的表达,同样,抑制剂TS108和TS165也不影响受Gac/Rsm信号传导系统调控的群体感应信号分子的产生。【结论】抑制剂TS108和TS165的作用机制可能主要是影响esxA基因,从而影响exoS基因表达及蛋白产量。
关键词
PSEUDOMONAS
AERUGINOSA
ExoS
抑制剂
诱导剂
Ⅲ型分泌系统
Keywords
Pseudomonas aeruginosa
ExoS
Inhibitor
Inductor
Type Ⅲ secretion system
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用发根农杆菌体系检测大豆CRISPR/Cas9系统的靶点
熊艳萍
许崇晶
单金明
赵琳
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
下载PDF
职称材料
2
基于ADRC的船舶航向控制器设计与仿真研究
周风余
单金明
王伟
陈景帅
阮久宏
《山东大学学报(工学版)》
CAS
北大核心
2009
10
原文传递
3
肉桂酸衍生物对铜绿假单胞菌PAO1 Ⅲ型分泌系统的影响
单金明
吴小刚
袁小琛
方力为
梁翠荣
陈新
YANG Ching-Hong
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
原文传递
已选择
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